Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN1

KRTAP21-3, Keratin-associated protein 21-3, humanhuman

Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-3Q3LHN1 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
KRTAP21-3Q3LHN1 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
KRTAP21-3Q3LHN1 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KRTAP21-3Q3LHN1 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KRTAP21-3Q3LHN1 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KRTAP21-3Q3LHN1 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
KRTAP21-3Q3LHN1 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
KRTAP21-3Q3LHN1 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
KRTAP21-3Q3LHN1 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
KRTAP21-3Q3LHN1 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KRTAP21-3Q3LHN1 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KRTAP21-3Q3LHN1 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KRTAP21-3Q3LHN1 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
KRTAP21-3Q3LHN1 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
KRTAP21-3Q3LHN1 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
KRTAP21-3Q3LHN1 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
KRTAP21-3Q3LHN1 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
KRTAP21-3Q3LHN1 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KRTAP21-3Q3LHN1 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KRTAP21-3Q3LHN1 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
KRTAP21-3Q3LHN1 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
KRTAP21-3Q3LHN1 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KRTAP21-3Q3LHN1 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KRTAP21-3Q3LHN1 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KRTAP21-3Q3LHN1 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KRTAP21-3Q3LHN1 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KRTAP21-3Q3LHN1 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KRTAP21-3Q3LHN1 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KRTAP21-3Q3LHN1 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
KRTAP21-3Q3LHN1 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
KRTAP21-3Q3LHN1 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
KRTAP21-3Q3LHN1 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KRTAP21-3Q3LHN1 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KRTAP21-3Q3LHN1 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KRTAP21-3Q3LHN1 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KRTAP21-3Q3LHN1 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KRTAP21-3Q3LHN1 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRTAP21-3Q3LHN1 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KRTAP21-3Q3LHN1 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
KRTAP21-3Q3LHN1 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRTAP21-3Q3LHN1 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRTAP21-3Q3LHN1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRTAP21-3Q3LHN1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRTAP21-3Q3LHN1 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
KRTAP21-3Q3LHN1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRTAP21-3Q3LHN1 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KRTAP21-3Q3LHN1 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRTAP21-3Q3LHN1 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRTAP21-3Q3LHN1 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRTAP21-3Q3LHN1 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRTAP21-3Q3LHN1 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRTAP21-3Q3LHN1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRTAP21-3Q3LHN1 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRTAP21-3Q3LHN1 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRTAP21-3Q3LHN1 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRTAP21-3Q3LHN1 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRTAP21-3Q3LHN1 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRTAP21-3Q3LHN1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRTAP21-3Q3LHN1 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
KRTAP21-3Q3LHN1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
KRTAP21-3Q3LHN1 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRTAP21-3Q3LHN1 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRTAP21-3Q3LHN1 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRTAP21-3Q3LHN1 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRTAP21-3Q3LHN1 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRTAP21-3Q3LHN1 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
KRTAP21-3Q3LHN1 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRTAP21-3Q3LHN1 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRTAP21-3Q3LHN1 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRTAP21-3Q3LHN1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRTAP21-3Q3LHN1 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRTAP21-3Q3LHN1 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRTAP21-3Q3LHN1 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRTAP21-3Q3LHN1 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRTAP21-3Q3LHN1 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRTAP21-3Q3LHN1 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRTAP21-3Q3LHN1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRTAP21-3Q3LHN1 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KRTAP21-3Q3LHN1 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRTAP21-3Q3LHN1 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRTAP21-3Q3LHN1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRTAP21-3Q3LHN1 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
KRTAP21-3Q3LHN1 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRTAP21-3Q3LHN1 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRTAP21-3Q3LHN1 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
KRTAP21-3Q3LHN1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRTAP21-3Q3LHN1 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRTAP21-3Q3LHN1 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
KRTAP21-3Q3LHN1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRTAP21-3Q3LHN1 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRTAP21-3Q3LHN1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRTAP21-3Q3LHN1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRTAP21-3Q3LHN1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KRTAP21-3Q3LHN1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KRTAP21-3Q3LHN1 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms