RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459159.1

SNORD54-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 54, humanhuman

BASIC

Gene SNORD54, Length 67 nt, Biotype snoRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD54-201ENST00000459159 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa1.47□□□□□ -2.17
SNORD54-201ENST00000459159 GPR98Q8WXG9 6306 aa1.19□□□□□ -2.22
SNORD54-201ENST00000459159 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP0.95□□□□□ -2.26
SNORD54-201ENST00000459159 HMCN1Q96RW7 5635 aa0.92□□□□□ -2.26
SNORD54-201ENST00000459159 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP0.91□□□□□ -2.26
SNORD54-201ENST00000459159 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP0.84□□□□□ -2.27
SNORD54-201ENST00000459159 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa0.82□□□□□ -2.28
SNORD54-201ENST00000459159 UNC79Q9P2D8 2635 aa0.76□□□□□ -2.29
SNORD54-201ENST00000459159 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa0.75□□□□□ -2.29
SNORD54-201ENST00000459159 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP0.7□□□□□ -2.3
SNORD54-201ENST00000459159 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP0.69□□□□□ -2.3
SNORD54-201ENST00000459159 NOTCH1P46531 2555 aa0.67□□□□□ -2.3
SNORD54-201ENST00000459159 NEBP20929 6669 aa0.66□□□□□ -2.3
SNORD54-201ENST00000459159 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP0.65□□□□□ -2.3
SNORD54-201ENST00000459159 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa0.64□□□□□ -2.31
SNORD54-201ENST00000459159 PCLOQ9Y6V0 5065 aa0.63□□□□□ -2.31
SNORD54-201ENST00000459159 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP0.61□□□□□ -2.31
SNORD54-201ENST00000459159 KMT2DO14686 5537 aa0.61□□□□□ -2.31
SNORD54-201ENST00000459159 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP0.61□□□□□ -2.31
SNORD54-201ENST00000459159 CRCT1Q9UGL9 99 aa0.61□□□□□ -2.31
SNORD54-201ENST00000459159 TTC28Q96AY4 2481 aa0.61□□□□□ -2.31
SNORD54-201ENST00000459159 FSIP2Q5CZC0 6907 aa0.61□□□□□ -2.31
SNORD54-201ENST00000459159 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP0.6□□□□□ -2.31
SNORD54-201ENST00000459159 MDN1Q9NU22 5596 aa0.59□□□□□ -2.31
SNORD54-201ENST00000459159 MUC5ACP98088 5654 aa0.59□□□□□ -2.32
SNORD54-201ENST00000459159 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP0.55□□□□□ -2.32
SNORD54-201ENST00000459159 UBR4Q5T4S7 5183 aa0.55□□□□□ -2.32
SNORD54-201ENST00000459159 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP0.54□□□□□ -2.32
SNORD54-201ENST00000459159 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa0.54□□□□□ -2.32
SNORD54-201ENST00000459159 MUC2Q02817 5179 aa0.51□□□□□ -2.33
SNORD54-201ENST00000459159 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP0.5□□□□□ -2.33
SNORD54-201ENST00000459159 COL6A3P12111 3177 aa0.49□□□□□ -2.33
SNORD54-201ENST00000459159 CACNA1AO00555 2505 aa0.47□□□□□ -2.33
SNORD54-201ENST00000459159 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa0.43□□□□□ -2.34
SNORD54-201ENST00000459159 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa0.43□□□□□ -2.34
SNORD54-201ENST00000459159 USP24Q9UPU5 2620 aa0.42□□□□□ -2.34
SNORD54-201ENST00000459159 KIAA1109Q2LD37 5005 aa0.41□□□□□ -2.34
SNORD54-201ENST00000459159 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa0.41□□□□□ -2.34
SNORD54-201ENST00000459159 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa0.41□□□□□ -2.34
SNORD54-201ENST00000459159 SSPOA2VEC9 5147 aa0.4□□□□□ -2.34
SNORD54-201ENST00000459159 IGSF5Q9NSI5 407 aa0.4□□□□□ -2.35
SNORD54-201ENST00000459159 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP0.38□□□□□ -2.35
SNORD54-201ENST00000459159 XP32Q5T750 250 aa0.38□□□□□ -2.35
SNORD54-201ENST00000459159 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa0.37□□□□□ -2.35
SNORD54-201ENST00000459159 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa0.37□□□□□ -2.35
SNORD54-201ENST00000459159 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa0.37□□□□□ -2.35
SNORD54-201ENST00000459159 STAB1Q9NY15 2570 aa0.36□□□□□ -2.35
SNORD54-201ENST00000459159 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa0.36□□□□□ -2.35
SNORD54-201ENST00000459159 NCOR2Q9Y618 2525 aa0.36□□□□□ -2.35
SNORD54-201ENST00000459159 RYR1P21817 5038 aa0.36□□□□□ -2.35
SNORD54-201ENST00000459159 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa0.35□□□□□ -2.35
SNORD54-201ENST00000459159 RNF213Q63HN8 5207 aa0.35□□□□□ -2.35
SNORD54-201ENST00000459159 RYR2Q92736 4967 aa0.35□□□□□ -2.35
SNORD54-201ENST00000459159 SONP18583 2426 aaKnown RBP0.34□□□□□ -2.35
SNORD54-201ENST00000459159 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP0.34□□□□□ -2.36
SNORD54-201ENST00000459159 MUC12Q9UKN1 5478 aa0.34□□□□□ -2.36
SNORD54-201ENST00000459159 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa0.33□□□□□ -2.36
SNORD54-201ENST00000459159 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa0.32□□□□□ -2.36
SNORD54-201ENST00000459159 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP0.31□□□□□ -2.36
SNORD54-201ENST00000459159 KRTAP5-2Q701N4 177 aa0.31□□□□□ -2.36
SNORD54-201ENST00000459159 SPTBN4Q9H254 2564 aa0.31□□□□□ -2.36
SNORD54-201ENST00000459159 LOC100996750A0A140TA64 210 aa0.3□□□□□ -2.36
SNORD54-201ENST00000459159 BPTFQ12830 3046 aa0.29□□□□□ -2.36
SNORD54-201ENST00000459159 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa0.29□□□□□ -2.36
SNORD54-201ENST00000459159 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa0.29□□□□□ -2.36
SNORD54-201ENST00000459159 FAT4Q6V0I7 4981 aa0.29□□□□□ -2.36
SNORD54-201ENST00000459159 CUL9Q8IWT3 2517 aa0.29□□□□□ -2.36
SNORD54-201ENST00000459159 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP0.28□□□□□ -2.36
SNORD54-201ENST00000459159 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa0.28□□□□□ -2.36
SNORD54-201ENST00000459159 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa0.27□□□□□ -2.37
SNORD54-201ENST00000459159 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa0.27□□□□□ -2.37
SNORD54-201ENST00000459159 OBSCNQ5VST9 7968 aa0.27□□□□□ -2.37
SNORD54-201ENST00000459159 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa0.26□□□□□ -2.37
SNORD54-201ENST00000459159 PTPN13Q12923 2485 aa0.26□□□□□ -2.37
SNORD54-201ENST00000459159 FBN3Q75N90 2809 aa0.26□□□□□ -2.37
SNORD54-201ENST00000459159 HIVEP1P15822 2718 aa0.25□□□□□ -2.37
SNORD54-201ENST00000459159 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP0.23□□□□□ -2.37
SNORD54-201ENST00000459159 MUC19Q7Z5P9 8384 aa0.23□□□□□ -2.37
SNORD54-201ENST00000459159 PKD1L2Q7Z442 2459 aa0.23□□□□□ -2.37
SNORD54-201ENST00000459159 KRTAP5-9P26371 169 aa0.22□□□□□ -2.37
SNORD54-201ENST00000459159 KRT32Q14532 448 aa0.22□□□□□ -2.37
SNORD54-201ENST00000459159 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP0.22□□□□□ -2.37
SNORD54-201ENST00000459159 NOTCH2Q04721 2471 aa0.22□□□□□ -2.37
SNORD54-201ENST00000459159 HMCN2Q8NDA2 5059 aa0.22□□□□□ -2.37
SNORD54-201ENST00000459159 CREBBPQ92793 2442 aa0.22□□□□□ -2.37
SNORD54-201ENST00000459159 ABCA13Q86UQ4 5058 aa0.21□□□□□ -2.38
SNORD54-201ENST00000459159 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP0.21□□□□□ -2.38
SNORD54-201ENST00000459159 NCOR1O75376 2440 aa0.21□□□□□ -2.38
SNORD54-201ENST00000459159 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa0.21□□□□□ -2.38
SNORD54-201ENST00000459159 ILDR2Q71H61 639 aa0.21□□□□□ -2.38
SNORD54-201ENST00000459159 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa0.21□□□□□ -2.38
SNORD54-201ENST00000459159 DACH1Q9UI36 760 aa0.21□□□□□ -2.38
SNORD54-201ENST00000459159 CACNA1GO43497 2377 aa0.21□□□□□ -2.38
SNORD54-201ENST00000459159 HYDINQ4G0P3 5121 aa0.2□□□□□ -2.38
SNORD54-201ENST00000459159 LURAP1LQ8IV03 231 aa0.2□□□□□ -2.38
SNORD54-201ENST00000459159 CHD8Q9HCK8 2581 aa0.19□□□□□ -2.38
SNORD54-201ENST00000459159 NAV2Q8IVL1 2488 aa0.19□□□□□ -2.38
SNORD54-201ENST00000459159 STAB2Q8WWQ8 2551 aa0.18□□□□□ -2.38
SNORD54-201ENST00000459159 RYR3Q15413 4870 aa0.18□□□□□ -2.38
SNORD54-201ENST00000459159 VWFP04275 2813 aa0.18□□□□□ -2.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.6 ms