RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362803.1

SNORD16-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 16, humanhuman

BASIC

Gene SNORD16, Length 99 nt, Biotype snoRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD16-201ENST00000362803 NISCHQ9Y2I1 1504 aa14.96□□□□□ -0.02
SNORD16-201ENST00000362803 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa13.18□□□□□ -0.3
SNORD16-201ENST00000362803 ABCC9O60706 1549 aa12.67□□□□□ -0.38
SNORD16-201ENST00000362803 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP12.51□□□□□ -0.41
SNORD16-201ENST00000362803 DCAF8L2P0C7V8 631 aa12.45□□□□□ -0.42
SNORD16-201ENST00000362803 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa12.42□□□□□ -0.42
SNORD16-201ENST00000362803 MYO15BQ96JP2 1530 aa12.39□□□□□ -0.43
SNORD16-201ENST00000362803 NACADO15069 1562 aa12.37□□□□□ -0.43
SNORD16-201ENST00000362803 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa12.33□□□□□ -0.44
SNORD16-201ENST00000362803 SCRIBQ14160 1630 aa12.03□□□□□ -0.48
SNORD16-201ENST00000362803 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa11.95□□□□□ -0.5
SNORD16-201ENST00000362803 UNC13AQ9UPW8 1703 aa11.91□□□□□ -0.5
SNORD16-201ENST00000362803 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP11.87□□□□□ -0.51
SNORD16-201ENST00000362803 BICRAQ9NZM4 1560 aa11.86□□□□□ -0.51
SNORD16-201ENST00000362803 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
SNORD16-201ENST00000362803 CECR2Q9BXF3 1484 aa11.58□□□□□ -0.56
SNORD16-201ENST00000362803 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP11.58□□□□□ -0.56
SNORD16-201ENST00000362803 SMARCA4P51532 1647 aa11.53□□□□□ -0.56
SNORD16-201ENST00000362803 MROH2BQ7Z745 1585 aa11.5□□□□□ -0.57
SNORD16-201ENST00000362803 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
SNORD16-201ENST00000362803 SMARCA2P51531 1590 aa11.46□□□□□ -0.57
SNORD16-201ENST00000362803 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa11.45□□□□□ -0.58
SNORD16-201ENST00000362803 PEG3Q9GZU2 1588 aa11.44□□□□□ -0.58
SNORD16-201ENST00000362803 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa11.44□□□□□ -0.58
SNORD16-201ENST00000362803 NCAPD3P42695 1498 aa11.41□□□□□ -0.58
SNORD16-201ENST00000362803 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
SNORD16-201ENST00000362803 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP11.38□□□□□ -0.59
SNORD16-201ENST00000362803 HMGXB3Q12766 1538 aa11.37□□□□□ -0.59
SNORD16-201ENST00000362803 WIZO95785 1651 aa11.36□□□□□ -0.59
SNORD16-201ENST00000362803 DNAJC5BQ9UF47 199 aa11.34□□□□□ -0.59
SNORD16-201ENST00000362803 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
SNORD16-201ENST00000362803 CCDC88BA6NC98 1476 aa11.17□□□□□ -0.62
SNORD16-201ENST00000362803 CADPSQ9ULU8 1353 aa11.1□□□□□ -0.63
SNORD16-201ENST00000362803 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa11.07□□□□□ -0.64
SNORD16-201ENST00000362803 CFTRP13569 1480 aa11.07□□□□□ -0.64
SNORD16-201ENST00000362803 PDS5BQ9NTI5 1447 aa11.03□□□□□ -0.64
SNORD16-201ENST00000362803 NESP48681 1621 aa10.99□□□□□ -0.65
SNORD16-201ENST00000362803 FANCD2Q9BXW9 1451 aa10.96□□□□□ -0.65
SNORD16-201ENST00000362803 ERCC6Q03468 1493 aa10.95□□□□□ -0.66
SNORD16-201ENST00000362803 PRDM2Q13029 1718 aa10.94□□□□□ -0.66
SNORD16-201ENST00000362803 CEP164Q9UPV0 1460 aa10.93□□□□□ -0.66
SNORD16-201ENST00000362803 ABCC8Q09428 1581 aa10.88□□□□□ -0.67
SNORD16-201ENST00000362803 MRC2Q9UBG0 1479 aa10.86□□□□□ -0.67
SNORD16-201ENST00000362803 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa10.85□□□□□ -0.67
SNORD16-201ENST00000362803 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP10.85□□□□□ -0.67
SNORD16-201ENST00000362803 DNMBPQ6XZF7 1577 aa10.82□□□□□ -0.68
SNORD16-201ENST00000362803 TRIM41Q8WV44 630 aa10.8□□□□□ -0.68
SNORD16-201ENST00000362803 WDR62O43379 1518 aa10.79□□□□□ -0.68
SNORD16-201ENST00000362803 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP10.79□□□□□ -0.68
