Protein–RNA interactions for Protein: P52272

HNRNPM, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein M, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNRNPMP52272 CYP51A1-203ENST00000435873 556 ntTSL 44.06□□□□□ -1.762e-12■■■■■ 140.8
HNRNPMP52272 CTDSPL2-209ENST00000560620 863 ntTSL 320.39■□□□□ 0.852e-13■■■■■ 135.8
HNRNPMP52272 CTDSPL2-211ENST00000561189 742 ntTSL 53.94□□□□□ -1.782e-13■■■■■ 135.8
HNRNPMP52272 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.192e-13■■■■■ 135.8
HNRNPMP52272 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.636e-9■■■■■ 120.8
HNRNPMP52272 LRRD1-202ENST00000422722 3511 ntTSL 214.41□□□□□ -0.16e-9■■■■■ 120.8
HNRNPMP52272 CYP51A1-204ENST00000450723 1729 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.676e-9■■■■■ 120.8
HNRNPMP52272 CPM-203ENST00000546556 697 ntTSL 28.94□□□□□ -0.983e-122■■■■■ 119.7
HNRNPMP52272 AC025423.4-201ENST00000553141 785 ntTSL 3 BASIC8.25□□□□□ -1.093e-122■■■■■ 119.7
HNRNPMP52272 CPM-213ENST00000551897 655 ntTSL 57.23□□□□□ -1.253e-122■■■■■ 119.7
HNRNPMP52272 GPI-212ENST00000589985 1516 ntTSL 328.86■■■□□ 2.213e-19■■■■■ 113.1
HNRNPMP52272 UHRF2-205ENST00000468435 3723 ntTSL 1 (best)20.64■□□□□ 0.895e-24■■■■■ 95.1
HNRNPMP52272 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.85e-24■■■■■ 95.1
HNRNPMP52272 UHRF2-207ENST00000477183 786 ntTSL 38.07□□□□□ -1.125e-24■■■■■ 95.1
HNRNPMP52272 UHRF2-211ENST00000484159 3112 ntTSL 25.98□□□□□ -1.455e-24■■■■■ 95.1
HNRNPMP52272 UHRF2-212ENST00000485617 3460 ntTSL 1 (best)5.53□□□□□ -1.525e-24■■■■■ 95.1
HNRNPMP52272 CUL4A-208ENST00000474116 866 ntTSL 228.52■■■□□ 2.161e-8■■■■■ 91.7
HNRNPMP52272 CUL4A-211ENST00000498562 790 ntTSL 341.7■■■■■ 4.271e-8■■■■■ 89.9
HNRNPMP52272 CUL4A-205ENST00000463426 893 ntTSL 340.09■■■■■ 4.011e-8■■■■■ 89.9
HNRNPMP52272 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.581e-8■■■■■ 89.9
HNRNPMP52272 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC36.79■■■■□ 3.481e-8■■■■■ 89.9
HNRNPMP52272 CUL4A-210ENST00000494985 292 ntTSL 536.26■■■■□ 3.41e-8■■■■■ 89.9
HNRNPMP52272 CUL4A-204ENST00000451881 3724 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.731e-8■■■■■ 89.9
HNRNPMP52272 CUL4A-203ENST00000375441 4037 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.371e-8■■■■■ 89.9
HNRNPMP52272 CUL4A-201ENST00000326335 3705 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.011e-8■■■■■ 89.9
HNRNPMP52272 CUL4A-212ENST00000617546 5666 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.421e-8■■■■■ 89.9
HNRNPMP52272 PTMA-206ENST00000412128 863 ntTSL 339.2■■■■□ 3.873e-34■■■■■ 88.1
HNRNPMP52272 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.223e-34■■■■■ 88.1
HNRNPMP52272 PTMA-210ENST00000467816 378 ntTSL 220.62■□□□□ 0.893e-34■■■■■ 88.1
HNRNPMP52272 GPI-204ENST00000586392 1706 ntTSL 222.99■■□□□ 1.272e-30■■■■■ 85.9
HNRNPMP52272 RANBP10-208ENST00000602887 683 ntTSL 340.88■■■■■ 4.136e-7■■■■■ 83
HNRNPMP52272 RANBP10-205ENST00000602638 1248 ntTSL 240.8■■■■■ 4.126e-7■■■■■ 83
HNRNPMP52272 RANBP10-207ENST00000602815 577 ntTSL 440.8■■■■■ 4.126e-7■■■■■ 83
