Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYL9

TMOD3, Tropomodulin-3, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3Q9NYL9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
TMOD3Q9NYL9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
TMOD3Q9NYL9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
TMOD3Q9NYL9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
TMOD3Q9NYL9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
TMOD3Q9NYL9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
TMOD3Q9NYL9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
TMOD3Q9NYL9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
TMOD3Q9NYL9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
TMOD3Q9NYL9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
TMOD3Q9NYL9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
TMOD3Q9NYL9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.91
TMOD3Q9NYL9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
TMOD3Q9NYL9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
TMOD3Q9NYL9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
TMOD3Q9NYL9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
TMOD3Q9NYL9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
TMOD3Q9NYL9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
TMOD3Q9NYL9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
TMOD3Q9NYL9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
TMOD3Q9NYL9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
TMOD3Q9NYL9 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
TMOD3Q9NYL9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
TMOD3Q9NYL9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
TMOD3Q9NYL9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
TMOD3Q9NYL9 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
TMOD3Q9NYL9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
TMOD3Q9NYL9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC33.2■■■□□ 2.91
TMOD3Q9NYL9 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
TMOD3Q9NYL9 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC33.2■■■□□ 2.91
TMOD3Q9NYL9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.9
TMOD3Q9NYL9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
TMOD3Q9NYL9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
TMOD3Q9NYL9 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC33.19■■■□□ 2.9
TMOD3Q9NYL9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
TMOD3Q9NYL9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
TMOD3Q9NYL9 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
TMOD3Q9NYL9 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC33.16■■■□□ 2.9
TMOD3Q9NYL9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
TMOD3Q9NYL9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
TMOD3Q9NYL9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
TMOD3Q9NYL9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
TMOD3Q9NYL9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
TMOD3Q9NYL9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
TMOD3Q9NYL9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
TMOD3Q9NYL9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
TMOD3Q9NYL9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
TMOD3Q9NYL9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
TMOD3Q9NYL9 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
TMOD3Q9NYL9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
TMOD3Q9NYL9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
TMOD3Q9NYL9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
TMOD3Q9NYL9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
TMOD3Q9NYL9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
TMOD3Q9NYL9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
TMOD3Q9NYL9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
TMOD3Q9NYL9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC33.12■■■□□ 2.89
TMOD3Q9NYL9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
TMOD3Q9NYL9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
TMOD3Q9NYL9 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
TMOD3Q9NYL9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
TMOD3Q9NYL9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
TMOD3Q9NYL9 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
TMOD3Q9NYL9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
TMOD3Q9NYL9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
TMOD3Q9NYL9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
TMOD3Q9NYL9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
TMOD3Q9NYL9 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
TMOD3Q9NYL9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
TMOD3Q9NYL9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
TMOD3Q9NYL9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
TMOD3Q9NYL9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
TMOD3Q9NYL9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
TMOD3Q9NYL9 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
TMOD3Q9NYL9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
TMOD3Q9NYL9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
TMOD3Q9NYL9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
TMOD3Q9NYL9 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
TMOD3Q9NYL9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
TMOD3Q9NYL9 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
TMOD3Q9NYL9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
TMOD3Q9NYL9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
TMOD3Q9NYL9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
TMOD3Q9NYL9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
TMOD3Q9NYL9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
TMOD3Q9NYL9 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
TMOD3Q9NYL9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
TMOD3Q9NYL9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
TMOD3Q9NYL9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
TMOD3Q9NYL9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
TMOD3Q9NYL9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.88
TMOD3Q9NYL9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
TMOD3Q9NYL9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
TMOD3Q9NYL9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC33.01■■■□□ 2.87
TMOD3Q9NYL9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
TMOD3Q9NYL9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
TMOD3Q9NYL9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
TMOD3Q9NYL9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
TMOD3Q9NYL9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
TMOD3Q9NYL9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms