Protein–RNA interactions for Protein: H3BU77

CCDC179, Coiled-coil domain-containing protein 179, humanhuman

Predictions only

Length 68 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC179H3BU77 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC179H3BU77 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC179H3BU77 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC179H3BU77 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC179H3BU77 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC179H3BU77 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC179H3BU77 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC179H3BU77 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC179H3BU77 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC179H3BU77 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC179H3BU77 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC179H3BU77 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC179H3BU77 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC179H3BU77 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC179H3BU77 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC179H3BU77 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC179H3BU77 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC179H3BU77 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC179H3BU77 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC179H3BU77 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC179H3BU77 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC179H3BU77 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC179H3BU77 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC179H3BU77 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC179H3BU77 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC179H3BU77 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC179H3BU77 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC179H3BU77 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC179H3BU77 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC179H3BU77 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC179H3BU77 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC179H3BU77 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC179H3BU77 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC179H3BU77 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC179H3BU77 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC179H3BU77 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC179H3BU77 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC179H3BU77 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC179H3BU77 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC179H3BU77 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC179H3BU77 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC179H3BU77 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC179H3BU77 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC179H3BU77 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC179H3BU77 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC179H3BU77 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC179H3BU77 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC179H3BU77 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC179H3BU77 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC179H3BU77 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC179H3BU77 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC179H3BU77 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC179H3BU77 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC179H3BU77 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC179H3BU77 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC179H3BU77 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC179H3BU77 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC179H3BU77 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC179H3BU77 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CCDC179H3BU77 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC179H3BU77 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC179H3BU77 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC179H3BU77 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC179H3BU77 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC179H3BU77 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC179H3BU77 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC179H3BU77 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC179H3BU77 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC179H3BU77 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC179H3BU77 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC179H3BU77 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC179H3BU77 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC179H3BU77 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC179H3BU77 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC179H3BU77 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC179H3BU77 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC179H3BU77 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC179H3BU77 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC179H3BU77 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC179H3BU77 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC179H3BU77 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC179H3BU77 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC179H3BU77 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC179H3BU77 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC179H3BU77 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC179H3BU77 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC179H3BU77 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC179H3BU77 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC179H3BU77 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC179H3BU77 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC179H3BU77 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC179H3BU77 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC179H3BU77 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC179H3BU77 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC179H3BU77 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC179H3BU77 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC179H3BU77 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC179H3BU77 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC179H3BU77 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC179H3BU77 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms