Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y587

AP4S1, AP-4 complex subunit sigma-1, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP4S1Q9Y587 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
AP4S1Q9Y587 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
AP4S1Q9Y587 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
AP4S1Q9Y587 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
AP4S1Q9Y587 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
AP4S1Q9Y587 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
AP4S1Q9Y587 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
AP4S1Q9Y587 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
AP4S1Q9Y587 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
AP4S1Q9Y587 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
AP4S1Q9Y587 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
AP4S1Q9Y587 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
AP4S1Q9Y587 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
AP4S1Q9Y587 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
AP4S1Q9Y587 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
AP4S1Q9Y587 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
AP4S1Q9Y587 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
AP4S1Q9Y587 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AP4S1Q9Y587 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
AP4S1Q9Y587 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
AP4S1Q9Y587 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
AP4S1Q9Y587 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
AP4S1Q9Y587 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
AP4S1Q9Y587 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
AP4S1Q9Y587 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
AP4S1Q9Y587 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
AP4S1Q9Y587 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
AP4S1Q9Y587 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
AP4S1Q9Y587 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
AP4S1Q9Y587 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
AP4S1Q9Y587 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
AP4S1Q9Y587 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
AP4S1Q9Y587 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AP4S1Q9Y587 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
AP4S1Q9Y587 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
AP4S1Q9Y587 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
AP4S1Q9Y587 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
AP4S1Q9Y587 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
AP4S1Q9Y587 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
AP4S1Q9Y587 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
AP4S1Q9Y587 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
AP4S1Q9Y587 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
AP4S1Q9Y587 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
AP4S1Q9Y587 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
AP4S1Q9Y587 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
AP4S1Q9Y587 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
AP4S1Q9Y587 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
AP4S1Q9Y587 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
AP4S1Q9Y587 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
AP4S1Q9Y587 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
AP4S1Q9Y587 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
AP4S1Q9Y587 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
AP4S1Q9Y587 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
AP4S1Q9Y587 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
AP4S1Q9Y587 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
AP4S1Q9Y587 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
AP4S1Q9Y587 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
AP4S1Q9Y587 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
AP4S1Q9Y587 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
AP4S1Q9Y587 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
AP4S1Q9Y587 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
AP4S1Q9Y587 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
AP4S1Q9Y587 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
AP4S1Q9Y587 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
AP4S1Q9Y587 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
AP4S1Q9Y587 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
AP4S1Q9Y587 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
AP4S1Q9Y587 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
AP4S1Q9Y587 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
AP4S1Q9Y587 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
AP4S1Q9Y587 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AP4S1Q9Y587 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AP4S1Q9Y587 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AP4S1Q9Y587 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
AP4S1Q9Y587 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AP4S1Q9Y587 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AP4S1Q9Y587 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AP4S1Q9Y587 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AP4S1Q9Y587 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AP4S1Q9Y587 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
AP4S1Q9Y587 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AP4S1Q9Y587 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AP4S1Q9Y587 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AP4S1Q9Y587 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
AP4S1Q9Y587 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AP4S1Q9Y587 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
AP4S1Q9Y587 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AP4S1Q9Y587 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
AP4S1Q9Y587 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
AP4S1Q9Y587 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AP4S1Q9Y587 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AP4S1Q9Y587 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
AP4S1Q9Y587 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AP4S1Q9Y587 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AP4S1Q9Y587 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
AP4S1Q9Y587 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
AP4S1Q9Y587 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
AP4S1Q9Y587 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
AP4S1Q9Y587 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
AP4S1Q9Y587 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.9 ms