HNRNPMP52272 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.566e-7■■■■■ 83
HNRNPMP52272 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.556e-7■■■■■ 83
HNRNPMP52272 RANBP10-203ENST00000602506 2756 ntTSL 225.26■■□□□ 1.636e-7■■■■■ 83
HNRNPMP52272 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.336e-7■■■■■ 83
HNRNPMP52272 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.336e-7■■■■■ 83
HNRNPMP52272 RANBP10-204ENST00000602525 1353 ntTSL 219.37■□□□□ 0.696e-7■■■■■ 83
HNRNPMP52272 U4.5-201ENST00000617137 123 ntBASIC4.71□□□□□ -1.667e-74■■■■■ 82.9
HNRNPMP52272 CTDSPL2-201ENST00000260327 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.467e-8■■■■■ 82.1
HNRNPMP52272 CTDSPL2-204ENST00000558966 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.897e-8■■■■■ 82.1
HNRNPMP52272 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.725e-8■■■■■ 75
HNRNPMP52272 GPI-208ENST00000588991 2021 ntTSL 229.45■■■□□ 2.35e-8■■■■■ 75
HNRNPMP52272 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.995e-8■■■■■ 75
HNRNPMP52272 GPI-202ENST00000415930 4000 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.65e-8■■■■■ 75
HNRNPMP52272 LINC01731-201ENST00000428035 420 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.272e-6■■■■■ 74.7
HNRNPMP52272 AGPAT3-207ENST00000445582 582 ntTSL 319.65■□□□□ 0.746e-7■■■■■ 74
HNRNPMP52272 AGPAT3-202ENST00000327505 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.366e-7■■■■■ 74
HNRNPMP52272 AGPAT3-204ENST00000398061 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.366e-7■■■■■ 74
HNRNPMP52272 PTMA-208ENST00000448874 1108 ntTSL 226.75■■□□□ 1.879e-8■■■■■ 73
HNRNPMP52272 PTMA-212ENST00000481928 1635 ntTSL 325.39■■□□□ 1.669e-8■■■■■ 73
HNRNPMP52272 PTMA-211ENST00000468027 621 ntTSL 1 (best)20.54■□□□□ 0.889e-8■■■■■ 73
HNRNPMP52272 PTMA-209ENST00000466801 784 ntTSL 516.67■□□□□ 0.269e-8■■■■■ 73
HNRNPMP52272 PTMA-201ENST00000341369 1212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.219e-8■■■■■ 73
HNRNPMP52272 PTMA-204ENST00000409683 933 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.199e-8■■■■■ 73
HNRNPMP52272 PTMA-203ENST00000409321 735 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.159e-8■■■■■ 73
HNRNPMP52272 PTMA-202ENST00000409115 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.089e-8■■■■■ 73
HNRNPMP52272 SUCLG2-202ENST00000460567 1596 ntTSL 1 (best)21.7■■□□□ 1.068e-19■■■■■ 71.8
HNRNPMP52272 SUCLG2-203ENST00000492795 1512 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.838e-19■■■■■ 71.8
HNRNPMP52272 SUCLG2-204ENST00000493112 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.768e-19■■■■■ 71.8
HNRNPMP52272 SUCLG2-201ENST00000307227 2352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.428e-19■■■■■ 71.8
HNRNPMP52272 OTUD3-202ENST00000466697 465 ntTSL 25.14□□□□□ -1.596e-11■■■■■ 70.5
HNRNPMP52272 RBM19-202ENST00000392561 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.093e-21■■■■■ 69.9
HNRNPMP52272 RBM19-201ENST00000261741 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.083e-21■■■■■ 69.9
HNRNPMP52272 RBM19-203ENST00000545145 4422 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.373e-21■■■■■ 69.9
HNRNPMP52272 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.474e-20■■■■■ 69.5
HNRNPMP52272 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.294e-20■■■■■ 69.5
HNRNPMP52272 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.211e-8■■■■■ 67.8
HNRNPMP52272 PCMTD1-204ENST00000519975 995 ntTSL 24.86□□□□□ -1.637e-20■■■■■ 66.1
HNRNPMP52272 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.092e-7■■■■■ 64.8
HNRNPMP52272 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.942e-7■■■■■ 64.8
HNRNPMP52272 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.82e-7■■■■■ 64.8
HNRNPMP52272 EIPR1-212ENST00000478754 2932 ntTSL 522.69■■□□□ 1.225e-7■■■■■ 64.7
HNRNPMP52272 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.447e-7■■■■■ 63.9
HNRNPMP52272 AGPAT3-208ENST00000448287 454 ntTSL 318.25■□□□□ 0.517e-7■■■■■ 63.9
HNRNPMP52272 ZFAND2A-202ENST00000397083 852 ntTSL 1 (best)28.98■■■□□ 2.236e-13■■■■■ 63.6
HNRNPMP52272 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.236e-13■■■■■ 63.6
HNRNPMP52272 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.236e-13■■■■■ 63.6
HNRNPMP52272 ZFAND2A-206ENST00000484977 1084 ntTSL 227.04■■□□□ 1.926e-13■■■■■ 63.6
HNRNPMP52272 RPH3AL-207ENST00000572075 569 ntTSL 426.96■■□□□ 1.915e-7■■■■■ 63.1
HNRNPMP52272 RPH3AL-205ENST00000570893 594 ntTSL 325.53■■□□□ 1.685e-7■■■■■ 63.1
HNRNPMP52272 EIPR1-203ENST00000406835 738 ntTSL 529.96■■■□□ 2.397e-7■■■■■ 62.6
HNRNPMP52272 EIPR1-207ENST00000444776 594 ntTSL 428.18■■■□□ 2.18e-7■■■■■ 62.6
HNRNPMP52272 YWHAG-201ENST00000307630 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.193e-8■■■■■ 62.5
HNRNPMP52272 MAP4K4-209ENST00000421882 3416 ntTSL 512.03□□□□□ -0.489e-14■■■■■ 61.1
HNRNPMP52272 MAP4K4-213ENST00000476609 3598 ntTSL 211.98□□□□□ -0.499e-14■■■■■ 61.1
HNRNPMP52272 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC38.23■■■■□ 3.714e-9■■■■■ 61.1
HNRNPMP52272 MPP6-206ENST00000432190 982 ntTSL 337.77■■■■□ 3.644e-9■■■■■ 61.1
HNRNPMP52272 MPP6-205ENST00000430180 1191 ntTSL 530.37■■■□□ 2.454e-9■■■■■ 61.1
HNRNPMP52272 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.94e-9■■■■■ 61.1
HNRNPMP52272 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.674e-9■■■■■ 61.1
HNRNPMP52272 MPP6-204ENST00000426450 552 ntTSL 44.07□□□□□ -1.764e-9■■■■■ 61.1
HNRNPMP52272 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC31.3■■■□□ 2.67e-7■■■■■ 60.9
HNRNPMP52272 EIPR1-204ENST00000435721 672 ntTSL 329.96■■■□□ 2.397e-7■■■■■ 60.9
HNRNPMP52272 EIPR1-205ENST00000441271 647 ntTSL 527.02■■□□□ 1.927e-7■■■■■ 60.9
HNRNPMP52272 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.817e-7■■■■■ 60.9
HNRNPMP52272 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.527e-7■■■■■ 60.9
HNRNPMP52272 EIPR1-208ENST00000455162 847 ntTSL 515.94■□□□□ 0.147e-7■■■■■ 60.9
HNRNPMP52272 EIPR1-210ENST00000463662 757 ntTSL 313.87□□□□□ -0.197e-7■■■■■ 60.9
Retrieved 100 of 21,363 protein–RNA pairs in 67.7 ms