Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAB8

PPCS, Phosphopantothenate--cysteine ligase, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPCSQ9HAB8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PPCSQ9HAB8 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PPCSQ9HAB8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PPCSQ9HAB8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PPCSQ9HAB8 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PPCSQ9HAB8 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PPCSQ9HAB8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PPCSQ9HAB8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PPCSQ9HAB8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PPCSQ9HAB8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PPCSQ9HAB8 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PPCSQ9HAB8 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PPCSQ9HAB8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PPCSQ9HAB8 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PPCSQ9HAB8 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PPCSQ9HAB8 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PPCSQ9HAB8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PPCSQ9HAB8 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PPCSQ9HAB8 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PPCSQ9HAB8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PPCSQ9HAB8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PPCSQ9HAB8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PPCSQ9HAB8 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PPCSQ9HAB8 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PPCSQ9HAB8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PPCSQ9HAB8 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PPCSQ9HAB8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PPCSQ9HAB8 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PPCSQ9HAB8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PPCSQ9HAB8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PPCSQ9HAB8 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPCSQ9HAB8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPCSQ9HAB8 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPCSQ9HAB8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPCSQ9HAB8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPCSQ9HAB8 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PPCSQ9HAB8 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPCSQ9HAB8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPCSQ9HAB8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPCSQ9HAB8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPCSQ9HAB8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PPCSQ9HAB8 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PPCSQ9HAB8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PPCSQ9HAB8 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PPCSQ9HAB8 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PPCSQ9HAB8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPCSQ9HAB8 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPCSQ9HAB8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPCSQ9HAB8 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPCSQ9HAB8 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PPCSQ9HAB8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPCSQ9HAB8 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPCSQ9HAB8 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPCSQ9HAB8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPCSQ9HAB8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPCSQ9HAB8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPCSQ9HAB8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPCSQ9HAB8 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPCSQ9HAB8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPCSQ9HAB8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPCSQ9HAB8 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPCSQ9HAB8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PPCSQ9HAB8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PPCSQ9HAB8 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PPCSQ9HAB8 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PPCSQ9HAB8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PPCSQ9HAB8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PPCSQ9HAB8 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PPCSQ9HAB8 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PPCSQ9HAB8 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PPCSQ9HAB8 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPCSQ9HAB8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPCSQ9HAB8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPCSQ9HAB8 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPCSQ9HAB8 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPCSQ9HAB8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPCSQ9HAB8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PPCSQ9HAB8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PPCSQ9HAB8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PPCSQ9HAB8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PPCSQ9HAB8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PPCSQ9HAB8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PPCSQ9HAB8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PPCSQ9HAB8 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PPCSQ9HAB8 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PPCSQ9HAB8 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PPCSQ9HAB8 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PPCSQ9HAB8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPCSQ9HAB8 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPCSQ9HAB8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPCSQ9HAB8 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPCSQ9HAB8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPCSQ9HAB8 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PPCSQ9HAB8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPCSQ9HAB8 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPCSQ9HAB8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPCSQ9HAB8 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PPCSQ9HAB8 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PPCSQ9HAB8 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PPCSQ9HAB8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms