Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y543

HES2, Transcription factor HES-2, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HES2Q9Y543 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
HES2Q9Y543 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
HES2Q9Y543 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HES2Q9Y543 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HES2Q9Y543 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HES2Q9Y543 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HES2Q9Y543 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HES2Q9Y543 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HES2Q9Y543 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HES2Q9Y543 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HES2Q9Y543 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HES2Q9Y543 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
HES2Q9Y543 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HES2Q9Y543 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HES2Q9Y543 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HES2Q9Y543 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HES2Q9Y543 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HES2Q9Y543 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
HES2Q9Y543 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
HES2Q9Y543 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
HES2Q9Y543 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HES2Q9Y543 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HES2Q9Y543 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HES2Q9Y543 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HES2Q9Y543 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HES2Q9Y543 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HES2Q9Y543 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HES2Q9Y543 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HES2Q9Y543 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
HES2Q9Y543 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
HES2Q9Y543 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
HES2Q9Y543 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
HES2Q9Y543 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
HES2Q9Y543 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
HES2Q9Y543 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HES2Q9Y543 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HES2Q9Y543 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HES2Q9Y543 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
HES2Q9Y543 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HES2Q9Y543 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HES2Q9Y543 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HES2Q9Y543 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HES2Q9Y543 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HES2Q9Y543 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HES2Q9Y543 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HES2Q9Y543 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HES2Q9Y543 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
HES2Q9Y543 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
HES2Q9Y543 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
HES2Q9Y543 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HES2Q9Y543 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HES2Q9Y543 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
HES2Q9Y543 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
HES2Q9Y543 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
HES2Q9Y543 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
HES2Q9Y543 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HES2Q9Y543 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
HES2Q9Y543 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
HES2Q9Y543 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HES2Q9Y543 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HES2Q9Y543 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HES2Q9Y543 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HES2Q9Y543 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HES2Q9Y543 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HES2Q9Y543 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
HES2Q9Y543 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HES2Q9Y543 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
HES2Q9Y543 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HES2Q9Y543 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HES2Q9Y543 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HES2Q9Y543 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HES2Q9Y543 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
HES2Q9Y543 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HES2Q9Y543 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HES2Q9Y543 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HES2Q9Y543 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HES2Q9Y543 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HES2Q9Y543 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HES2Q9Y543 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
HES2Q9Y543 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HES2Q9Y543 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HES2Q9Y543 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
HES2Q9Y543 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
HES2Q9Y543 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
HES2Q9Y543 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
HES2Q9Y543 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
HES2Q9Y543 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
HES2Q9Y543 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HES2Q9Y543 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HES2Q9Y543 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
HES2Q9Y543 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
HES2Q9Y543 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HES2Q9Y543 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
HES2Q9Y543 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.53■■■□□ 2
HES2Q9Y543 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
HES2Q9Y543 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HES2Q9Y543 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HES2Q9Y543 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
HES2Q9Y543 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HES2Q9Y543 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms