Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL42

PNMA2, Paraneoplastic antigen Ma2, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA2Q9UL42 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PNMA2Q9UL42 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PNMA2Q9UL42 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PNMA2Q9UL42 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PNMA2Q9UL42 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PNMA2Q9UL42 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PNMA2Q9UL42 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PNMA2Q9UL42 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PNMA2Q9UL42 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PNMA2Q9UL42 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PNMA2Q9UL42 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PNMA2Q9UL42 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PNMA2Q9UL42 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PNMA2Q9UL42 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PNMA2Q9UL42 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PNMA2Q9UL42 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PNMA2Q9UL42 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PNMA2Q9UL42 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PNMA2Q9UL42 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PNMA2Q9UL42 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
PNMA2Q9UL42 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PNMA2Q9UL42 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PNMA2Q9UL42 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PNMA2Q9UL42 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PNMA2Q9UL42 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PNMA2Q9UL42 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PNMA2Q9UL42 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PNMA2Q9UL42 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PNMA2Q9UL42 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PNMA2Q9UL42 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PNMA2Q9UL42 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PNMA2Q9UL42 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PNMA2Q9UL42 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
PNMA2Q9UL42 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PNMA2Q9UL42 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PNMA2Q9UL42 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PNMA2Q9UL42 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PNMA2Q9UL42 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PNMA2Q9UL42 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PNMA2Q9UL42 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
PNMA2Q9UL42 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PNMA2Q9UL42 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PNMA2Q9UL42 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PNMA2Q9UL42 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
PNMA2Q9UL42 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PNMA2Q9UL42 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PNMA2Q9UL42 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
PNMA2Q9UL42 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PNMA2Q9UL42 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PNMA2Q9UL42 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PNMA2Q9UL42 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
PNMA2Q9UL42 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PNMA2Q9UL42 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PNMA2Q9UL42 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PNMA2Q9UL42 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PNMA2Q9UL42 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PNMA2Q9UL42 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PNMA2Q9UL42 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PNMA2Q9UL42 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PNMA2Q9UL42 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PNMA2Q9UL42 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PNMA2Q9UL42 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PNMA2Q9UL42 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PNMA2Q9UL42 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PNMA2Q9UL42 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PNMA2Q9UL42 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PNMA2Q9UL42 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PNMA2Q9UL42 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
PNMA2Q9UL42 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PNMA2Q9UL42 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PNMA2Q9UL42 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PNMA2Q9UL42 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
PNMA2Q9UL42 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PNMA2Q9UL42 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PNMA2Q9UL42 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
PNMA2Q9UL42 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
PNMA2Q9UL42 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PNMA2Q9UL42 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PNMA2Q9UL42 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PNMA2Q9UL42 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PNMA2Q9UL42 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PNMA2Q9UL42 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PNMA2Q9UL42 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PNMA2Q9UL42 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PNMA2Q9UL42 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PNMA2Q9UL42 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PNMA2Q9UL42 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PNMA2Q9UL42 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PNMA2Q9UL42 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PNMA2Q9UL42 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PNMA2Q9UL42 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PNMA2Q9UL42 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PNMA2Q9UL42 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PNMA2Q9UL42 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PNMA2Q9UL42 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PNMA2Q9UL42 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
PNMA2Q9UL42 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PNMA2Q9UL42 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PNMA2Q9UL42 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PNMA2Q9UL42 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms