Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E4

PCDHB5, Protocadherin beta-5, humanhuman

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB5Q9Y5E4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PCDHB5Q9Y5E4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PCDHB5Q9Y5E4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PCDHB5Q9Y5E4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PCDHB5Q9Y5E4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PCDHB5Q9Y5E4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PCDHB5Q9Y5E4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
PCDHB5Q9Y5E4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PCDHB5Q9Y5E4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PCDHB5Q9Y5E4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PCDHB5Q9Y5E4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PCDHB5Q9Y5E4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PCDHB5Q9Y5E4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PCDHB5Q9Y5E4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
PCDHB5Q9Y5E4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PCDHB5Q9Y5E4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PCDHB5Q9Y5E4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PCDHB5Q9Y5E4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PCDHB5Q9Y5E4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PCDHB5Q9Y5E4 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PCDHB5Q9Y5E4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PCDHB5Q9Y5E4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PCDHB5Q9Y5E4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PCDHB5Q9Y5E4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PCDHB5Q9Y5E4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PCDHB5Q9Y5E4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PCDHB5Q9Y5E4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PCDHB5Q9Y5E4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PCDHB5Q9Y5E4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PCDHB5Q9Y5E4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PCDHB5Q9Y5E4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PCDHB5Q9Y5E4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
PCDHB5Q9Y5E4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PCDHB5Q9Y5E4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PCDHB5Q9Y5E4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PCDHB5Q9Y5E4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PCDHB5Q9Y5E4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PCDHB5Q9Y5E4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PCDHB5Q9Y5E4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PCDHB5Q9Y5E4 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PCDHB5Q9Y5E4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PCDHB5Q9Y5E4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PCDHB5Q9Y5E4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PCDHB5Q9Y5E4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PCDHB5Q9Y5E4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PCDHB5Q9Y5E4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PCDHB5Q9Y5E4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PCDHB5Q9Y5E4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PCDHB5Q9Y5E4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PCDHB5Q9Y5E4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PCDHB5Q9Y5E4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PCDHB5Q9Y5E4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PCDHB5Q9Y5E4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PCDHB5Q9Y5E4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PCDHB5Q9Y5E4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PCDHB5Q9Y5E4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PCDHB5Q9Y5E4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PCDHB5Q9Y5E4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PCDHB5Q9Y5E4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
PCDHB5Q9Y5E4 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PCDHB5Q9Y5E4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PCDHB5Q9Y5E4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PCDHB5Q9Y5E4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PCDHB5Q9Y5E4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PCDHB5Q9Y5E4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PCDHB5Q9Y5E4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PCDHB5Q9Y5E4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PCDHB5Q9Y5E4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PCDHB5Q9Y5E4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PCDHB5Q9Y5E4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PCDHB5Q9Y5E4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PCDHB5Q9Y5E4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PCDHB5Q9Y5E4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PCDHB5Q9Y5E4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PCDHB5Q9Y5E4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PCDHB5Q9Y5E4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PCDHB5Q9Y5E4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PCDHB5Q9Y5E4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PCDHB5Q9Y5E4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PCDHB5Q9Y5E4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PCDHB5Q9Y5E4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PCDHB5Q9Y5E4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PCDHB5Q9Y5E4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PCDHB5Q9Y5E4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PCDHB5Q9Y5E4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PCDHB5Q9Y5E4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PCDHB5Q9Y5E4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PCDHB5Q9Y5E4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PCDHB5Q9Y5E4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PCDHB5Q9Y5E4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PCDHB5Q9Y5E4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PCDHB5Q9Y5E4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PCDHB5Q9Y5E4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PCDHB5Q9Y5E4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PCDHB5Q9Y5E4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PCDHB5Q9Y5E4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PCDHB5Q9Y5E4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PCDHB5Q9Y5E4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PCDHB5Q9Y5E4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PCDHB5Q9Y5E4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms