Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W7

KCNIP3, Calsenilin, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP3Q9Y2W7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KCNIP3Q9Y2W7 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KCNIP3Q9Y2W7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KCNIP3Q9Y2W7 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KCNIP3Q9Y2W7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KCNIP3Q9Y2W7 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KCNIP3Q9Y2W7 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KCNIP3Q9Y2W7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KCNIP3Q9Y2W7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KCNIP3Q9Y2W7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KCNIP3Q9Y2W7 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KCNIP3Q9Y2W7 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KCNIP3Q9Y2W7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KCNIP3Q9Y2W7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KCNIP3Q9Y2W7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KCNIP3Q9Y2W7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KCNIP3Q9Y2W7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KCNIP3Q9Y2W7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KCNIP3Q9Y2W7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KCNIP3Q9Y2W7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KCNIP3Q9Y2W7 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KCNIP3Q9Y2W7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KCNIP3Q9Y2W7 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KCNIP3Q9Y2W7 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KCNIP3Q9Y2W7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KCNIP3Q9Y2W7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KCNIP3Q9Y2W7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KCNIP3Q9Y2W7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KCNIP3Q9Y2W7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KCNIP3Q9Y2W7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
KCNIP3Q9Y2W7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
KCNIP3Q9Y2W7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KCNIP3Q9Y2W7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KCNIP3Q9Y2W7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KCNIP3Q9Y2W7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KCNIP3Q9Y2W7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
KCNIP3Q9Y2W7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KCNIP3Q9Y2W7 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KCNIP3Q9Y2W7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KCNIP3Q9Y2W7 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KCNIP3Q9Y2W7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KCNIP3Q9Y2W7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KCNIP3Q9Y2W7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KCNIP3Q9Y2W7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KCNIP3Q9Y2W7 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KCNIP3Q9Y2W7 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KCNIP3Q9Y2W7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KCNIP3Q9Y2W7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KCNIP3Q9Y2W7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KCNIP3Q9Y2W7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KCNIP3Q9Y2W7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KCNIP3Q9Y2W7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KCNIP3Q9Y2W7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KCNIP3Q9Y2W7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KCNIP3Q9Y2W7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
KCNIP3Q9Y2W7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KCNIP3Q9Y2W7 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KCNIP3Q9Y2W7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KCNIP3Q9Y2W7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KCNIP3Q9Y2W7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KCNIP3Q9Y2W7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KCNIP3Q9Y2W7 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KCNIP3Q9Y2W7 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KCNIP3Q9Y2W7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
KCNIP3Q9Y2W7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KCNIP3Q9Y2W7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KCNIP3Q9Y2W7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KCNIP3Q9Y2W7 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KCNIP3Q9Y2W7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KCNIP3Q9Y2W7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
KCNIP3Q9Y2W7 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KCNIP3Q9Y2W7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KCNIP3Q9Y2W7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KCNIP3Q9Y2W7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KCNIP3Q9Y2W7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KCNIP3Q9Y2W7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KCNIP3Q9Y2W7 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KCNIP3Q9Y2W7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KCNIP3Q9Y2W7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KCNIP3Q9Y2W7 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KCNIP3Q9Y2W7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KCNIP3Q9Y2W7 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KCNIP3Q9Y2W7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KCNIP3Q9Y2W7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KCNIP3Q9Y2W7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
KCNIP3Q9Y2W7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
KCNIP3Q9Y2W7 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
KCNIP3Q9Y2W7 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
KCNIP3Q9Y2W7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
KCNIP3Q9Y2W7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KCNIP3Q9Y2W7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KCNIP3Q9Y2W7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KCNIP3Q9Y2W7 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KCNIP3Q9Y2W7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KCNIP3Q9Y2W7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KCNIP3Q9Y2W7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KCNIP3Q9Y2W7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KCNIP3Q9Y2W7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms