Protein–RNA interactions for Protein: Q3V036

Ccdc27, Coiled-coil domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc27Q3V036 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC44.77■■■■■ 4.76
Ccdc27Q3V036 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.43■■■■■ 4.38
Ccdc27Q3V036 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.19
Ccdc27Q3V036 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
Ccdc27Q3V036 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
Ccdc27Q3V036 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.02■■■■■ 4.16
Ccdc27Q3V036 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
Ccdc27Q3V036 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
Ccdc27Q3V036 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC39.87■■■■□ 3.97
Ccdc27Q3V036 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC39.85■■■■□ 3.97
Ccdc27Q3V036 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
Ccdc27Q3V036 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC39.1■■■■□ 3.85
Ccdc27Q3V036 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
Ccdc27Q3V036 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
Ccdc27Q3V036 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC38.58■■■■□ 3.77
Ccdc27Q3V036 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC38.46■■■■□ 3.75
Ccdc27Q3V036 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
Ccdc27Q3V036 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
Ccdc27Q3V036 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
Ccdc27Q3V036 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
Ccdc27Q3V036 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
Ccdc27Q3V036 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
Ccdc27Q3V036 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
Ccdc27Q3V036 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
Ccdc27Q3V036 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
Ccdc27Q3V036 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
Ccdc27Q3V036 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC37.75■■■■□ 3.63
Ccdc27Q3V036 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
Ccdc27Q3V036 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
Ccdc27Q3V036 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC37.53■■■■□ 3.6
Ccdc27Q3V036 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
Ccdc27Q3V036 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC37.51■■■■□ 3.6
Ccdc27Q3V036 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
Ccdc27Q3V036 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
Ccdc27Q3V036 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
Ccdc27Q3V036 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
Ccdc27Q3V036 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
Ccdc27Q3V036 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Ccdc27Q3V036 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Ccdc27Q3V036 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
Ccdc27Q3V036 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Ccdc27Q3V036 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Ccdc27Q3V036 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
Ccdc27Q3V036 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
Ccdc27Q3V036 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Ccdc27Q3V036 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Ccdc27Q3V036 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC36.68■■■■□ 3.46
Ccdc27Q3V036 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC36.63■■■■□ 3.45
Ccdc27Q3V036 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC36.62■■■■□ 3.45
Ccdc27Q3V036 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Ccdc27Q3V036 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
Ccdc27Q3V036 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
Ccdc27Q3V036 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Ccdc27Q3V036 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
Ccdc27Q3V036 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
Ccdc27Q3V036 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Ccdc27Q3V036 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Ccdc27Q3V036 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Ccdc27Q3V036 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Ccdc27Q3V036 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Ccdc27Q3V036 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Ccdc27Q3V036 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Ccdc27Q3V036 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC35.67■■■■□ 3.3
Ccdc27Q3V036 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
Ccdc27Q3V036 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC35.51■■■■□ 3.28
Ccdc27Q3V036 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
Ccdc27Q3V036 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Ccdc27Q3V036 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC35.45■■■■□ 3.27
Ccdc27Q3V036 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Ccdc27Q3V036 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Ccdc27Q3V036 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Ccdc27Q3V036 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Ccdc27Q3V036 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Ccdc27Q3V036 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC35.28■■■■□ 3.24
Ccdc27Q3V036 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
Ccdc27Q3V036 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Ccdc27Q3V036 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Ccdc27Q3V036 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Ccdc27Q3V036 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
Ccdc27Q3V036 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
Ccdc27Q3V036 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
Ccdc27Q3V036 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
Ccdc27Q3V036 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Ccdc27Q3V036 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
Ccdc27Q3V036 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
Ccdc27Q3V036 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
Ccdc27Q3V036 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Ccdc27Q3V036 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Ccdc27Q3V036 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Ccdc27Q3V036 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Ccdc27Q3V036 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Ccdc27Q3V036 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Ccdc27Q3V036 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
Ccdc27Q3V036 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Ccdc27Q3V036 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC34.77■■■■□ 3.16
Ccdc27Q3V036 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Ccdc27Q3V036 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Ccdc27Q3V036 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
Ccdc27Q3V036 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
Ccdc27Q3V036 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms