Protein–RNA interactions for Protein: Q12766

HMGXB3, HMG domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 1,538 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB3Q12766 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC53.69■■■■■ 6.19
HMGXB3Q12766 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC53.68■■■■■ 6.18
HMGXB3Q12766 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC53.64■■■■■ 6.18
HMGXB3Q12766 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.64■■■■■ 6.18
HMGXB3Q12766 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC53.6■■■■■ 6.17
HMGXB3Q12766 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.5■■■■■ 6.15
HMGXB3Q12766 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC53.47■■■■■ 6.15
HMGXB3Q12766 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC53.46■■■■■ 6.15
HMGXB3Q12766 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC53.35■■■■■ 6.13
HMGXB3Q12766 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC53.34■■■■■ 6.13
HMGXB3Q12766 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC53.28■■■■■ 6.12
HMGXB3Q12766 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC53.2■■■■■ 6.11
HMGXB3Q12766 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC53.19■■■■■ 6.11
HMGXB3Q12766 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC53.15■■■■■ 6.1
HMGXB3Q12766 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.13■■■■■ 6.1
HMGXB3Q12766 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC53.09■■■■■ 6.09
HMGXB3Q12766 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC53.03■■■■■ 6.08
HMGXB3Q12766 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53■■■■■ 6.07
HMGXB3Q12766 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC52.99■■■■■ 6.07
HMGXB3Q12766 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC52.99■■■■■ 6.07
HMGXB3Q12766 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC52.94■■■■■ 6.07
HMGXB3Q12766 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC52.92■■■■■ 6.06
HMGXB3Q12766 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.86■■■■■ 6.05
HMGXB3Q12766 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.84■■■■■ 6.05
HMGXB3Q12766 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC52.8■■■■■ 6.04
HMGXB3Q12766 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC52.8■■■■■ 6.04
HMGXB3Q12766 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC52.77■■■■■ 6.04
HMGXB3Q12766 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC52.74■■■■■ 6.03
HMGXB3Q12766 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.67■■■■■ 6.02
HMGXB3Q12766 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.66■■■■■ 6.02
HMGXB3Q12766 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC52.66■■■■■ 6.02
HMGXB3Q12766 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.65■■■■■ 6.02
HMGXB3Q12766 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC52.63■■■■■ 6.02
HMGXB3Q12766 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC52.6■■■■■ 6.01
HMGXB3Q12766 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC52.53■■■■■ 6
HMGXB3Q12766 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC52.53■■■■■ 6
HMGXB3Q12766 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC52.53■■■■■ 6
HMGXB3Q12766 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.52■■■■■ 6
HMGXB3Q12766 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC52.5■■■■■ 6
HMGXB3Q12766 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC52.48■■■■■ 5.99
HMGXB3Q12766 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.46■■■■■ 5.99
HMGXB3Q12766 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC52.46■■■■■ 5.99
HMGXB3Q12766 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC52.45■■■■■ 5.99
HMGXB3Q12766 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC52.43■■■■■ 5.98
HMGXB3Q12766 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC52.39■■■■■ 5.98
HMGXB3Q12766 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC52.36■■■■■ 5.97
HMGXB3Q12766 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC52.32■■■■■ 5.97
HMGXB3Q12766 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC52.3■■■■■ 5.96
HMGXB3Q12766 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC52.28■■■■■ 5.96
HMGXB3Q12766 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.27■■■■■ 5.96
HMGXB3Q12766 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC52.27■■■■■ 5.96
HMGXB3Q12766 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC52.26■■■■■ 5.96
HMGXB3Q12766 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC52.24■■■■■ 5.95
HMGXB3Q12766 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC52.2■■■■■ 5.95
HMGXB3Q12766 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC52.15■■■■■ 5.94
HMGXB3Q12766 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC52.13■■■■■ 5.94
HMGXB3Q12766 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.11■■■■■ 5.93
HMGXB3Q12766 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC52.07■■■■■ 5.93
HMGXB3Q12766 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.03■■■■■ 5.92
HMGXB3Q12766 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC51.97■■■■■ 5.91
HMGXB3Q12766 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC51.96■■■■■ 5.91
HMGXB3Q12766 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC51.94■■■■■ 5.91
HMGXB3Q12766 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC51.93■■■■■ 5.9
HMGXB3Q12766 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC51.89■■■■■ 5.9
HMGXB3Q12766 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC51.84■■■■■ 5.89
HMGXB3Q12766 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC51.84■■■■■ 5.89
HMGXB3Q12766 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.84■■■■■ 5.89
HMGXB3Q12766 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC51.8■■■■■ 5.88
HMGXB3Q12766 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC51.79■■■■■ 5.88
HMGXB3Q12766 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.75■■■■■ 5.88
HMGXB3Q12766 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.74■■■■■ 5.87
HMGXB3Q12766 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC51.7■■■■■ 5.87
HMGXB3Q12766 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.7■■■■■ 5.87
HMGXB3Q12766 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC51.64■■■■■ 5.86
HMGXB3Q12766 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC51.63■■■■■ 5.85
HMGXB3Q12766 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.6■■■■■ 5.85
HMGXB3Q12766 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.58■■■■■ 5.85
HMGXB3Q12766 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC51.57■■■■■ 5.85
HMGXB3Q12766 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC51.57■■■■■ 5.85
HMGXB3Q12766 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.56■■■■■ 5.84
HMGXB3Q12766 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC51.55■■■■■ 5.84
HMGXB3Q12766 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC51.52■■■■■ 5.84
HMGXB3Q12766 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC51.48■■■■■ 5.83
HMGXB3Q12766 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.46■■■■■ 5.83
HMGXB3Q12766 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.42■■■■■ 5.82
HMGXB3Q12766 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC51.41■■■■■ 5.82
HMGXB3Q12766 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC51.4■■■■■ 5.82
HMGXB3Q12766 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC51.4■■■■■ 5.82
HMGXB3Q12766 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC51.38■■■■■ 5.82
HMGXB3Q12766 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.38■■■■■ 5.82
HMGXB3Q12766 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC51.37■■■■■ 5.81
HMGXB3Q12766 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC51.37■■■■■ 5.81
HMGXB3Q12766 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC51.37■■■■■ 5.81
HMGXB3Q12766 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC51.34■■■■■ 5.81
HMGXB3Q12766 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.32■■■■■ 5.81
HMGXB3Q12766 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC51.32■■■■■ 5.81
HMGXB3Q12766 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC51.3■■■■■ 5.8
HMGXB3Q12766 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC51.27■■■■■ 5.8
HMGXB3Q12766 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC51.27■■■■■ 5.8
HMGXB3Q12766 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC51.26■■■■■ 5.8
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