Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J9

PDP2, [Pyruvate dehydrogenase [acetyl-transferring]]-phosphatase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDP2Q9P2J9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDP2Q9P2J9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDP2Q9P2J9 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDP2Q9P2J9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDP2Q9P2J9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PDP2Q9P2J9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDP2Q9P2J9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDP2Q9P2J9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDP2Q9P2J9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDP2Q9P2J9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDP2Q9P2J9 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDP2Q9P2J9 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDP2Q9P2J9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PDP2Q9P2J9 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PDP2Q9P2J9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PDP2Q9P2J9 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PDP2Q9P2J9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDP2Q9P2J9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDP2Q9P2J9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDP2Q9P2J9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDP2Q9P2J9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDP2Q9P2J9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDP2Q9P2J9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDP2Q9P2J9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDP2Q9P2J9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDP2Q9P2J9 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDP2Q9P2J9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDP2Q9P2J9 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDP2Q9P2J9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDP2Q9P2J9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDP2Q9P2J9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDP2Q9P2J9 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDP2Q9P2J9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDP2Q9P2J9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PDP2Q9P2J9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDP2Q9P2J9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDP2Q9P2J9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDP2Q9P2J9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDP2Q9P2J9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDP2Q9P2J9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDP2Q9P2J9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PDP2Q9P2J9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDP2Q9P2J9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDP2Q9P2J9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDP2Q9P2J9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDP2Q9P2J9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDP2Q9P2J9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDP2Q9P2J9 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDP2Q9P2J9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDP2Q9P2J9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDP2Q9P2J9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDP2Q9P2J9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDP2Q9P2J9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDP2Q9P2J9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDP2Q9P2J9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDP2Q9P2J9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDP2Q9P2J9 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDP2Q9P2J9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDP2Q9P2J9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDP2Q9P2J9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PDP2Q9P2J9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDP2Q9P2J9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDP2Q9P2J9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDP2Q9P2J9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDP2Q9P2J9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDP2Q9P2J9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDP2Q9P2J9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDP2Q9P2J9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDP2Q9P2J9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDP2Q9P2J9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDP2Q9P2J9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDP2Q9P2J9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PDP2Q9P2J9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PDP2Q9P2J9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
PDP2Q9P2J9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
PDP2Q9P2J9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PDP2Q9P2J9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PDP2Q9P2J9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PDP2Q9P2J9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PDP2Q9P2J9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PDP2Q9P2J9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PDP2Q9P2J9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDP2Q9P2J9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDP2Q9P2J9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDP2Q9P2J9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDP2Q9P2J9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDP2Q9P2J9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDP2Q9P2J9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDP2Q9P2J9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDP2Q9P2J9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDP2Q9P2J9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDP2Q9P2J9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDP2Q9P2J9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDP2Q9P2J9 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PDP2Q9P2J9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDP2Q9P2J9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDP2Q9P2J9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDP2Q9P2J9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDP2Q9P2J9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDP2Q9P2J9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms