Protein–RNA interactions for Protein: P36405

ARL3, ADP-ribosylation factor-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL3P36405 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ARL3P36405 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ARL3P36405 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ARL3P36405 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ARL3P36405 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
ARL3P36405 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARL3P36405 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARL3P36405 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARL3P36405 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARL3P36405 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARL3P36405 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ARL3P36405 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARL3P36405 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARL3P36405 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARL3P36405 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARL3P36405 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARL3P36405 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARL3P36405 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARL3P36405 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARL3P36405 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARL3P36405 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARL3P36405 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARL3P36405 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARL3P36405 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARL3P36405 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARL3P36405 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARL3P36405 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARL3P36405 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARL3P36405 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARL3P36405 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARL3P36405 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARL3P36405 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARL3P36405 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARL3P36405 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ARL3P36405 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARL3P36405 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARL3P36405 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARL3P36405 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARL3P36405 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ARL3P36405 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARL3P36405 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARL3P36405 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARL3P36405 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ARL3P36405 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ARL3P36405 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARL3P36405 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARL3P36405 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARL3P36405 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARL3P36405 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARL3P36405 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARL3P36405 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARL3P36405 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARL3P36405 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARL3P36405 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARL3P36405 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARL3P36405 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARL3P36405 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARL3P36405 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARL3P36405 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARL3P36405 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARL3P36405 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARL3P36405 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARL3P36405 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARL3P36405 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARL3P36405 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARL3P36405 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARL3P36405 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARL3P36405 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARL3P36405 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARL3P36405 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARL3P36405 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARL3P36405 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARL3P36405 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARL3P36405 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARL3P36405 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARL3P36405 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARL3P36405 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARL3P36405 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARL3P36405 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ARL3P36405 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARL3P36405 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARL3P36405 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARL3P36405 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARL3P36405 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARL3P36405 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARL3P36405 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARL3P36405 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARL3P36405 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARL3P36405 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARL3P36405 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARL3P36405 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARL3P36405 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARL3P36405 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARL3P36405 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARL3P36405 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARL3P36405 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARL3P36405 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARL3P36405 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARL3P36405 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARL3P36405 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms