RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497648.1

RABGGTB-214, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 1,319 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-214ENST00000497648 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
RABGGTB-214ENST00000497648 CHIC1Q5VXU3 224 aa25.82■■□□□ 1.72
RABGGTB-214ENST00000497648 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
RABGGTB-214ENST00000497648 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.18
RABGGTB-214ENST00000497648 PLPPR3Q6T4P5 718 aa20.9■□□□□ 0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 FOXD1Q16676 465 aa20.86■□□□□ 0.93
RABGGTB-214ENST00000497648 PPP6R1Q9UPN7 881 aa20.09■□□□□ 0.81
RABGGTB-214ENST00000497648 ADRA2BP18089 450 aa20.02■□□□□ 0.8
RABGGTB-214ENST00000497648 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP19.6■□□□□ 0.73
RABGGTB-214ENST00000497648 MSH5O43196 834 aa19.16■□□□□ 0.66
RABGGTB-214ENST00000497648 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa18.45■□□□□ 0.54
RABGGTB-214ENST00000497648 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP18.21■□□□□ 0.51
RABGGTB-214ENST00000497648 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
RABGGTB-214ENST00000497648 KCNA4P22459 653 aa18.01■□□□□ 0.47
RABGGTB-214ENST00000497648 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa17.92■□□□□ 0.46
RABGGTB-214ENST00000497648 DMRT2Q9Y5R5 561 aa17.92■□□□□ 0.46
RABGGTB-214ENST00000497648 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP17.88■□□□□ 0.45
RABGGTB-214ENST00000497648 NPM3O75607 178 aaKnown RBP17.72■□□□□ 0.43
RABGGTB-214ENST00000497648 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP17.58■□□□□ 0.4
RABGGTB-214ENST00000497648 POTEDQ86YR6 584 aa17.57■□□□□ 0.4
RABGGTB-214ENST00000497648 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP17.55■□□□□ 0.4
RABGGTB-214ENST00000497648 DNAJC5BQ9UF47 199 aa17.23■□□□□ 0.35
RABGGTB-214ENST00000497648 NISCHQ9Y2I1 1504 aa17.2■□□□□ 0.34
RABGGTB-214ENST00000497648 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP17.09■□□□□ 0.33
RABGGTB-214ENST00000497648 DCAF8L1A6NGE4 600 aa17.05■□□□□ 0.32
RABGGTB-214ENST00000497648 SLC24A1O60721 1099 aa16.77■□□□□ 0.28
RABGGTB-214ENST00000497648 SLC4A2P04920 1241 aa16.77■□□□□ 0.28
RABGGTB-214ENST00000497648 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP16.64■□□□□ 0.253e-7■■□□□ 13.1
RABGGTB-214ENST00000497648 ZBTB22O15209 634 aa16.63■□□□□ 0.25
RABGGTB-214ENST00000497648 EHMT2Q96KQ7 1210 aa16.57■□□□□ 0.24
RABGGTB-214ENST00000497648 FOXD4L1Q9NU39 408 aa16.54■□□□□ 0.24
RABGGTB-214ENST00000497648 CSRNP3Q8WYN3 585 aa16.47■□□□□ 0.23
RABGGTB-214ENST00000497648 RNF39Q9H2S5 420 aa16.47■□□□□ 0.23
RABGGTB-214ENST00000497648 MYT1Q01538 1121 aa16.45■□□□□ 0.22
RABGGTB-214ENST00000497648 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP16.45■□□□□ 0.22
RABGGTB-214ENST00000497648 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP16.32■□□□□ 0.2
RABGGTB-214ENST00000497648 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP16.29■□□□□ 0.2
RABGGTB-214ENST00000497648 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
RABGGTB-214ENST00000497648 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
RABGGTB-214ENST00000497648 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
RABGGTB-214ENST00000497648 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
RABGGTB-214ENST00000497648 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
RABGGTB-214ENST00000497648 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
RABGGTB-214ENST00000497648 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
RABGGTB-214ENST00000497648 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
RABGGTB-214ENST00000497648 ATXN8OSP0DMR3 200 aa15.96■□□□□ 0.15
RABGGTB-214ENST00000497648 APLP2Q06481 763 aa15.93■□□□□ 0.14
RABGGTB-214ENST00000497648 CAPN15O75808 1086 aa15.86■□□□□ 0.13
RABGGTB-214ENST00000497648 TRHP20396 242 aaPredicted RBP15.79■□□□□ 0.12
RABGGTB-214ENST00000497648 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP15.77■□□□□ 0.12
RABGGTB-214ENST00000497648 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP15.7■□□□□ 0.1
RABGGTB-214ENST00000497648 DSG3P32926 999 aa15.68■□□□□ 0.1
RABGGTB-214ENST00000497648 ABCB7O75027 752 aa15.6■□□□□ 0.09
RABGGTB-214ENST00000497648 POLA2Q14181 598 aa15.55■□□□□ 0.08
RABGGTB-214ENST00000497648 ERICH6Q7L0X2 663 aa15.51■□□□□ 0.07
RABGGTB-214ENST00000497648 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa15.29■□□□□ 0.04
RABGGTB-214ENST00000497648 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP15.27■□□□□ 0.04
RABGGTB-214ENST00000497648 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP15.23■□□□□ 0.03
RABGGTB-214ENST00000497648 FBLN2P98095 1184 aa15.17■□□□□ 0.02
RABGGTB-214ENST00000497648 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP15.04■□□□□ -0
RABGGTB-214ENST00000497648 OSCARQ8IYS5 282 aa15.03■□□□□ -0
RABGGTB-214ENST00000497648 ABCC9O60706 1549 aa14.88□□□□□ -0.03
RABGGTB-214ENST00000497648 SPDYE2BA6NHP3 402 aa14.87□□□□□ -0.03
RABGGTB-214ENST00000497648 SPDYE6P0CI01 402 aa14.87□□□□□ -0.03
RABGGTB-214ENST00000497648 SPDYE2Q495Y8 402 aa14.87□□□□□ -0.03
RABGGTB-214ENST00000497648 SPDYE4A6NLX3 237 aa14.84□□□□□ -0.03
RABGGTB-214ENST00000497648 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
RABGGTB-214ENST00000497648 FKBP8Q14318 412 aa14.83□□□□□ -0.04
RABGGTB-214ENST00000497648 SSUH2Q9Y2M2 353 aa14.8□□□□□ -0.04
RABGGTB-214ENST00000497648 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
RABGGTB-214ENST00000497648 ARXQ96QS3 562 aa14.76□□□□□ -0.05
RABGGTB-214ENST00000497648 AKT1S1Q96B36 256 aa14.7□□□□□ -0.06
RABGGTB-214ENST00000497648 PROM2Q8N271 834 aa14.67□□□□□ -0.06
RABGGTB-214ENST00000497648 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
RABGGTB-214ENST00000497648 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP14.61□□□□□ -0.07
RABGGTB-214ENST00000497648 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
RABGGTB-214ENST00000497648 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
RABGGTB-214ENST00000497648 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
RABGGTB-214ENST00000497648 PITPNM1O00562 1244 aa14.43□□□□□ -0.1
RABGGTB-214ENST00000497648 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP14.41□□□□□ -0.1
RABGGTB-214ENST00000497648 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP14.37□□□□□ -0.11
RABGGTB-214ENST00000497648 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP14.36□□□□□ -0.11
RABGGTB-214ENST00000497648 CLEC11AQ9Y240 323 aa14.35□□□□□ -0.11
RABGGTB-214ENST00000497648 STAG3Q9UJ98 1225 aa14.32□□□□□ -0.12
RABGGTB-214ENST00000497648 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa14.3□□□□□ -0.12
RABGGTB-214ENST00000497648 NACADO15069 1562 aa14.29□□□□□ -0.12
RABGGTB-214ENST00000497648 DCAF8L2P0C7V8 631 aa14.28□□□□□ -0.12
RABGGTB-214ENST00000497648 CHRDL2Q6WN34 429 aa14.28□□□□□ -0.12
RABGGTB-214ENST00000497648 FBXO3Q9UK99 471 aa14.25□□□□□ -0.13
RABGGTB-214ENST00000497648 PRR29P0C7W0 189 aa14.21□□□□□ -0.13
RABGGTB-214ENST00000497648 HOMEZQ8IX15 550 aa14.2□□□□□ -0.14
RABGGTB-214ENST00000497648 MYO15BQ96JP2 1530 aa14.19□□□□□ -0.14
RABGGTB-214ENST00000497648 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa14.19□□□□□ -0.14
RABGGTB-214ENST00000497648 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP14.18□□□□□ -0.14
RABGGTB-214ENST00000497648 UNC13AQ9UPW8 1703 aa14.17□□□□□ -0.14
RABGGTB-214ENST00000497648 PIP4P2Q8N4L2 257 aa14.14□□□□□ -0.15
RABGGTB-214ENST00000497648 VASPP50552 380 aaPredicted RBP14.12□□□□□ -0.15
RABGGTB-214ENST00000497648 CREBZFQ9NS37 354 aa14.11□□□□□ -0.15
RABGGTB-214ENST00000497648 CHADLQ6NUI6 762 aa14.06□□□□□ -0.16
RABGGTB-214ENST00000497648 MIER1Q8N108 512 aa14.04□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.3 ms