Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS68

TNFRSF19, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 19, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF19Q9NS68 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TNFRSF19Q9NS68 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TNFRSF19Q9NS68 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TNFRSF19Q9NS68 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TNFRSF19Q9NS68 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TNFRSF19Q9NS68 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TNFRSF19Q9NS68 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TNFRSF19Q9NS68 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TNFRSF19Q9NS68 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TNFRSF19Q9NS68 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TNFRSF19Q9NS68 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TNFRSF19Q9NS68 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TNFRSF19Q9NS68 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TNFRSF19Q9NS68 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TNFRSF19Q9NS68 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TNFRSF19Q9NS68 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TNFRSF19Q9NS68 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TNFRSF19Q9NS68 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TNFRSF19Q9NS68 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TNFRSF19Q9NS68 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TNFRSF19Q9NS68 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TNFRSF19Q9NS68 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TNFRSF19Q9NS68 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TNFRSF19Q9NS68 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TNFRSF19Q9NS68 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TNFRSF19Q9NS68 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TNFRSF19Q9NS68 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TNFRSF19Q9NS68 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TNFRSF19Q9NS68 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TNFRSF19Q9NS68 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TNFRSF19Q9NS68 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TNFRSF19Q9NS68 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TNFRSF19Q9NS68 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TNFRSF19Q9NS68 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TNFRSF19Q9NS68 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TNFRSF19Q9NS68 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TNFRSF19Q9NS68 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TNFRSF19Q9NS68 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
TNFRSF19Q9NS68 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TNFRSF19Q9NS68 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TNFRSF19Q9NS68 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TNFRSF19Q9NS68 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TNFRSF19Q9NS68 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TNFRSF19Q9NS68 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TNFRSF19Q9NS68 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TNFRSF19Q9NS68 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TNFRSF19Q9NS68 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TNFRSF19Q9NS68 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TNFRSF19Q9NS68 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TNFRSF19Q9NS68 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TNFRSF19Q9NS68 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TNFRSF19Q9NS68 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TNFRSF19Q9NS68 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TNFRSF19Q9NS68 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TNFRSF19Q9NS68 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
TNFRSF19Q9NS68 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TNFRSF19Q9NS68 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TNFRSF19Q9NS68 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TNFRSF19Q9NS68 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
TNFRSF19Q9NS68 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TNFRSF19Q9NS68 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TNFRSF19Q9NS68 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TNFRSF19Q9NS68 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TNFRSF19Q9NS68 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TNFRSF19Q9NS68 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
TNFRSF19Q9NS68 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TNFRSF19Q9NS68 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TNFRSF19Q9NS68 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TNFRSF19Q9NS68 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TNFRSF19Q9NS68 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNFRSF19Q9NS68 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNFRSF19Q9NS68 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNFRSF19Q9NS68 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNFRSF19Q9NS68 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNFRSF19Q9NS68 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TNFRSF19Q9NS68 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TNFRSF19Q9NS68 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
TNFRSF19Q9NS68 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TNFRSF19Q9NS68 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TNFRSF19Q9NS68 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TNFRSF19Q9NS68 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
TNFRSF19Q9NS68 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TNFRSF19Q9NS68 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TNFRSF19Q9NS68 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
TNFRSF19Q9NS68 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
TNFRSF19Q9NS68 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TNFRSF19Q9NS68 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TNFRSF19Q9NS68 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TNFRSF19Q9NS68 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TNFRSF19Q9NS68 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TNFRSF19Q9NS68 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TNFRSF19Q9NS68 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TNFRSF19Q9NS68 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TNFRSF19Q9NS68 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TNFRSF19Q9NS68 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TNFRSF19Q9NS68 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TNFRSF19Q9NS68 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TNFRSF19Q9NS68 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TNFRSF19Q9NS68 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TNFRSF19Q9NS68 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms