RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000167462.9

LLGL2-201, Transcript of LLGL2, scribble cell polarity complex component, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LLGL2, Length 3,480 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LLGL2-201ENST00000167462 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
LLGL2-201ENST00000167462 ARAP1Q96P48 1450 aa24.47■■□□□ 1.51
LLGL2-201ENST00000167462 WDR62O43379 1518 aa24.46■■□□□ 1.51
LLGL2-201ENST00000167462 FHAD1B1AJZ9 1412 aa24.44■■□□□ 1.5
LLGL2-201ENST00000167462 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa24.44■■□□□ 1.5
LLGL2-201ENST00000167462 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa24.44■■□□□ 1.5
LLGL2-201ENST00000167462 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
LLGL2-201ENST00000167462 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
LLGL2-201ENST00000167462 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
LLGL2-201ENST00000167462 HRCP23327 699 aa24.33■■□□□ 1.48
LLGL2-201ENST00000167462 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa24.33■■□□□ 1.48
LLGL2-201ENST00000167462 JPH4Q96JJ6 628 aa24.31■■□□□ 1.48
LLGL2-201ENST00000167462 CUL7Q14999 1698 aa24.31■■□□□ 1.48
LLGL2-201ENST00000167462 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
LLGL2-201ENST00000167462 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
LLGL2-201ENST00000167462 MTUS2Q5JR59 1369 aa24.23■■□□□ 1.47
LLGL2-201ENST00000167462 WDR97A6NE52 1622 aa24.21■■□□□ 1.47
LLGL2-201ENST00000167462 GRIN2AQ12879 1464 aa24.18■■□□□ 1.46
LLGL2-201ENST00000167462 FMN1Q68DA7 1419 aa24.17■■□□□ 1.46
LLGL2-201ENST00000167462 PBRM1Q86U86 1689 aa24.17■■□□□ 1.46
LLGL2-201ENST00000167462 SYNJ2O15056 1496 aa24.15■■□□□ 1.46
LLGL2-201ENST00000167462 ADAMTS12P58397 1594 aa24.14■■□□□ 1.46
LLGL2-201ENST00000167462 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
LLGL2-201ENST00000167462 IQGAP2Q13576 1575 aa24.08■■□□□ 1.44
LLGL2-201ENST00000167462 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa24.07■■□□□ 1.44
LLGL2-201ENST00000167462 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa24.06■■□□□ 1.44
LLGL2-201ENST00000167462 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
LLGL2-201ENST00000167462 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
LLGL2-201ENST00000167462 EFCAB5A4FU69 1503 aa24.02■■□□□ 1.44
LLGL2-201ENST00000167462 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa24.01■■□□□ 1.43
LLGL2-201ENST00000167462 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa23.98■■□□□ 1.43
LLGL2-201ENST00000167462 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
LLGL2-201ENST00000167462 CHIC2Q9UKJ5 165 aa23.97■■□□□ 1.43
LLGL2-201ENST00000167462 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP23.97■■□□□ 1.43
LLGL2-201ENST00000167462 CCNB3Q8WWL7 1395 aa23.97■■□□□ 1.43
LLGL2-201ENST00000167462 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP23.96■■□□□ 1.43
LLGL2-201ENST00000167462 KCNH8Q96L42 1107 aa23.96■■□□□ 1.43
LLGL2-201ENST00000167462 PLEKHD1A6NEE1 506 aa23.94■■□□□ 1.42
LLGL2-201ENST00000167462 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa23.92■■□□□ 1.42
LLGL2-201ENST00000167462 PTPRGP23470 1445 aa23.92■■□□□ 1.42
LLGL2-201ENST00000167462 PHLDB1Q86UU1 1377 aa23.91■■□□□ 1.42
LLGL2-201ENST00000167462 FYCO1Q9BQS8 1478 aa23.9■■□□□ 1.42
LLGL2-201ENST00000167462 OSCARQ8IYS5 282 aa23.89■■□□□ 1.41
LLGL2-201ENST00000167462 CEP170Q5SW79 1584 aa23.87■■□□□ 1.41
LLGL2-201ENST00000167462 TIAM1Q13009 1591 aa23.87■■□□□ 1.41
LLGL2-201ENST00000167462 PLB1Q6P1J6 1458 aa23.85■■□□□ 1.41
LLGL2-201ENST00000167462 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP23.84■■□□□ 1.41
LLGL2-201ENST00000167462 NUP160Q12769 1436 aa23.83■■□□□ 1.41
LLGL2-201ENST00000167462 DISP1Q96F81 1524 aa23.81■■□□□ 1.4
LLGL2-201ENST00000167462 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa23.8■■□□□ 1.4
LLGL2-201ENST00000167462 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP23.79■■□□□ 1.4
LLGL2-201ENST00000167462 UGGT2Q9NYU1 1516 aa23.78■■□□□ 1.4
LLGL2-201ENST00000167462 SAMD9Q5K651 1589 aa23.76■■□□□ 1.39
LLGL2-201ENST00000167462 TRIM52Q96A61 297 aa23.75■■□□□ 1.39
LLGL2-201ENST00000167462 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP23.75■■□□□ 1.39
LLGL2-201ENST00000167462 MYT1LQ9UL68 1186 aa23.73■■□□□ 1.39
LLGL2-201ENST00000167462 KIAA0556O60303 1618 aa23.72■■□□□ 1.39
LLGL2-201ENST00000167462 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP23.71■■□□□ 1.39
LLGL2-201ENST00000167462 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP23.71■■□□□ 1.39
LLGL2-201ENST00000167462 NCOA2Q15596 1464 aa23.7■■□□□ 1.38
LLGL2-201ENST00000167462 NEUROD1Q13562 356 aa23.7■■□□□ 1.38
LLGL2-201ENST00000167462 CHD1O14646 1710 aa23.68■■□□□ 1.38
LLGL2-201ENST00000167462 CCDC18Q5T9S5 1454 aa23.67■■□□□ 1.38
LLGL2-201ENST00000167462 HECW1Q76N89 1606 aa23.65■■□□□ 1.38
LLGL2-201ENST00000167462 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
LLGL2-201ENST00000167462 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
LLGL2-201ENST00000167462 FGD6Q6ZV73 1430 aa23.63■■□□□ 1.37
LLGL2-201ENST00000167462 CYB5RLQ6IPT4 315 aa23.62■■□□□ 1.37
LLGL2-201ENST00000167462 MAP3K1Q13233 1512 aa23.62■■□□□ 1.37
LLGL2-201ENST00000167462 MYOM3Q5VTT5 1437 aa23.6■■□□□ 1.37
LLGL2-201ENST00000167462 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa23.58■■□□□ 1.37
LLGL2-201ENST00000167462 UACAQ9BZF9 1416 aa23.55■■□□□ 1.36
LLGL2-201ENST00000167462 ERCC6L2Q5T890 1561 aa23.55■■□□□ 1.36
LLGL2-201ENST00000167462 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa23.55■■□□□ 1.36
LLGL2-201ENST00000167462 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa23.54■■□□□ 1.36
LLGL2-201ENST00000167462 TSPY4P0CV99 314 aa23.53■■□□□ 1.36
LLGL2-201ENST00000167462 TSPY10P0CW01 314 aa23.53■■□□□ 1.36
LLGL2-201ENST00000167462 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP23.53■■□□□ 1.368e-7■□□□□ 9.8
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LLGL2-201ENST00000167462 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.35
LLGL2-201ENST00000167462 SETD5Q9C0A6 1442 aa23.52■■□□□ 1.35
LLGL2-201ENST00000167462 ATP10BO94823 1461 aa23.5■■□□□ 1.35
LLGL2-201ENST00000167462 CFAP43Q8NDM7 1665 aa23.5■■□□□ 1.35
LLGL2-201ENST00000167462 SIN3AQ96ST3 1273 aa23.47■■□□□ 1.35
LLGL2-201ENST00000167462 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
LLGL2-201ENST00000167462 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
LLGL2-201ENST00000167462 ARHGEF11O15085 1522 aa23.4■■□□□ 1.34
LLGL2-201ENST00000167462 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP23.4■■□□□ 1.341e-6■□□□□ 10.5
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LLGL2-201ENST00000167462 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa23.37■■□□□ 1.33
LLGL2-201ENST00000167462 PTPRKQ15262 1439 aa23.36■■□□□ 1.33
LLGL2-201ENST00000167462 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa23.34■■□□□ 1.33
LLGL2-201ENST00000167462 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
LLGL2-201ENST00000167462 PTPN23Q9H3S7 1636 aa23.3■■□□□ 1.32
LLGL2-201ENST00000167462 ABCA8O94911 1581 aa23.3■■□□□ 1.32
LLGL2-201ENST00000167462 MIA2Q96PC5 1412 aa23.3■■□□□ 1.32
LLGL2-201ENST00000167462 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
LLGL2-201ENST00000167462 KIF14Q15058 1648 aa23.26■■□□□ 1.31
LLGL2-201ENST00000167462 CLASP1Q7Z460 1538 aa23.25■■□□□ 1.31
LLGL2-201ENST00000167462 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP23.24■■□□□ 1.31
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