SNORD16-201ENST00000362803 TOPBP1Q92547 1522 aa10.79□□□□□ -0.68
SNORD16-201ENST00000362803 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP10.78□□□□□ -0.68
SNORD16-201ENST00000362803 CUX1P39880 1505 aa10.78□□□□□ -0.68
SNORD16-201ENST00000362803 TOP2BQ02880 1626 aa10.77□□□□□ -0.68
SNORD16-201ENST00000362803 CHIC1Q5VXU3 224 aa10.77□□□□□ -0.69
SNORD16-201ENST00000362803 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa10.75□□□□□ -0.69
SNORD16-201ENST00000362803 CUX2O14529 1486 aa10.74□□□□□ -0.69
SNORD16-201ENST00000362803 SYNJ1O43426 1573 aa10.74□□□□□ -0.69
SNORD16-201ENST00000362803 FGD5Q6ZNL6 1462 aa10.73□□□□□ -0.69
SNORD16-201ENST00000362803 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP10.72□□□□□ -0.69
SNORD16-201ENST00000362803 SOGA1O94964 1423 aa10.71□□□□□ -0.69
SNORD16-201ENST00000362803 IFT140Q96RY7 1462 aa10.71□□□□□ -0.69
SNORD16-201ENST00000362803 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa10.65□□□□□ -0.7
SNORD16-201ENST00000362803 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa10.65□□□□□ -0.7
SNORD16-201ENST00000362803 KIF27Q86VH2 1401 aa10.64□□□□□ -0.71
SNORD16-201ENST00000362803 WDR97A6NE52 1622 aa10.63□□□□□ -0.71
SNORD16-201ENST00000362803 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
SNORD16-201ENST00000362803 EEA1Q15075 1411 aa10.62□□□□□ -0.71
SNORD16-201ENST00000362803 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
SNORD16-201ENST00000362803 GAPVD1Q14C86 1478 aa10.58□□□□□ -0.72
SNORD16-201ENST00000362803 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP10.57□□□□□ -0.72
SNORD16-201ENST00000362803 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP10.56□□□□□ -0.72
SNORD16-201ENST00000362803 GRIN2BQ13224 1484 aa10.56□□□□□ -0.72
SNORD16-201ENST00000362803 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa10.55□□□□□ -0.72
SNORD16-201ENST00000362803 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP10.55□□□□□ -0.72
SNORD16-201ENST00000362803 ERICH3Q5RHP9 1530 aa10.54□□□□□ -0.72
SNORD16-201ENST00000362803 CSRNP3Q8WYN3 585 aa10.54□□□□□ -0.72
SNORD16-201ENST00000362803 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP10.52□□□□□ -0.73
SNORD16-201ENST00000362803 IGF1RP08069 1367 aa10.52□□□□□ -0.73
SNORD16-201ENST00000362803 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP10.51□□□□□ -0.73
SNORD16-201ENST00000362803 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa10.51□□□□□ -0.73
SNORD16-201ENST00000362803 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa10.49□□□□□ -0.73
SNORD16-201ENST00000362803 FHAD1B1AJZ9 1412 aa10.49□□□□□ -0.73
SNORD16-201ENST00000362803 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa10.49□□□□□ -0.73
SNORD16-201ENST00000362803 CUL7Q14999 1698 aa10.48□□□□□ -0.73
SNORD16-201ENST00000362803 PBRM1Q86U86 1689 aa10.48□□□□□ -0.73
SNORD16-201ENST00000362803 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP10.47□□□□□ -0.73
SNORD16-201ENST00000362803 SYNJ2O15056 1496 aa10.46□□□□□ -0.74
SNORD16-201ENST00000362803 PRXQ9BXM0 1461 aa10.45□□□□□ -0.74
SNORD16-201ENST00000362803 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa10.45□□□□□ -0.74
SNORD16-201ENST00000362803 ADAMTS12P58397 1594 aa10.44□□□□□ -0.74
SNORD16-201ENST00000362803 FBLN2P98095 1184 aa10.44□□□□□ -0.74
SNORD16-201ENST00000362803 KIF21BO75037 1637 aa10.42□□□□□ -0.74
SNORD16-201ENST00000362803 GOLGA3Q08378 1498 aa10.42□□□□□ -0.74
SNORD16-201ENST00000362803 GRIN2AQ12879 1464 aa10.41□□□□□ -0.74
SNORD16-201ENST00000362803 UBTFP17480 764 aaKnown RBP10.38□□□□□ -0.75
SNORD16-201ENST00000362803 OSCARQ8IYS5 282 aa10.36□□□□□ -0.75
SNORD16-201ENST00000362803 NUP160Q12769 1436 aa10.34□□□□□ -0.75
SNORD16-201ENST00000362803 EHMT2Q96KQ7 1210 aa10.34□□□□□ -0.75
SNORD16-201ENST00000362803 TNIKQ9UKE5 1360 aa10.33□□□□□ -0.76
SNORD16-201ENST00000362803 CHD1O14646 1710 aa10.33□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.8 ms