RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000224820.1

Zkscan3-208, Transcript of Zinc finger protein with KRAB and SCAN domains 3, mousemouse

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Gene Zkscan3, Length 5,398 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Kdm5dQ62240 1548 aa21.33■■□□□ 1.01
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Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Kdm2aP59997 1161 aa20.84■□□□□ 0.93
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Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Arhgap35Q91YM2 1499 aa20.67■□□□□ 0.9
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Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Ccdc27Q3V036 639 aa20.66■□□□□ 0.9
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Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Smarca2Q6DIC0 1577 aa20.62■□□□□ 0.89
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Wwc2Q6NXJ0 1187 aa20.62■□□□□ 0.89
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Baz1bQ9Z277 1479 aa20.62■□□□□ 0.89
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Trim44Q9QXA7 346 aa20.61■□□□□ 0.89
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Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Chmp4bQ9D8B3 224 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Stk24Q99KH8 431 aa20.6■□□□□ 0.89
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Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Rundc1Q0VDN7 615 aa20.59■□□□□ 0.89
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Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Map7O88735 730 aa20.54■□□□□ 0.88
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Fhad1A6PWD2 1420 aa20.54■□□□□ 0.88
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Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Sin3aQ60520 1274 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
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Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Carmil1Q6EDY6 1374 aa20.47■□□□□ 0.87
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Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Trak1Q6PD31 939 aa20.45■□□□□ 0.86
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Gm6268A2A3U9 297 aa20.45■□□□□ 0.86
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Cux2P70298 1426 aa20.44■□□□□ 0.86
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 PtmaP26350 111 aa20.44■□□□□ 0.86
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Tmf1B9EKI3 1091 aa20.44■□□□□ 0.86
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Zscan21Q07231 555 aa20.43■□□□□ 0.86
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Irx6Q9ER75 438 aa20.43■□□□□ 0.86
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Arid4bA2CG63 1314 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 B4galnt3Q6L8S8 986 aa20.42■□□□□ 0.86
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Dhx57Q6P5D3 1388 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
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Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Cnga1P29974 684 aa20.41■□□□□ 0.86
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