Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CNTN3Q9P232 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CNTN3Q9P232 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CNTN3Q9P232 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CNTN3Q9P232 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CNTN3Q9P232 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CNTN3Q9P232 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CNTN3Q9P232 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CNTN3Q9P232 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CNTN3Q9P232 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CNTN3Q9P232 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CNTN3Q9P232 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CNTN3Q9P232 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CNTN3Q9P232 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CNTN3Q9P232 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CNTN3Q9P232 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CNTN3Q9P232 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CNTN3Q9P232 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CNTN3Q9P232 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CNTN3Q9P232 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CNTN3Q9P232 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CNTN3Q9P232 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CNTN3Q9P232 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CNTN3Q9P232 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CNTN3Q9P232 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CNTN3Q9P232 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CNTN3Q9P232 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
CNTN3Q9P232 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CNTN3Q9P232 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CNTN3Q9P232 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CNTN3Q9P232 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CNTN3Q9P232 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CNTN3Q9P232 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
CNTN3Q9P232 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CNTN3Q9P232 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CNTN3Q9P232 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
CNTN3Q9P232 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CNTN3Q9P232 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CNTN3Q9P232 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CNTN3Q9P232 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CNTN3Q9P232 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CNTN3Q9P232 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CNTN3Q9P232 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CNTN3Q9P232 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CNTN3Q9P232 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CNTN3Q9P232 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CNTN3Q9P232 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CNTN3Q9P232 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CNTN3Q9P232 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CNTN3Q9P232 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CNTN3Q9P232 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CNTN3Q9P232 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CNTN3Q9P232 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CNTN3Q9P232 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CNTN3Q9P232 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
CNTN3Q9P232 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CNTN3Q9P232 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CNTN3Q9P232 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CNTN3Q9P232 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CNTN3Q9P232 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CNTN3Q9P232 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CNTN3Q9P232 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CNTN3Q9P232 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CNTN3Q9P232 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CNTN3Q9P232 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CNTN3Q9P232 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CNTN3Q9P232 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CNTN3Q9P232 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CNTN3Q9P232 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CNTN3Q9P232 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CNTN3Q9P232 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CNTN3Q9P232 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CNTN3Q9P232 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CNTN3Q9P232 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CNTN3Q9P232 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CNTN3Q9P232 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CNTN3Q9P232 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CNTN3Q9P232 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CNTN3Q9P232 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CNTN3Q9P232 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CNTN3Q9P232 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CNTN3Q9P232 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CNTN3Q9P232 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CNTN3Q9P232 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CNTN3Q9P232 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CNTN3Q9P232 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CNTN3Q9P232 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CNTN3Q9P232 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CNTN3Q9P232 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CNTN3Q9P232 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CNTN3Q9P232 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CNTN3Q9P232 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CNTN3Q9P232 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CNTN3Q9P232 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CNTN3Q9P232 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CNTN3Q9P232 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CNTN3Q9P232 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CNTN3Q9P232 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CNTN3Q9P232 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CNTN3Q9P232 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.3 ms