Protein–RNA interactions for Protein: Q05860

Fmn1, Formin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fmn1Q05860 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC66.1■■■■■ 8.17
Fmn1Q05860 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC61.3■■■■■ 7.4
Fmn1Q05860 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC60.17■■■■■ 7.22
Fmn1Q05860 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC57.58■■■■■ 6.81
Fmn1Q05860 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC57.57■■■■■ 6.81
Fmn1Q05860 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC56.44■■■■■ 6.63
Fmn1Q05860 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC55.86■■■■■ 6.53
Fmn1Q05860 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.76■■■■■ 6.52
Fmn1Q05860 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC55.32■■■■■ 6.45
Fmn1Q05860 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC55.12■■■■■ 6.41
Fmn1Q05860 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.12■■■■■ 6.41
Fmn1Q05860 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.92■■■■■ 6.38
Fmn1Q05860 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.3■■■■■ 6.28
Fmn1Q05860 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.61■■■■■ 6.17
Fmn1Q05860 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC53.56■■■■■ 6.16
Fmn1Q05860 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC53.32■■■■■ 6.13
Fmn1Q05860 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC53.22■■■■■ 6.11
Fmn1Q05860 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC53■■■■■ 6.07
Fmn1Q05860 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC52.98■■■■■ 6.07
Fmn1Q05860 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.92■■■■■ 6.06
Fmn1Q05860 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC52.67■■■■■ 6.02
Fmn1Q05860 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC52.52■■■■■ 6
Fmn1Q05860 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.5■■■■■ 5.99
Fmn1Q05860 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.47■■■■■ 5.99
Fmn1Q05860 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.41■■■■■ 5.98
Fmn1Q05860 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.33■■■■■ 5.97
Fmn1Q05860 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.26■■■■■ 5.96
Fmn1Q05860 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC52.24■■■■■ 5.95
Fmn1Q05860 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC52.18■■■■■ 5.94
Fmn1Q05860 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.02■■■■■ 5.92
Fmn1Q05860 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC51.91■■■■■ 5.9
Fmn1Q05860 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC51.88■■■■■ 5.9
Fmn1Q05860 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC51.68■■■■■ 5.86
Fmn1Q05860 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.39■■■■■ 5.82
Fmn1Q05860 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC51.34■■■■■ 5.81
Fmn1Q05860 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC51■■■■■ 5.76
Fmn1Q05860 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC50.92■■■■■ 5.74
Fmn1Q05860 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC50.87■■■■■ 5.73
Fmn1Q05860 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC50.81■■■■■ 5.72
Fmn1Q05860 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC50.69■■■■■ 5.71
Fmn1Q05860 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC50.61■■■■■ 5.69
Fmn1Q05860 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.59■■■■■ 5.69
Fmn1Q05860 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC50.5■■■■■ 5.67
Fmn1Q05860 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC50.47■■■■■ 5.67
Fmn1Q05860 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC50.39■■■■■ 5.66
Fmn1Q05860 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.13■■■■■ 5.62
Fmn1Q05860 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC50.09■■■■■ 5.61
Fmn1Q05860 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC50.01■■■■■ 5.6
Fmn1Q05860 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49.77■■■■■ 5.56
Fmn1Q05860 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.76■■■■■ 5.56
Fmn1Q05860 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC49.63■■■■■ 5.54
Fmn1Q05860 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC49.56■■■■■ 5.52
Fmn1Q05860 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC49.46■■■■■ 5.51
Fmn1Q05860 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC49.44■■■■■ 5.51
Fmn1Q05860 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.38■■■■■ 5.5
Fmn1Q05860 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC49.37■■■■■ 5.49
Fmn1Q05860 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.32■■■■■ 5.49
Fmn1Q05860 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC49.26■■■■■ 5.48
Fmn1Q05860 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC49.21■■■■■ 5.47
Fmn1Q05860 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC49.17■■■■■ 5.46
Fmn1Q05860 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC49.16■■■■■ 5.46
Fmn1Q05860 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49.15■■■■■ 5.46
Fmn1Q05860 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.12■■■■■ 5.45
Fmn1Q05860 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC49.11■■■■■ 5.45
Fmn1Q05860 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC49.08■■■■■ 5.45
Fmn1Q05860 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.95■■■■■ 5.43
Fmn1Q05860 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC48.91■■■■■ 5.42
Fmn1Q05860 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC48.87■■■■■ 5.41
Fmn1Q05860 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC48.84■■■■■ 5.41
Fmn1Q05860 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC48.76■■■■■ 5.4
Fmn1Q05860 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.72■■■■■ 5.39
Fmn1Q05860 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC48.7■■■■■ 5.39
Fmn1Q05860 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.68■■■■■ 5.38
Fmn1Q05860 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC48.62■■■■■ 5.37
Fmn1Q05860 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.61■■■■■ 5.37
Fmn1Q05860 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC48.61■■■■■ 5.37
Fmn1Q05860 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.58■■■■■ 5.37
Fmn1Q05860 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.57■■■■■ 5.37
Fmn1Q05860 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.55■■■■■ 5.36
Fmn1Q05860 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC48.42■■■■■ 5.34
Fmn1Q05860 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC48.37■■■■■ 5.33
Fmn1Q05860 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.36■■■■■ 5.33
Fmn1Q05860 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.31■■■■■ 5.32
Fmn1Q05860 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC48.25■■■■■ 5.31
Fmn1Q05860 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC48.23■■■■■ 5.31
Fmn1Q05860 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC48.23■■■■■ 5.31
Fmn1Q05860 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC48.11■■■■■ 5.29
Fmn1Q05860 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.07■■■■■ 5.29
Fmn1Q05860 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC48.03■■■■■ 5.28
Fmn1Q05860 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC48.01■■■■■ 5.28
Fmn1Q05860 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC47.95■■■■■ 5.27
Fmn1Q05860 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.95■■■■■ 5.27
Fmn1Q05860 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.91■■■■■ 5.26
Fmn1Q05860 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.87■■■■■ 5.25
Fmn1Q05860 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.86■■■■■ 5.25
Fmn1Q05860 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC47.85■■■■■ 5.25
Fmn1Q05860 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC47.76■■■■■ 5.24
Fmn1Q05860 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.74■■■■■ 5.23
Fmn1Q05860 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.7■■■■■ 5.23
Fmn1Q05860 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC47.64■■■■■ 5.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms