RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459159.1

SNORD54-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 54, humanhuman

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Gene SNORD54, Length 67 nt, Biotype snoRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD54-201ENST00000459159 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa1.47□□□□□ -2.17
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SNORD54-201ENST00000459159 HMCN1Q96RW7 5635 aa0.92□□□□□ -2.26
SNORD54-201ENST00000459159 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP0.91□□□□□ -2.26
SNORD54-201ENST00000459159 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP0.84□□□□□ -2.27
SNORD54-201ENST00000459159 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa0.82□□□□□ -2.28
SNORD54-201ENST00000459159 UNC79Q9P2D8 2635 aa0.76□□□□□ -2.29
SNORD54-201ENST00000459159 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa0.75□□□□□ -2.29
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SNORD54-201ENST00000459159 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP0.69□□□□□ -2.3
SNORD54-201ENST00000459159 NOTCH1P46531 2555 aa0.67□□□□□ -2.3
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SNORD54-201ENST00000459159 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa0.64□□□□□ -2.31
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SNORD54-201ENST00000459159 KMT2DO14686 5537 aa0.61□□□□□ -2.31
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SNORD54-201ENST00000459159 FSIP2Q5CZC0 6907 aa0.61□□□□□ -2.31
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SNORD54-201ENST00000459159 UBR4Q5T4S7 5183 aa0.55□□□□□ -2.32
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SNORD54-201ENST00000459159 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa0.29□□□□□ -2.36
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SNORD54-201ENST00000459159 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa0.26□□□□□ -2.37
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SNORD54-201ENST00000459159 HIVEP1P15822 2718 aa0.25□□□□□ -2.37
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SNORD54-201ENST00000459159 PKD1L2Q7Z442 2459 aa0.23□□□□□ -2.37
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SNORD54-201ENST00000459159 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP0.22□□□□□ -2.37
SNORD54-201ENST00000459159 NOTCH2Q04721 2471 aa0.22□□□□□ -2.37
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SNORD54-201ENST00000459159 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa0.21□□□□□ -2.38
SNORD54-201ENST00000459159 DACH1Q9UI36 760 aa0.21□□□□□ -2.38
SNORD54-201ENST00000459159 CACNA1GO43497 2377 aa0.21□□□□□ -2.38
SNORD54-201ENST00000459159 HYDINQ4G0P3 5121 aa0.2□□□□□ -2.38
SNORD54-201ENST00000459159 LURAP1LQ8IV03 231 aa0.2□□□□□ -2.38
SNORD54-201ENST00000459159 CHD8Q9HCK8 2581 aa0.19□□□□□ -2.38
SNORD54-201ENST00000459159 NAV2Q8IVL1 2488 aa0.19□□□□□ -2.38
SNORD54-201ENST00000459159 STAB2Q8WWQ8 2551 aa0.18□□□□□ -2.38
SNORD54-201ENST00000459159 RYR3Q15413 4870 aa0.18□□□□□ -2.38
SNORD54-201ENST00000459159 VWFP04275 2813 aa0.18□□□□□ -2.38
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