RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000007264.6

RPUSD1-201, Transcript of RNA pseudouridylate synthase domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene RPUSD1, Length 2,050 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD1-201ENST00000007264 EFCAB5A4FU69 1503 aa36.6■■■■□ 3.45
RPUSD1-201ENST00000007264 GRIN2BQ13224 1484 aa36.58■■■■□ 3.45
RPUSD1-201ENST00000007264 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP36.57■■■■□ 3.44
RPUSD1-201ENST00000007264 FHAD1B1AJZ9 1412 aa36.55■■■■□ 3.44
RPUSD1-201ENST00000007264 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP36.53■■■■□ 3.44
RPUSD1-201ENST00000007264 ADAMTS12P58397 1594 aa36.52■■■■□ 3.44
RPUSD1-201ENST00000007264 P3H3Q8IVL6 736 aa36.49■■■■□ 3.43
RPUSD1-201ENST00000007264 FHOD3Q2V2M9 1422 aa36.44■■■■□ 3.42
RPUSD1-201ENST00000007264 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP36.44■■■■□ 3.42
RPUSD1-201ENST00000007264 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP36.43■■■■□ 3.42
RPUSD1-201ENST00000007264 MAP3K1Q13233 1512 aa36.39■■■■□ 3.42
RPUSD1-201ENST00000007264 TIAM1Q13009 1591 aa36.38■■■■□ 3.41
RPUSD1-201ENST00000007264 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP36.37■■■■□ 3.41
RPUSD1-201ENST00000007264 SAMD9Q5K651 1589 aa36.36■■■■□ 3.41
RPUSD1-201ENST00000007264 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP36.33■■■■□ 3.41
RPUSD1-201ENST00000007264 FMN1Q68DA7 1419 aa36.31■■■■□ 3.4
RPUSD1-201ENST00000007264 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa36.3■■■■□ 3.4
RPUSD1-201ENST00000007264 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP36.3■■■■□ 3.4
RPUSD1-201ENST00000007264 FYCO1Q9BQS8 1478 aa36.3■■■■□ 3.4
RPUSD1-201ENST00000007264 IQGAP2Q13576 1575 aa36.27■■■■□ 3.4
RPUSD1-201ENST00000007264 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa36.26■■■■□ 3.4
RPUSD1-201ENST00000007264 CFAP43Q8NDM7 1665 aa36.26■■■■□ 3.4
RPUSD1-201ENST00000007264 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP36.26■■■■□ 3.4
RPUSD1-201ENST00000007264 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP36.25■■■■□ 3.39
RPUSD1-201ENST00000007264 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa36.2■■■■□ 3.39
RPUSD1-201ENST00000007264 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP36.2■■■■□ 3.39
RPUSD1-201ENST00000007264 GRIN2AQ12879 1464 aa36.15■■■■□ 3.38
RPUSD1-201ENST00000007264 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP36.14■■■■□ 3.38
RPUSD1-201ENST00000007264 SYNJ2O15056 1496 aa36.07■■■■□ 3.36
RPUSD1-201ENST00000007264 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa36.07■■■■□ 3.36
RPUSD1-201ENST00000007264 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP36.04■■■■□ 3.36
RPUSD1-201ENST00000007264 CCNB3Q8WWL7 1395 aa36.04■■■■□ 3.36
RPUSD1-201ENST00000007264 UGGT2Q9NYU1 1516 aa36.04■■■■□ 3.36
RPUSD1-201ENST00000007264 FBLN2P98095 1184 aa35.95■■■■□ 3.35
RPUSD1-201ENST00000007264 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa35.93■■■■□ 3.34
RPUSD1-201ENST00000007264 CEP170Q5SW79 1584 aa35.9■■■■□ 3.34
RPUSD1-201ENST00000007264 PHLDB1Q86UU1 1377 aa35.9■■■■□ 3.34
RPUSD1-201ENST00000007264 HECW1Q76N89 1606 aa35.88■■■■□ 3.33
RPUSD1-201ENST00000007264 KIAA0556O60303 1618 aa35.87■■■■□ 3.33
RPUSD1-201ENST00000007264 MTUS2Q5JR59 1369 aa35.87■■■■□ 3.33
RPUSD1-201ENST00000007264 CCDC18Q5T9S5 1454 aa35.85■■■■□ 3.33
RPUSD1-201ENST00000007264 DISP1Q96F81 1524 aa35.83■■■■□ 3.33
RPUSD1-201ENST00000007264 NUP160Q12769 1436 aa35.8■■■■□ 3.32
RPUSD1-201ENST00000007264 ITGAEP38570 1179 aa35.76■■■■□ 3.32
RPUSD1-201ENST00000007264 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa35.76■■■■□ 3.31
RPUSD1-201ENST00000007264 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP35.72■■■■□ 3.31
RPUSD1-201ENST00000007264 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP35.72■■■■□ 3.31
RPUSD1-201ENST00000007264 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP35.7■■■■□ 3.31
