Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKT7

FBXL3, F-box/LRR-repeat protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXL3Q9UKT7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FBXL3Q9UKT7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FBXL3Q9UKT7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FBXL3Q9UKT7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FBXL3Q9UKT7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FBXL3Q9UKT7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FBXL3Q9UKT7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXL3Q9UKT7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXL3Q9UKT7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXL3Q9UKT7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FBXL3Q9UKT7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FBXL3Q9UKT7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FBXL3Q9UKT7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FBXL3Q9UKT7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FBXL3Q9UKT7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FBXL3Q9UKT7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FBXL3Q9UKT7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FBXL3Q9UKT7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
FBXL3Q9UKT7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FBXL3Q9UKT7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FBXL3Q9UKT7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FBXL3Q9UKT7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FBXL3Q9UKT7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FBXL3Q9UKT7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FBXL3Q9UKT7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FBXL3Q9UKT7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FBXL3Q9UKT7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FBXL3Q9UKT7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FBXL3Q9UKT7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FBXL3Q9UKT7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FBXL3Q9UKT7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
FBXL3Q9UKT7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FBXL3Q9UKT7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FBXL3Q9UKT7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
FBXL3Q9UKT7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FBXL3Q9UKT7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FBXL3Q9UKT7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FBXL3Q9UKT7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FBXL3Q9UKT7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FBXL3Q9UKT7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FBXL3Q9UKT7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FBXL3Q9UKT7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FBXL3Q9UKT7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FBXL3Q9UKT7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FBXL3Q9UKT7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXL3Q9UKT7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXL3Q9UKT7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXL3Q9UKT7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXL3Q9UKT7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXL3Q9UKT7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXL3Q9UKT7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXL3Q9UKT7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXL3Q9UKT7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXL3Q9UKT7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXL3Q9UKT7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXL3Q9UKT7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FBXL3Q9UKT7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FBXL3Q9UKT7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FBXL3Q9UKT7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FBXL3Q9UKT7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FBXL3Q9UKT7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
FBXL3Q9UKT7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FBXL3Q9UKT7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXL3Q9UKT7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXL3Q9UKT7 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXL3Q9UKT7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXL3Q9UKT7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXL3Q9UKT7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXL3Q9UKT7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXL3Q9UKT7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXL3Q9UKT7 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXL3Q9UKT7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXL3Q9UKT7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXL3Q9UKT7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXL3Q9UKT7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXL3Q9UKT7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXL3Q9UKT7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXL3Q9UKT7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXL3Q9UKT7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXL3Q9UKT7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXL3Q9UKT7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FBXL3Q9UKT7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FBXL3Q9UKT7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
FBXL3Q9UKT7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FBXL3Q9UKT7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FBXL3Q9UKT7 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
FBXL3Q9UKT7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FBXL3Q9UKT7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXL3Q9UKT7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXL3Q9UKT7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXL3Q9UKT7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXL3Q9UKT7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXL3Q9UKT7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXL3Q9UKT7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXL3Q9UKT7 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXL3Q9UKT7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXL3Q9UKT7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXL3Q9UKT7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXL3Q9UKT7 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXL3Q9UKT7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms