Protein–RNA interactions for Protein: C9JCN9

HSBP1L1, Heat shock factor-binding protein 1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 74 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSBP1L1C9JCN9 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HSBP1L1C9JCN9 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HSBP1L1C9JCN9 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HSBP1L1C9JCN9 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HSBP1L1C9JCN9 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HSBP1L1C9JCN9 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HSBP1L1C9JCN9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HSBP1L1C9JCN9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HSBP1L1C9JCN9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HSBP1L1C9JCN9 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HSBP1L1C9JCN9 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HSBP1L1C9JCN9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HSBP1L1C9JCN9 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HSBP1L1C9JCN9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HSBP1L1C9JCN9 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HSBP1L1C9JCN9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HSBP1L1C9JCN9 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HSBP1L1C9JCN9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HSBP1L1C9JCN9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HSBP1L1C9JCN9 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HSBP1L1C9JCN9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HSBP1L1C9JCN9 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HSBP1L1C9JCN9 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HSBP1L1C9JCN9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HSBP1L1C9JCN9 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HSBP1L1C9JCN9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HSBP1L1C9JCN9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HSBP1L1C9JCN9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HSBP1L1C9JCN9 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HSBP1L1C9JCN9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HSBP1L1C9JCN9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HSBP1L1C9JCN9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HSBP1L1C9JCN9 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HSBP1L1C9JCN9 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HSBP1L1C9JCN9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HSBP1L1C9JCN9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HSBP1L1C9JCN9 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HSBP1L1C9JCN9 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HSBP1L1C9JCN9 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HSBP1L1C9JCN9 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HSBP1L1C9JCN9 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HSBP1L1C9JCN9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HSBP1L1C9JCN9 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HSBP1L1C9JCN9 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HSBP1L1C9JCN9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HSBP1L1C9JCN9 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HSBP1L1C9JCN9 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HSBP1L1C9JCN9 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HSBP1L1C9JCN9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HSBP1L1C9JCN9 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HSBP1L1C9JCN9 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HSBP1L1C9JCN9 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HSBP1L1C9JCN9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HSBP1L1C9JCN9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HSBP1L1C9JCN9 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HSBP1L1C9JCN9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HSBP1L1C9JCN9 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HSBP1L1C9JCN9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HSBP1L1C9JCN9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HSBP1L1C9JCN9 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HSBP1L1C9JCN9 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HSBP1L1C9JCN9 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HSBP1L1C9JCN9 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HSBP1L1C9JCN9 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HSBP1L1C9JCN9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HSBP1L1C9JCN9 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HSBP1L1C9JCN9 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HSBP1L1C9JCN9 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HSBP1L1C9JCN9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HSBP1L1C9JCN9 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HSBP1L1C9JCN9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HSBP1L1C9JCN9 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HSBP1L1C9JCN9 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HSBP1L1C9JCN9 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
HSBP1L1C9JCN9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HSBP1L1C9JCN9 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HSBP1L1C9JCN9 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HSBP1L1C9JCN9 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
HSBP1L1C9JCN9 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HSBP1L1C9JCN9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HSBP1L1C9JCN9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HSBP1L1C9JCN9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
HSBP1L1C9JCN9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
HSBP1L1C9JCN9 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HSBP1L1C9JCN9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HSBP1L1C9JCN9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HSBP1L1C9JCN9 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HSBP1L1C9JCN9 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HSBP1L1C9JCN9 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HSBP1L1C9JCN9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HSBP1L1C9JCN9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HSBP1L1C9JCN9 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HSBP1L1C9JCN9 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HSBP1L1C9JCN9 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HSBP1L1C9JCN9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HSBP1L1C9JCN9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HSBP1L1C9JCN9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HSBP1L1C9JCN9 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HSBP1L1C9JCN9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HSBP1L1C9JCN9 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.9 ms