RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482464.5

EPB41-210, Transcript of erythrocyte membrane protein band 4.1, humanhuman

TSL 2

Gene EPB41, Length 675 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB41-210ENST00000482464 NISCHQ9Y2I1 1504 aa43.06■■■■■ 4.48
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EPB41-210ENST00000482464 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa36.06■■■■□ 3.36
EPB41-210ENST00000482464 NACADO15069 1562 aa36.05■■■■□ 3.36
EPB41-210ENST00000482464 MYO15BQ96JP2 1530 aa35.92■■■■□ 3.34
EPB41-210ENST00000482464 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP35.87■■■■□ 3.33
EPB41-210ENST00000482464 DCAF8L2P0C7V8 631 aa35.74■■■■□ 3.31
EPB41-210ENST00000482464 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa35.7■■■■□ 3.31
EPB41-210ENST00000482464 UNC13AQ9UPW8 1703 aa35.18■■■■□ 3.22
EPB41-210ENST00000482464 BICRAQ9NZM4 1560 aa35.04■■■■□ 3.2
EPB41-210ENST00000482464 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP34.97■■■■□ 3.19
EPB41-210ENST00000482464 SCRIBQ14160 1630 aa34.84■■■■□ 3.17
EPB41-210ENST00000482464 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa34.74■■■■□ 3.15
EPB41-210ENST00000482464 DNAJC5BQ9UF47 199 aa34.53■■■■□ 3.12
EPB41-210ENST00000482464 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP34.07■■■■□ 3.05
EPB41-210ENST00000482464 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa33.93■■■■□ 3.02
EPB41-210ENST00000482464 CECR2Q9BXF3 1484 aa33.72■■■□□ 2.99
EPB41-210ENST00000482464 SMARCA4P51532 1647 aa33.39■■■□□ 2.94
EPB41-210ENST00000482464 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP33.36■■■□□ 2.93
EPB41-210ENST00000482464 NCAPD3P42695 1498 aa33.31■■■□□ 2.92
EPB41-210ENST00000482464 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa33.27■■■□□ 2.92
EPB41-210ENST00000482464 SMARCA2P51531 1590 aa33.2■■■□□ 2.91
EPB41-210ENST00000482464 PEG3Q9GZU2 1588 aa33.17■■■□□ 2.9
EPB41-210ENST00000482464 MROH2BQ7Z745 1585 aa33.15■■■□□ 2.9
EPB41-210ENST00000482464 HMGXB3Q12766 1538 aa33.12■■■□□ 2.89
EPB41-210ENST00000482464 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP32.93■■■□□ 2.86
EPB41-210ENST00000482464 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP32.77■■■□□ 2.84
EPB41-210ENST00000482464 WIZO95785 1651 aa32.72■■■□□ 2.83
EPB41-210ENST00000482464 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP32.46■■■□□ 2.79
EPB41-210ENST00000482464 NESP48681 1621 aa32.42■■■□□ 2.78
EPB41-210ENST00000482464 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa32.37■■■□□ 2.77
EPB41-210ENST00000482464 CADPSQ9ULU8 1353 aa32.28■■■□□ 2.76
EPB41-210ENST00000482464 ERCC6Q03468 1493 aa32.27■■■□□ 2.76
EPB41-210ENST00000482464 PDS5BQ9NTI5 1447 aa32.15■■■□□ 2.74
EPB41-210ENST00000482464 CFTRP13569 1480 aa32.1■■■□□ 2.73
EPB41-210ENST00000482464 CUX2O14529 1486 aa32.09■■■□□ 2.73
EPB41-210ENST00000482464 CCDC88BA6NC98 1476 aa32.05■■■□□ 2.72
EPB41-210ENST00000482464 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP32.01■■■□□ 2.71
EPB41-210ENST00000482464 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa32■■■□□ 2.71
EPB41-210ENST00000482464 FANCD2Q9BXW9 1451 aa31.88■■■□□ 2.69
EPB41-210ENST00000482464 MRC2Q9UBG0 1479 aa31.84■■■□□ 2.69
EPB41-210ENST00000482464 CEP164Q9UPV0 1460 aa31.84■■■□□ 2.69
EPB41-210ENST00000482464 WDR62O43379 1518 aa31.76■■■□□ 2.68
EPB41-210ENST00000482464 PRDM2Q13029 1718 aa31.74■■■□□ 2.67
EPB41-210ENST00000482464 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP31.67■■■□□ 2.66
EPB41-210ENST00000482464 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP31.59■■■□□ 2.65
EPB41-210ENST00000482464 ABCC8Q09428 1581 aa31.38■■■□□ 2.61
EPB41-210ENST00000482464 TOPBP1Q92547 1522 aa31.37■■■□□ 2.61
EPB41-210ENST00000482464 DNMBPQ6XZF7 1577 aa31.33■■■□□ 2.61
EPB41-210ENST00000482464 IFT140Q96RY7 1462 aa31.21■■■□□ 2.59
EPB41-210ENST00000482464 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa31.17■■■□□ 2.58
EPB41-210ENST00000482464 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP31.11■■■□□ 2.57
EPB41-210ENST00000482464 CUX1P39880 1505 aa31.11■■■□□ 2.57
EPB41-210ENST00000482464 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP31.06■■■□□ 2.56
EPB41-210ENST00000482464 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP31.04■■■□□ 2.56
EPB41-210ENST00000482464 FGD5Q6ZNL6 1462 aa31■■■□□ 2.55
EPB41-210ENST00000482464 SOGA1O94964 1423 aa30.94■■■□□ 2.54
EPB41-210ENST00000482464 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa30.93■■■□□ 2.54
EPB41-210ENST00000482464 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP30.92■■■□□ 2.54
EPB41-210ENST00000482464 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP30.86■■■□□ 2.536e-6■□□□□ 10.9
EPB41-210ENST00000482464 WDR97A6NE52 1622 aa30.84■■■□□ 2.53
EPB41-210ENST00000482464 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP30.84■■■□□ 2.534e-9■■■■■ 38.9
EPB41-210ENST00000482464 TOP2BQ02880 1626 aa30.82■■■□□ 2.52
EPB41-210ENST00000482464 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa30.81■■■□□ 2.52
EPB41-210ENST00000482464 SYNJ1O43426 1573 aa30.79■■■□□ 2.52
EPB41-210ENST00000482464 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP30.76■■■□□ 2.51
EPB41-210ENST00000482464 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa30.74■■■□□ 2.51
EPB41-210ENST00000482464 OSCARQ8IYS5 282 aa30.65■■■□□ 2.5
EPB41-210ENST00000482464 GRIN2BQ13224 1484 aa30.62■■■□□ 2.49
EPB41-210ENST00000482464 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa30.62■■■□□ 2.49
EPB41-210ENST00000482464 GAPVD1Q14C86 1478 aa30.59■■■□□ 2.49
EPB41-210ENST00000482464 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP30.57■■■□□ 2.48
EPB41-210ENST00000482464 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa30.56■■■□□ 2.48
EPB41-210ENST00000482464 CHD1O14646 1710 aa30.47■■■□□ 2.47
EPB41-210ENST00000482464 PBRM1Q86U86 1689 aa30.47■■■□□ 2.47
EPB41-210ENST00000482464 SYNJ2O15056 1496 aa30.44■■■□□ 2.46
EPB41-210ENST00000482464 ERICH3Q5RHP9 1530 aa30.37■■■□□ 2.45
EPB41-210ENST00000482464 FBLN2P98095 1184 aa30.36■■■□□ 2.45
EPB41-210ENST00000482464 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP30.33■■■□□ 2.45
EPB41-210ENST00000482464 ADAMTS12P58397 1594 aa30.31■■■□□ 2.44
EPB41-210ENST00000482464 CLASP1Q7Z460 1538 aa30.27■■■□□ 2.44
EPB41-210ENST00000482464 FHAD1B1AJZ9 1412 aa30.26■■■□□ 2.43
EPB41-210ENST00000482464 GRIN2AQ12879 1464 aa30.23■■■□□ 2.43
EPB41-210ENST00000482464 KIF27Q86VH2 1401 aa30.22■■■□□ 2.43
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EPB41-210ENST00000482464 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa30.18■■■□□ 2.42
EPB41-210ENST00000482464 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa30.18■■■□□ 2.42
EPB41-210ENST00000482464 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa30.18■■■□□ 2.42
EPB41-210ENST00000482464 NUP160Q12769 1436 aa30.15■■■□□ 2.42
EPB41-210ENST00000482464 IGF1RP08069 1367 aa30.15■■■□□ 2.42
EPB41-210ENST00000482464 CEP170Q5SW79 1584 aa30.07■■■□□ 2.4
EPB41-210ENST00000482464 CUL7Q14999 1698 aa30.03■■■□□ 2.4
EPB41-210ENST00000482464 TRIM41Q8WV44 630 aa29.97■■■□□ 2.39
EPB41-210ENST00000482464 ARAP1Q96P48 1450 aa29.97■■■□□ 2.39
EPB41-210ENST00000482464 SHROOM2Q13796 1616 aa29.92■■■□□ 2.38
EPB41-210ENST00000482464 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa29.91■■■□□ 2.38
EPB41-210ENST00000482464 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa29.9■■■□□ 2.38
EPB41-210ENST00000482464 CYB5RLQ6IPT4 315 aa29.83■■■□□ 2.37
EPB41-210ENST00000482464 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa29.81■■■□□ 2.36
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