RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000167462.9

LLGL2-201, Transcript of LLGL2, scribble cell polarity complex component, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LLGL2, Length 3,480 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LLGL2-201ENST00000167462 NISCHQ9Y2I1 1504 aa34.96■■■■□ 3.19
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LLGL2-201ENST00000167462 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa29.79■■■□□ 2.36
LLGL2-201ENST00000167462 ABCC9O60706 1549 aa29.43■■■□□ 2.3
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LLGL2-201ENST00000167462 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP26.84■■□□□ 1.89
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LLGL2-201ENST00000167462 CSRNP3Q8WYN3 585 aa25.75■■□□□ 1.71
LLGL2-201ENST00000167462 SOGA1O94964 1423 aa25.74■■□□□ 1.71
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LLGL2-201ENST00000167462 SYNJ1O43426 1573 aa25.51■■□□□ 1.67
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LLGL2-201ENST00000167462 PDS5BQ9NTI5 1447 aa25.4■■□□□ 1.66
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LLGL2-201ENST00000167462 GOLGA3Q08378 1498 aa25.17■■□□□ 1.62
LLGL2-201ENST00000167462 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa25.15■■□□□ 1.62
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LLGL2-201ENST00000167462 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa25.11■■□□□ 1.61
LLGL2-201ENST00000167462 TOPBP1Q92547 1522 aa25.11■■□□□ 1.61
LLGL2-201ENST00000167462 TNIKQ9UKE5 1360 aa25.08■■□□□ 1.61
LLGL2-201ENST00000167462 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa25.04■■□□□ 1.6
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LLGL2-201ENST00000167462 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa25■■□□□ 1.59
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LLGL2-201ENST00000167462 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa24.9■■□□□ 1.58
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LLGL2-201ENST00000167462 ARID3CA6NKF2 412 aa24.77■■□□□ 1.56
LLGL2-201ENST00000167462 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa24.75■■□□□ 1.55
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LLGL2-201ENST00000167462 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
LLGL2-201ENST00000167462 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP24.64■■□□□ 1.54
LLGL2-201ENST00000167462 ITGAEP38570 1179 aa24.62■■□□□ 1.53
LLGL2-201ENST00000167462 ERICH3Q5RHP9 1530 aa24.59■■□□□ 1.53
LLGL2-201ENST00000167462 IFT140Q96RY7 1462 aa24.58■■□□□ 1.53
LLGL2-201ENST00000167462 VPS8Q8N3P4 1428 aa24.56■■□□□ 1.52
LLGL2-201ENST00000167462 GRIN2BQ13224 1484 aa24.51■■□□□ 1.51
LLGL2-201ENST00000167462 FHOD3Q2V2M9 1422 aa24.51■■□□□ 1.51
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