RPUSD1-201ENST00000007264 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa35.66■■■■□ 3.3
RPUSD1-201ENST00000007264 NCOA2Q15596 1464 aa35.64■■■■□ 3.3
RPUSD1-201ENST00000007264 JPH4Q96JJ6 628 aa35.64■■■■□ 3.3
RPUSD1-201ENST00000007264 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa35.62■■■■□ 3.29
RPUSD1-201ENST00000007264 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP35.62■■■■□ 3.29
RPUSD1-201ENST00000007264 FGD6Q6ZV73 1430 aa35.61■■■■□ 3.29
RPUSD1-201ENST00000007264 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP35.61■■■■□ 3.29
RPUSD1-201ENST00000007264 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa35.6■■■■□ 3.29
RPUSD1-201ENST00000007264 CHD1O14646 1710 aa35.57■■■■□ 3.28
RPUSD1-201ENST00000007264 MYOM3Q5VTT5 1437 aa35.55■■■■□ 3.28
RPUSD1-201ENST00000007264 ARID3CA6NKF2 412 aa35.53■■■■□ 3.28
RPUSD1-201ENST00000007264 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP35.51■■■■□ 3.28
RPUSD1-201ENST00000007264 ARHGEF11O15085 1522 aa35.5■■■■□ 3.27
RPUSD1-201ENST00000007264 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP35.5■■■■□ 3.27
RPUSD1-201ENST00000007264 CLSPNQ9HAW4 1339 aa35.48■■■■□ 3.27
RPUSD1-201ENST00000007264 SETD5Q9C0A6 1442 aa35.46■■■■□ 3.27
RPUSD1-201ENST00000007264 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa35.45■■■■□ 3.27
RPUSD1-201ENST00000007264 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP35.42■■■■□ 3.26
RPUSD1-201ENST00000007264 PLB1Q6P1J6 1458 aa35.42■■■■□ 3.26
RPUSD1-201ENST00000007264 PTPN23Q9H3S7 1636 aa35.4■■■■□ 3.26
RPUSD1-201ENST00000007264 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP35.36■■■■□ 3.25
RPUSD1-201ENST00000007264 ABCA8O94911 1581 aa35.28■■■■□ 3.24
RPUSD1-201ENST00000007264 MIA2Q96PC5 1412 aa35.28■■■■□ 3.24
RPUSD1-201ENST00000007264 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP35.27■■■■□ 3.24
RPUSD1-201ENST00000007264 SHROOM2Q13796 1616 aa35.24■■■■□ 3.23
RPUSD1-201ENST00000007264 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP35.24■■■■□ 3.23
RPUSD1-201ENST00000007264 PTPRGP23470 1445 aa35.21■■■■□ 3.23
RPUSD1-201ENST00000007264 PTPRKQ15262 1439 aa35.2■■■■□ 3.22
RPUSD1-201ENST00000007264 HFM1A2PYH4 1435 aa35.16■■■■□ 3.22
RPUSD1-201ENST00000007264 ADCY10Q96PN6 1610 aa35.14■■■■□ 3.22
RPUSD1-201ENST00000007264 ATP10BO94823 1461 aa35.1■■■■□ 3.21
RPUSD1-201ENST00000007264 ITSN2Q9NZM3 1697 aa35.09■■■■□ 3.21
RPUSD1-201ENST00000007264 MAPKBP1O60336 1514 aa35.08■■■■□ 3.21
RPUSD1-201ENST00000007264 PLEKHD1A6NEE1 506 aa35.08■■■■□ 3.21
RPUSD1-201ENST00000007264 KIF14Q15058 1648 aa35.06■■■■□ 3.2
RPUSD1-201ENST00000007264 CLASP1Q7Z460 1538 aa35.06■■■■□ 3.2
RPUSD1-201ENST00000007264 NAIPQ13075 1403 aa35.05■■■■□ 3.2
RPUSD1-201ENST00000007264 UACAQ9BZF9 1416 aa35■■■■□ 3.19
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RPUSD1-201ENST00000007264 CHIC2Q9UKJ5 165 aa34.99■■■■□ 3.19
RPUSD1-201ENST00000007264 ERCC6L2Q5T890 1561 aa34.99■■■■□ 3.19
RPUSD1-201ENST00000007264 GCC2Q8IWJ2 1684 aa34.98■■■■□ 3.19
RPUSD1-201ENST00000007264 AKNAQ7Z591 1439 aa34.97■■■■□ 3.19
RPUSD1-201ENST00000007264 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP34.96■■■■□ 3.19
RPUSD1-201ENST00000007264 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP34.96■■■■□ 3.19
RPUSD1-201ENST00000007264 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP34.96■■■■□ 3.19
RPUSD1-201ENST00000007264 DAPK1P53355 1430 aa34.94■■■■□ 3.18
RPUSD1-201ENST00000007264 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa34.94■■■■□ 3.18
RPUSD1-201ENST00000007264 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP34.91■■■■□ 3.18
RPUSD1-201ENST00000007264 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa34.9■■■■□ 3.18
RPUSD1-201ENST00000007264 ABCC2Q92887 1545 aa34.87■■■■□ 3.17
RPUSD1-201ENST00000007264 ABCC5O15440 1437 aa34.87■■■■□ 3.17
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