Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQV4

LAMP3, Lysosome-associated membrane glycoprotein 3, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMP3Q9UQV4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMP3Q9UQV4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMP3Q9UQV4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMP3Q9UQV4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMP3Q9UQV4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMP3Q9UQV4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LAMP3Q9UQV4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LAMP3Q9UQV4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LAMP3Q9UQV4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LAMP3Q9UQV4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LAMP3Q9UQV4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LAMP3Q9UQV4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LAMP3Q9UQV4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
LAMP3Q9UQV4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LAMP3Q9UQV4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LAMP3Q9UQV4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LAMP3Q9UQV4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LAMP3Q9UQV4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LAMP3Q9UQV4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LAMP3Q9UQV4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LAMP3Q9UQV4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LAMP3Q9UQV4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LAMP3Q9UQV4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LAMP3Q9UQV4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LAMP3Q9UQV4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LAMP3Q9UQV4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LAMP3Q9UQV4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LAMP3Q9UQV4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LAMP3Q9UQV4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LAMP3Q9UQV4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
LAMP3Q9UQV4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LAMP3Q9UQV4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
LAMP3Q9UQV4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LAMP3Q9UQV4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LAMP3Q9UQV4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LAMP3Q9UQV4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LAMP3Q9UQV4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LAMP3Q9UQV4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LAMP3Q9UQV4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LAMP3Q9UQV4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LAMP3Q9UQV4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LAMP3Q9UQV4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LAMP3Q9UQV4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LAMP3Q9UQV4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LAMP3Q9UQV4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LAMP3Q9UQV4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LAMP3Q9UQV4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LAMP3Q9UQV4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LAMP3Q9UQV4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LAMP3Q9UQV4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LAMP3Q9UQV4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LAMP3Q9UQV4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LAMP3Q9UQV4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LAMP3Q9UQV4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LAMP3Q9UQV4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LAMP3Q9UQV4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LAMP3Q9UQV4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LAMP3Q9UQV4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LAMP3Q9UQV4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LAMP3Q9UQV4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LAMP3Q9UQV4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LAMP3Q9UQV4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
LAMP3Q9UQV4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LAMP3Q9UQV4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LAMP3Q9UQV4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LAMP3Q9UQV4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LAMP3Q9UQV4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LAMP3Q9UQV4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LAMP3Q9UQV4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LAMP3Q9UQV4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LAMP3Q9UQV4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LAMP3Q9UQV4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LAMP3Q9UQV4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LAMP3Q9UQV4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LAMP3Q9UQV4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
LAMP3Q9UQV4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LAMP3Q9UQV4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LAMP3Q9UQV4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LAMP3Q9UQV4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LAMP3Q9UQV4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LAMP3Q9UQV4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
LAMP3Q9UQV4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
LAMP3Q9UQV4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LAMP3Q9UQV4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LAMP3Q9UQV4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LAMP3Q9UQV4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LAMP3Q9UQV4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LAMP3Q9UQV4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LAMP3Q9UQV4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LAMP3Q9UQV4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LAMP3Q9UQV4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LAMP3Q9UQV4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
LAMP3Q9UQV4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LAMP3Q9UQV4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LAMP3Q9UQV4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LAMP3Q9UQV4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LAMP3Q9UQV4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LAMP3Q9UQV4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LAMP3Q9UQV4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
LAMP3Q9UQV4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
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