Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKB1

FBXW11, F-box/WD repeat-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXW11Q9UKB1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FBXW11Q9UKB1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FBXW11Q9UKB1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FBXW11Q9UKB1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FBXW11Q9UKB1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FBXW11Q9UKB1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
FBXW11Q9UKB1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FBXW11Q9UKB1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
FBXW11Q9UKB1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
FBXW11Q9UKB1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
FBXW11Q9UKB1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
FBXW11Q9UKB1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
FBXW11Q9UKB1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
FBXW11Q9UKB1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
FBXW11Q9UKB1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
FBXW11Q9UKB1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FBXW11Q9UKB1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FBXW11Q9UKB1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FBXW11Q9UKB1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FBXW11Q9UKB1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FBXW11Q9UKB1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FBXW11Q9UKB1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FBXW11Q9UKB1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
FBXW11Q9UKB1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
FBXW11Q9UKB1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
FBXW11Q9UKB1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FBXW11Q9UKB1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FBXW11Q9UKB1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
FBXW11Q9UKB1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
FBXW11Q9UKB1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FBXW11Q9UKB1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FBXW11Q9UKB1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FBXW11Q9UKB1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
FBXW11Q9UKB1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FBXW11Q9UKB1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FBXW11Q9UKB1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FBXW11Q9UKB1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FBXW11Q9UKB1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FBXW11Q9UKB1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
FBXW11Q9UKB1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FBXW11Q9UKB1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FBXW11Q9UKB1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FBXW11Q9UKB1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FBXW11Q9UKB1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FBXW11Q9UKB1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FBXW11Q9UKB1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FBXW11Q9UKB1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FBXW11Q9UKB1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FBXW11Q9UKB1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FBXW11Q9UKB1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FBXW11Q9UKB1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FBXW11Q9UKB1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FBXW11Q9UKB1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FBXW11Q9UKB1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FBXW11Q9UKB1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FBXW11Q9UKB1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FBXW11Q9UKB1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FBXW11Q9UKB1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FBXW11Q9UKB1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
FBXW11Q9UKB1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FBXW11Q9UKB1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FBXW11Q9UKB1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FBXW11Q9UKB1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FBXW11Q9UKB1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FBXW11Q9UKB1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
FBXW11Q9UKB1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FBXW11Q9UKB1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
FBXW11Q9UKB1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FBXW11Q9UKB1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
FBXW11Q9UKB1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
FBXW11Q9UKB1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FBXW11Q9UKB1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FBXW11Q9UKB1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
FBXW11Q9UKB1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FBXW11Q9UKB1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
FBXW11Q9UKB1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FBXW11Q9UKB1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
FBXW11Q9UKB1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FBXW11Q9UKB1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FBXW11Q9UKB1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FBXW11Q9UKB1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FBXW11Q9UKB1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FBXW11Q9UKB1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FBXW11Q9UKB1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FBXW11Q9UKB1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
FBXW11Q9UKB1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FBXW11Q9UKB1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FBXW11Q9UKB1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FBXW11Q9UKB1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
FBXW11Q9UKB1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FBXW11Q9UKB1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
FBXW11Q9UKB1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
FBXW11Q9UKB1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
FBXW11Q9UKB1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
FBXW11Q9UKB1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
FBXW11Q9UKB1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
FBXW11Q9UKB1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FBXW11Q9UKB1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FBXW11Q9UKB1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FBXW11Q9UKB1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms