Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS62

THSD1, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 852 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THSD1Q9NS62 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
THSD1Q9NS62 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
THSD1Q9NS62 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
THSD1Q9NS62 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
THSD1Q9NS62 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
THSD1Q9NS62 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
THSD1Q9NS62 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
THSD1Q9NS62 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
THSD1Q9NS62 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
THSD1Q9NS62 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
THSD1Q9NS62 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
THSD1Q9NS62 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
THSD1Q9NS62 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
THSD1Q9NS62 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
THSD1Q9NS62 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
THSD1Q9NS62 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
THSD1Q9NS62 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
THSD1Q9NS62 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
THSD1Q9NS62 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
THSD1Q9NS62 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
THSD1Q9NS62 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
THSD1Q9NS62 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
THSD1Q9NS62 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
THSD1Q9NS62 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
THSD1Q9NS62 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
THSD1Q9NS62 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
THSD1Q9NS62 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
THSD1Q9NS62 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
THSD1Q9NS62 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
THSD1Q9NS62 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
THSD1Q9NS62 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
THSD1Q9NS62 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
THSD1Q9NS62 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
THSD1Q9NS62 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
THSD1Q9NS62 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
THSD1Q9NS62 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
THSD1Q9NS62 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
THSD1Q9NS62 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
THSD1Q9NS62 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
THSD1Q9NS62 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
THSD1Q9NS62 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
THSD1Q9NS62 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
THSD1Q9NS62 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
THSD1Q9NS62 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
THSD1Q9NS62 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
THSD1Q9NS62 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
THSD1Q9NS62 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
THSD1Q9NS62 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
THSD1Q9NS62 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
THSD1Q9NS62 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
THSD1Q9NS62 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
THSD1Q9NS62 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
THSD1Q9NS62 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
THSD1Q9NS62 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
THSD1Q9NS62 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
THSD1Q9NS62 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
THSD1Q9NS62 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
THSD1Q9NS62 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
THSD1Q9NS62 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
THSD1Q9NS62 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
THSD1Q9NS62 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
THSD1Q9NS62 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
THSD1Q9NS62 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
THSD1Q9NS62 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
THSD1Q9NS62 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
THSD1Q9NS62 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
THSD1Q9NS62 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
THSD1Q9NS62 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
THSD1Q9NS62 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
THSD1Q9NS62 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
THSD1Q9NS62 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
THSD1Q9NS62 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
THSD1Q9NS62 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
THSD1Q9NS62 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
THSD1Q9NS62 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
THSD1Q9NS62 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
THSD1Q9NS62 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
THSD1Q9NS62 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
THSD1Q9NS62 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
THSD1Q9NS62 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
THSD1Q9NS62 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
THSD1Q9NS62 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
THSD1Q9NS62 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
THSD1Q9NS62 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
THSD1Q9NS62 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
THSD1Q9NS62 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
THSD1Q9NS62 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
THSD1Q9NS62 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
THSD1Q9NS62 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
THSD1Q9NS62 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
THSD1Q9NS62 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
THSD1Q9NS62 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
THSD1Q9NS62 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
THSD1Q9NS62 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
THSD1Q9NS62 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
THSD1Q9NS62 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
THSD1Q9NS62 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
THSD1Q9NS62 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
THSD1Q9NS62 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
THSD1Q9NS62 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms