Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K6

USP20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20Q9Y2K6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP20Q9Y2K6 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP20Q9Y2K6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP20Q9Y2K6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP20Q9Y2K6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
USP20Q9Y2K6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
USP20Q9Y2K6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
USP20Q9Y2K6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP20Q9Y2K6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP20Q9Y2K6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
USP20Q9Y2K6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
USP20Q9Y2K6 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
USP20Q9Y2K6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
USP20Q9Y2K6 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
USP20Q9Y2K6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP20Q9Y2K6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP20Q9Y2K6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
USP20Q9Y2K6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
USP20Q9Y2K6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
USP20Q9Y2K6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
USP20Q9Y2K6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
USP20Q9Y2K6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
USP20Q9Y2K6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
USP20Q9Y2K6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
USP20Q9Y2K6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
USP20Q9Y2K6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
USP20Q9Y2K6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
USP20Q9Y2K6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
USP20Q9Y2K6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
USP20Q9Y2K6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
USP20Q9Y2K6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
USP20Q9Y2K6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP20Q9Y2K6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP20Q9Y2K6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP20Q9Y2K6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP20Q9Y2K6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP20Q9Y2K6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP20Q9Y2K6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP20Q9Y2K6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP20Q9Y2K6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP20Q9Y2K6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP20Q9Y2K6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP20Q9Y2K6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
USP20Q9Y2K6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
USP20Q9Y2K6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP20Q9Y2K6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
USP20Q9Y2K6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
USP20Q9Y2K6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
USP20Q9Y2K6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
USP20Q9Y2K6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
USP20Q9Y2K6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
USP20Q9Y2K6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
USP20Q9Y2K6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
USP20Q9Y2K6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP20Q9Y2K6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP20Q9Y2K6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP20Q9Y2K6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP20Q9Y2K6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP20Q9Y2K6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP20Q9Y2K6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP20Q9Y2K6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP20Q9Y2K6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
USP20Q9Y2K6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
USP20Q9Y2K6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
USP20Q9Y2K6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP20Q9Y2K6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP20Q9Y2K6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP20Q9Y2K6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP20Q9Y2K6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP20Q9Y2K6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP20Q9Y2K6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP20Q9Y2K6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP20Q9Y2K6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP20Q9Y2K6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP20Q9Y2K6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP20Q9Y2K6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP20Q9Y2K6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP20Q9Y2K6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP20Q9Y2K6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP20Q9Y2K6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
USP20Q9Y2K6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP20Q9Y2K6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP20Q9Y2K6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP20Q9Y2K6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP20Q9Y2K6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP20Q9Y2K6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
USP20Q9Y2K6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
USP20Q9Y2K6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
USP20Q9Y2K6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP20Q9Y2K6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP20Q9Y2K6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP20Q9Y2K6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP20Q9Y2K6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
USP20Q9Y2K6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP20Q9Y2K6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP20Q9Y2K6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP20Q9Y2K6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP20Q9Y2K6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP20Q9Y2K6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP20Q9Y2K6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108 ms