Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ94

NLGN3, Neuroligin-3, humanhuman

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLGN3Q9NZ94 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NLGN3Q9NZ94 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NLGN3Q9NZ94 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NLGN3Q9NZ94 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NLGN3Q9NZ94 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NLGN3Q9NZ94 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NLGN3Q9NZ94 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NLGN3Q9NZ94 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NLGN3Q9NZ94 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NLGN3Q9NZ94 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
NLGN3Q9NZ94 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NLGN3Q9NZ94 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NLGN3Q9NZ94 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NLGN3Q9NZ94 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NLGN3Q9NZ94 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NLGN3Q9NZ94 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NLGN3Q9NZ94 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NLGN3Q9NZ94 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NLGN3Q9NZ94 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NLGN3Q9NZ94 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NLGN3Q9NZ94 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NLGN3Q9NZ94 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NLGN3Q9NZ94 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
NLGN3Q9NZ94 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NLGN3Q9NZ94 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
NLGN3Q9NZ94 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NLGN3Q9NZ94 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NLGN3Q9NZ94 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
NLGN3Q9NZ94 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NLGN3Q9NZ94 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NLGN3Q9NZ94 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NLGN3Q9NZ94 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NLGN3Q9NZ94 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NLGN3Q9NZ94 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NLGN3Q9NZ94 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NLGN3Q9NZ94 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NLGN3Q9NZ94 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NLGN3Q9NZ94 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NLGN3Q9NZ94 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NLGN3Q9NZ94 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NLGN3Q9NZ94 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NLGN3Q9NZ94 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NLGN3Q9NZ94 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NLGN3Q9NZ94 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NLGN3Q9NZ94 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NLGN3Q9NZ94 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NLGN3Q9NZ94 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NLGN3Q9NZ94 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NLGN3Q9NZ94 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NLGN3Q9NZ94 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NLGN3Q9NZ94 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NLGN3Q9NZ94 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NLGN3Q9NZ94 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NLGN3Q9NZ94 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
NLGN3Q9NZ94 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NLGN3Q9NZ94 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NLGN3Q9NZ94 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NLGN3Q9NZ94 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NLGN3Q9NZ94 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
NLGN3Q9NZ94 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
NLGN3Q9NZ94 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NLGN3Q9NZ94 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NLGN3Q9NZ94 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NLGN3Q9NZ94 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NLGN3Q9NZ94 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NLGN3Q9NZ94 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NLGN3Q9NZ94 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NLGN3Q9NZ94 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NLGN3Q9NZ94 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NLGN3Q9NZ94 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NLGN3Q9NZ94 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NLGN3Q9NZ94 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NLGN3Q9NZ94 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NLGN3Q9NZ94 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NLGN3Q9NZ94 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NLGN3Q9NZ94 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
NLGN3Q9NZ94 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NLGN3Q9NZ94 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NLGN3Q9NZ94 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NLGN3Q9NZ94 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NLGN3Q9NZ94 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NLGN3Q9NZ94 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NLGN3Q9NZ94 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
NLGN3Q9NZ94 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NLGN3Q9NZ94 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NLGN3Q9NZ94 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NLGN3Q9NZ94 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
NLGN3Q9NZ94 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NLGN3Q9NZ94 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NLGN3Q9NZ94 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NLGN3Q9NZ94 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NLGN3Q9NZ94 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NLGN3Q9NZ94 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NLGN3Q9NZ94 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NLGN3Q9NZ94 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NLGN3Q9NZ94 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NLGN3Q9NZ94 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NLGN3Q9NZ94 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NLGN3Q9NZ94 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NLGN3Q9NZ94 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms