Protein–RNA interactions for Protein: Q13283

G3BP1, Ras GTPase-activating protein-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
G3BP1Q13283 NASP-203ENST00000372052 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.882e-6■□□□□ 9.5
G3BP1Q13283 NASP-218ENST00000530073 2740 ntTSL 29.5□□□□□ -0.891e-6■□□□□ 9.5
G3BP1Q13283 DEK-206ENST00000512145 791 ntTSL 58.47□□□□□ -1.052e-6■□□□□ 9.5
G3BP1Q13283 NASP-210ENST00000481782 3659 ntTSL 28.4□□□□□ -1.071e-6■□□□□ 9.5
G3BP1Q13283 SEC23IP-204ENST00000462222 552 ntTSL 38.23□□□□□ -1.092e-6■□□□□ 9.5
G3BP1Q13283 DEK-208ENST00000515770 730 ntTSL 56.66□□□□□ -1.342e-6■□□□□ 9.5
G3BP1Q13283 ACAA2-204ENST00000586485 727 ntTSL 26.55□□□□□ -1.362e-6■□□□□ 9.5
G3BP1Q13283 DEK-205ENST00000507591 739 ntTSL 26.36□□□□□ -1.392e-6■□□□□ 9.5
G3BP1Q13283 BIRC6-206ENST00000465130 910 ntTSL 25.8□□□□□ -1.482e-6■□□□□ 9.5
G3BP1Q13283 USO1-202ENST00000508454 365 ntTSL 35.56□□□□□ -1.522e-6■□□□□ 9.5
G3BP1Q13283 NASP-222ENST00000534101 754 ntTSL 35.23□□□□□ -1.572e-6■□□□□ 9.5
G3BP1Q13283 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.782e-8■□□□□ 9.5
G3BP1Q13283 RRBP1-205ENST00000398782 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 230.15■■■□□ 2.423e-17■□□□□ 9.5
G3BP1Q13283 CTNNA1-221ENST00000520339 868 ntTSL 311.43□□□□□ -0.582e-10■□□□□ 9.5
G3BP1Q13283 CTNNA1-241ENST00000524127 483 ntTSL 45.73□□□□□ -1.492e-10■□□□□ 9.5
G3BP1Q13283 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.247e-7■□□□□ 9.5
G3BP1Q13283 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.187e-7■□□□□ 9.5
G3BP1Q13283 TGFBR3-202ENST00000370399 4550 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.017e-7■□□□□ 9.5
G3BP1Q13283 TGFBR3-207ENST00000525962 3927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.087e-7■□□□□ 9.5
G3BP1Q13283 TGFBR3-210ENST00000533089 6455 ntTSL 1 (best)8.24□□□□□ -1.097e-7■□□□□ 9.5
G3BP1Q13283 TGFBR3-209ENST00000532540 3913 ntTSL 1 (best)7.88□□□□□ -1.157e-7■□□□□ 9.5
G3BP1Q13283 ST13-201ENST00000216218 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.236e-7■□□□□ 9.5
G3BP1Q13283 ST13-207ENST00000620312 944 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.736e-7■□□□□ 9.5
G3BP1Q13283 IPO5-215ENST00000480641 543 ntTSL 429.58■■■□□ 2.333e-6■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 IPO5-212ENST00000475420 883 ntTSL 423.39■■□□□ 1.333e-6■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 IPO5-228ENST00000497270 536 ntTSL 416.75■□□□□ 0.273e-6■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 IPO5-203ENST00000403772 547 ntTSL 49.49□□□□□ -0.893e-6■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 SUPT6H-205ENST00000580471 578 ntTSL 210.22□□□□□ -0.772e-8■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 ATF6-202ENST00000476437 778 ntTSL 53.1□□□□□ -1.913e-6■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.385e-6■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 GLDC-202ENST00000460457 386 ntTSL 510.16□□□□□ -0.785e-6■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 AFP-202ENST00000395792 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.213e-45■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 AFP-201ENST00000226359 1914 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.33e-45■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 AFP-204ENST00000508838 728 ntTSL 26.66□□□□□ -1.343e-45■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 AFP-203ENST00000506820 476 ntTSL 23.96□□□□□ -1.783e-45■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 KHSRP-203ENST00000594745 379 ntTSL 317.72■□□□□ 0.432e-7■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 MYH10-204ENST00000411957 732 ntTSL 321.53■■□□□ 1.043e-8■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 RPS16-203ENST00000595386 1035 ntTSL 219.58■□□□□ 0.721e-9■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.411e-9■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 RPS16-201ENST00000251453 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.071e-9■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 RPS16-206ENST00000601390 2389 ntTSL 213.55□□□□□ -0.241e-9■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 RPS16-208ENST00000602153 444 ntTSL 212.86□□□□□ -0.351e-9■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 RPS16-207ENST00000601655 492 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.431e-9■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 RPS16-204ENST00000599539 555 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.481e-9■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 RPS16-205ENST00000599705 407 ntTSL 311.64□□□□□ -0.551e-9■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 DNMT1-221ENST00000589538 559 ntTSL 520.35■□□□□ 0.853e-8■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 APOL1-209ENST00000433768 541 ntTSL 417.17■□□□□ 0.343e-8■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 WDR33-205ENST00000436787 822 ntTSL 517.12■□□□□ 0.333e-8■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 APOL1-204ENST00000422471 561 ntTSL 416.3■□□□□ 0.23e-8■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 DNMT1-201ENST00000340748 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.093e-8■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 DNMT1-203ENST00000540357 4916 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.083e-8■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 DNMT1-228ENST00000592705 5215 ntTSL 1 (best)15.36■□□□□ 0.053e-8■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 APOL1-208ENST00000431184 550 ntTSL 415.31■□□□□ 0.043e-8■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 APOL1-211ENST00000439680 531 ntTSL 415.18■□□□□ 0.023e-8■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 DNMT1-207ENST00000586588 3094 ntTSL 214.94□□□□□ -0.023e-8■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 DNMT1-202ENST00000359526 5206 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.053e-8■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 APOL1-207ENST00000427990 624 ntTSL 314.33□□□□□ -0.123e-8■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 APOL1-210ENST00000438034 566 ntTSL 414.11□□□□□ -0.153e-8■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 APOL1-202ENST00000397278 2918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.413e-8■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 APOL1-212ENST00000475519 600 ntTSL 411.85□□□□□ -0.513e-8■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 DNMT1-223ENST00000591239 550 ntTSL 211.39□□□□□ -0.593e-8■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 APOL1-205ENST00000422706 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.593e-8■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 COPB2-202ENST00000502734 680 ntTSL 211.17□□□□□ -0.623e-8■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 APOL1-206ENST00000426053 2808 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.643e-8■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 APOL1-203ENST00000397279 1564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.733e-8■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 APOL1-201ENST00000319136 3000 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.793e-8■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 SSB-209ENST00000470621 440 ntTSL 35.56□□□□□ -1.523e-8■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 SSB-210ENST00000474273 735 ntTSL 23.89□□□□□ -1.793e-8■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.984e-9■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.814e-9■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 ACOX1-203ENST00000572047 2441 ntTSL 217.15■□□□□ 0.344e-7■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.264e-7■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 ACOX1-204ENST00000573078 2417 ntTSL 213.57□□□□□ -0.244e-7■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 ACOX1-202ENST00000301608 2215 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.434e-7■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 CNOT1-210ENST00000567133 553 ntTSL 513.6□□□□□ -0.233e-6■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 SEPT2-239ENST00000484167 668 ntTSL 24.54□□□□□ -1.681e-7■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 IPO5-210ENST00000471898 556 ntTSL 420.51■□□□□ 0.874e-6■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 IPO5-204ENST00000421861 564 ntTSL 413.72□□□□□ -0.214e-6■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 IPO5-217ENST00000481689 568 ntTSL 411.18□□□□□ -0.624e-6■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 IPO5-206ENST00000463157 493 ntTSL 411.04□□□□□ -0.644e-6■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 IPO5-225ENST00000493281 544 ntTSL 410.98□□□□□ -0.654e-6■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 IPO5-220ENST00000489058 522 ntTSL 410.78□□□□□ -0.684e-6■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 IPO5-221ENST00000490369 542 ntTSL 49.03□□□□□ -0.964e-6■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 IPO5-205ENST00000460070 544 ntTSL 48.15□□□□□ -1.14e-6■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 IPO5-216ENST00000481455 555 ntTSL 48.15□□□□□ -1.14e-6■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 IPO5-229ENST00000631030 192 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.134e-6■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 IPO5-227ENST00000496368 542 ntTSL 46.48□□□□□ -1.374e-6■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 IPO5-219ENST00000485433 524 ntTSL 45.86□□□□□ -1.474e-6■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 IPO5-214ENST00000480611 591 ntTSL 45.79□□□□□ -1.484e-6■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 DST-206ENST00000370788 17657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.574e-7■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 DST-207ENST00000421834 18030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.614e-7■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 DST-202ENST00000312431 17756 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.444e-7■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 DST-201ENST00000244364 16742 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.694e-7■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 DST-204ENST00000361203 22431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.84e-7■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 ACSL4-206ENST00000502391 802 ntTSL 325.65■■□□□ 1.74e-26■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 ACSL4-211ENST00000508092 637 ntTSL 423.26■■□□□ 1.314e-26■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 ACSL4-208ENST00000504980 573 ntTSL 420.84■□□□□ 0.934e-26■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 GNL3-201ENST00000394799 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.14e-6■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 GNL3-202ENST00000418458 2040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.044e-6■□□□□ 9.4
G3BP1Q13283 GNL3-211ENST00000496254 2118 ntTSL 56.8□□□□□ -1.324e-6■□□□□ 9.4
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