Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP80

PNPLA8, Calcium-independent phospholipase A2-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA8Q9NP80 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
PNPLA8Q9NP80 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PNPLA8Q9NP80 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PNPLA8Q9NP80 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PNPLA8Q9NP80 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PNPLA8Q9NP80 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
PNPLA8Q9NP80 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PNPLA8Q9NP80 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
PNPLA8Q9NP80 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PNPLA8Q9NP80 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PNPLA8Q9NP80 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PNPLA8Q9NP80 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
PNPLA8Q9NP80 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PNPLA8Q9NP80 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PNPLA8Q9NP80 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PNPLA8Q9NP80 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PNPLA8Q9NP80 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PNPLA8Q9NP80 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PNPLA8Q9NP80 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PNPLA8Q9NP80 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PNPLA8Q9NP80 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PNPLA8Q9NP80 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
PNPLA8Q9NP80 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PNPLA8Q9NP80 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PNPLA8Q9NP80 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PNPLA8Q9NP80 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PNPLA8Q9NP80 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PNPLA8Q9NP80 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PNPLA8Q9NP80 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PNPLA8Q9NP80 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PNPLA8Q9NP80 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PNPLA8Q9NP80 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PNPLA8Q9NP80 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PNPLA8Q9NP80 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PNPLA8Q9NP80 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PNPLA8Q9NP80 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PNPLA8Q9NP80 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PNPLA8Q9NP80 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PNPLA8Q9NP80 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PNPLA8Q9NP80 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PNPLA8Q9NP80 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PNPLA8Q9NP80 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PNPLA8Q9NP80 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PNPLA8Q9NP80 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PNPLA8Q9NP80 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PNPLA8Q9NP80 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PNPLA8Q9NP80 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PNPLA8Q9NP80 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PNPLA8Q9NP80 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PNPLA8Q9NP80 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PNPLA8Q9NP80 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PNPLA8Q9NP80 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PNPLA8Q9NP80 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PNPLA8Q9NP80 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PNPLA8Q9NP80 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PNPLA8Q9NP80 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PNPLA8Q9NP80 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
PNPLA8Q9NP80 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PNPLA8Q9NP80 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PNPLA8Q9NP80 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PNPLA8Q9NP80 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PNPLA8Q9NP80 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PNPLA8Q9NP80 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PNPLA8Q9NP80 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PNPLA8Q9NP80 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PNPLA8Q9NP80 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PNPLA8Q9NP80 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PNPLA8Q9NP80 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PNPLA8Q9NP80 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PNPLA8Q9NP80 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PNPLA8Q9NP80 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PNPLA8Q9NP80 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
PNPLA8Q9NP80 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PNPLA8Q9NP80 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PNPLA8Q9NP80 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
PNPLA8Q9NP80 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PNPLA8Q9NP80 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PNPLA8Q9NP80 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PNPLA8Q9NP80 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PNPLA8Q9NP80 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PNPLA8Q9NP80 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PNPLA8Q9NP80 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PNPLA8Q9NP80 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PNPLA8Q9NP80 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PNPLA8Q9NP80 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PNPLA8Q9NP80 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PNPLA8Q9NP80 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PNPLA8Q9NP80 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PNPLA8Q9NP80 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PNPLA8Q9NP80 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PNPLA8Q9NP80 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PNPLA8Q9NP80 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PNPLA8Q9NP80 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PNPLA8Q9NP80 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PNPLA8Q9NP80 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PNPLA8Q9NP80 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PNPLA8Q9NP80 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PNPLA8Q9NP80 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PNPLA8Q9NP80 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PNPLA8Q9NP80 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms