Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBR4

LHX3, LIM/homeobox protein Lhx3, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX3Q9UBR4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LHX3Q9UBR4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LHX3Q9UBR4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LHX3Q9UBR4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LHX3Q9UBR4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LHX3Q9UBR4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LHX3Q9UBR4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LHX3Q9UBR4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LHX3Q9UBR4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LHX3Q9UBR4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LHX3Q9UBR4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LHX3Q9UBR4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LHX3Q9UBR4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LHX3Q9UBR4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LHX3Q9UBR4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
LHX3Q9UBR4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LHX3Q9UBR4 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LHX3Q9UBR4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
LHX3Q9UBR4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LHX3Q9UBR4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LHX3Q9UBR4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LHX3Q9UBR4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LHX3Q9UBR4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LHX3Q9UBR4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LHX3Q9UBR4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LHX3Q9UBR4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LHX3Q9UBR4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LHX3Q9UBR4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LHX3Q9UBR4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LHX3Q9UBR4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LHX3Q9UBR4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LHX3Q9UBR4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LHX3Q9UBR4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LHX3Q9UBR4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LHX3Q9UBR4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LHX3Q9UBR4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LHX3Q9UBR4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LHX3Q9UBR4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LHX3Q9UBR4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LHX3Q9UBR4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LHX3Q9UBR4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LHX3Q9UBR4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LHX3Q9UBR4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LHX3Q9UBR4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LHX3Q9UBR4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LHX3Q9UBR4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LHX3Q9UBR4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LHX3Q9UBR4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LHX3Q9UBR4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LHX3Q9UBR4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LHX3Q9UBR4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
LHX3Q9UBR4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
LHX3Q9UBR4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LHX3Q9UBR4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LHX3Q9UBR4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LHX3Q9UBR4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LHX3Q9UBR4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LHX3Q9UBR4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LHX3Q9UBR4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LHX3Q9UBR4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
LHX3Q9UBR4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LHX3Q9UBR4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
LHX3Q9UBR4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LHX3Q9UBR4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LHX3Q9UBR4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LHX3Q9UBR4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LHX3Q9UBR4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
LHX3Q9UBR4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LHX3Q9UBR4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LHX3Q9UBR4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LHX3Q9UBR4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LHX3Q9UBR4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LHX3Q9UBR4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LHX3Q9UBR4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LHX3Q9UBR4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LHX3Q9UBR4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LHX3Q9UBR4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LHX3Q9UBR4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LHX3Q9UBR4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LHX3Q9UBR4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LHX3Q9UBR4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LHX3Q9UBR4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LHX3Q9UBR4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LHX3Q9UBR4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LHX3Q9UBR4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LHX3Q9UBR4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LHX3Q9UBR4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LHX3Q9UBR4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LHX3Q9UBR4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LHX3Q9UBR4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LHX3Q9UBR4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LHX3Q9UBR4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
LHX3Q9UBR4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LHX3Q9UBR4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LHX3Q9UBR4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LHX3Q9UBR4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LHX3Q9UBR4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LHX3Q9UBR4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LHX3Q9UBR4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LHX3Q9UBR4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 177.5 ms