Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHG7

Rapgef2, Rap guanine nucleotide exchange factor 2, mousemouse

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Length 1,496 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef2Q8CHG7 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC63.7■■■■■ 7.79
Rapgef2Q8CHG7 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC59.51■■■■■ 7.12
Rapgef2Q8CHG7 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC58.3■■■■■ 6.92
Rapgef2Q8CHG7 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC55.86■■■■■ 6.53
Rapgef2Q8CHG7 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC54.89■■■■■ 6.38
Rapgef2Q8CHG7 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.15■■■■■ 6.26
Rapgef2Q8CHG7 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC53.89■■■■■ 6.22
Rapgef2Q8CHG7 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC53.85■■■■■ 6.21
Rapgef2Q8CHG7 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC53.65■■■■■ 6.18
Rapgef2Q8CHG7 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.62■■■■■ 6.17
Rapgef2Q8CHG7 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.22■■■■■ 6.11
Rapgef2Q8CHG7 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.07■■■■■ 6.09
Rapgef2Q8CHG7 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC52.97■■■■■ 6.07
Rapgef2Q8CHG7 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC52.41■■■■■ 5.98
Rapgef2Q8CHG7 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC52.33■■■■■ 5.97
Rapgef2Q8CHG7 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.02■■■■■ 5.92
Rapgef2Q8CHG7 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC51.93■■■■■ 5.9
Rapgef2Q8CHG7 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC51.82■■■■■ 5.89
Rapgef2Q8CHG7 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.79■■■■■ 5.88
Rapgef2Q8CHG7 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.12■■■■■ 5.77
Rapgef2Q8CHG7 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.11■■■■■ 5.77
Rapgef2Q8CHG7 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.89■■■■■ 5.74
Rapgef2Q8CHG7 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC50.81■■■■■ 5.72
Rapgef2Q8CHG7 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC50.67■■■■■ 5.7
Rapgef2Q8CHG7 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC50.65■■■■■ 5.7
Rapgef2Q8CHG7 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.61■■■■■ 5.69
Rapgef2Q8CHG7 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC50.56■■■■■ 5.68
Rapgef2Q8CHG7 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC50.49■■■■■ 5.67
Rapgef2Q8CHG7 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.35■■■■■ 5.65
Rapgef2Q8CHG7 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC50.11■■■■■ 5.61
Rapgef2Q8CHG7 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.02■■■■■ 5.6
Rapgef2Q8CHG7 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC49.98■■■■■ 5.59
Rapgef2Q8CHG7 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.92■■■■■ 5.58
Rapgef2Q8CHG7 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC49.88■■■■■ 5.58
Rapgef2Q8CHG7 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC49.87■■■■■ 5.57
Rapgef2Q8CHG7 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49.8■■■■■ 5.56
Rapgef2Q8CHG7 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC49.65■■■■■ 5.54
Rapgef2Q8CHG7 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC49.53■■■■■ 5.52
Rapgef2Q8CHG7 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49.41■■■■■ 5.5
Rapgef2Q8CHG7 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC49.36■■■■■ 5.49
Rapgef2Q8CHG7 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC48.95■■■■■ 5.43
Rapgef2Q8CHG7 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC48.84■■■■■ 5.41
Rapgef2Q8CHG7 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC48.83■■■■■ 5.41
Rapgef2Q8CHG7 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC48.61■■■■■ 5.37
Rapgef2Q8CHG7 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC48.48■■■■■ 5.35
Rapgef2Q8CHG7 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC48.39■■■■■ 5.34
Rapgef2Q8CHG7 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.38■■■■■ 5.33
Rapgef2Q8CHG7 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.36■■■■■ 5.33
Rapgef2Q8CHG7 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC48.32■■■■■ 5.33
Rapgef2Q8CHG7 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.25■■■■■ 5.31
Rapgef2Q8CHG7 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.25■■■■■ 5.31
Rapgef2Q8CHG7 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC48.22■■■■■ 5.31
Rapgef2Q8CHG7 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC48.2■■■■■ 5.31
Rapgef2Q8CHG7 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC48.08■■■■■ 5.29
Rapgef2Q8CHG7 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.07■■■■■ 5.29
Rapgef2Q8CHG7 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC48.04■■■■■ 5.28
Rapgef2Q8CHG7 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.03■■■■■ 5.28
Rapgef2Q8CHG7 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC47.93■■■■■ 5.26
Rapgef2Q8CHG7 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC47.91■■■■■ 5.26
Rapgef2Q8CHG7 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.89■■■■■ 5.26
Rapgef2Q8CHG7 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.85■■■■■ 5.25
Rapgef2Q8CHG7 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC47.83■■■■■ 5.25
Rapgef2Q8CHG7 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.6■■■■■ 5.21
Rapgef2Q8CHG7 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC47.6■■■■■ 5.21
Rapgef2Q8CHG7 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC47.47■■■■■ 5.19
Rapgef2Q8CHG7 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.45■■■■■ 5.19
Rapgef2Q8CHG7 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC47.44■■■■■ 5.18
Rapgef2Q8CHG7 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC47.27■■■■■ 5.16
Rapgef2Q8CHG7 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC47.24■■■■■ 5.15
Rapgef2Q8CHG7 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.23■■■■■ 5.15
Rapgef2Q8CHG7 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC47.2■■■■■ 5.15
Rapgef2Q8CHG7 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC47.2■■■■■ 5.15
Rapgef2Q8CHG7 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.13■■■■■ 5.14
Rapgef2Q8CHG7 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.04■■■■■ 5.12
Rapgef2Q8CHG7 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC47.02■■■■■ 5.12
Rapgef2Q8CHG7 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC46.99■■■■■ 5.11
Rapgef2Q8CHG7 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC46.95■■■■■ 5.11
Rapgef2Q8CHG7 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.87■■■■■ 5.09
Rapgef2Q8CHG7 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC46.76■■■■■ 5.08
Rapgef2Q8CHG7 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.72■■■■■ 5.07
Rapgef2Q8CHG7 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC46.71■■■■■ 5.07
Rapgef2Q8CHG7 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.71■■■■■ 5.07
Rapgef2Q8CHG7 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC46.68■■■■■ 5.06
Rapgef2Q8CHG7 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.6■■■■■ 5.05
Rapgef2Q8CHG7 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC46.52■■■■■ 5.04
Rapgef2Q8CHG7 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC46.52■■■■■ 5.04
Rapgef2Q8CHG7 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.5■■■■■ 5.03
Rapgef2Q8CHG7 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.48■■■■■ 5.03
Rapgef2Q8CHG7 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.47■■■■■ 5.03
Rapgef2Q8CHG7 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.47■■■■■ 5.03
Rapgef2Q8CHG7 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.41■■■■■ 5.02
Rapgef2Q8CHG7 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.34■■■■■ 5.01
Rapgef2Q8CHG7 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC46.32■■■■■ 5.01
Rapgef2Q8CHG7 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.31■■■■■ 5
Rapgef2Q8CHG7 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.31■■■■■ 5
Rapgef2Q8CHG7 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.29■■■■■ 5
Rapgef2Q8CHG7 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC46.26■■■■■ 5
Rapgef2Q8CHG7 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC46.21■■■■■ 4.99
Rapgef2Q8CHG7 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC46.18■■■■■ 4.98
Rapgef2Q8CHG7 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC46.16■■■■■ 4.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms