Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY66

KDM5D, Lysine-specific demethylase 5D, humanhuman

Predictions only

Length 1,539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5DQ9BY66 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
KDM5DQ9BY66 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
KDM5DQ9BY66 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
KDM5DQ9BY66 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC38.21■■■■□ 3.71
KDM5DQ9BY66 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC38.2■■■■□ 3.71
KDM5DQ9BY66 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.2■■■■□ 3.71
KDM5DQ9BY66 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
KDM5DQ9BY66 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC38.19■■■■□ 3.7
KDM5DQ9BY66 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38.19■■■■□ 3.7
KDM5DQ9BY66 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC38.18■■■■□ 3.7
KDM5DQ9BY66 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
KDM5DQ9BY66 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC38.18■■■■□ 3.7
KDM5DQ9BY66 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC38.17■■■■□ 3.7
KDM5DQ9BY66 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
KDM5DQ9BY66 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
KDM5DQ9BY66 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC38.17■■■■□ 3.7
KDM5DQ9BY66 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC38.17■■■■□ 3.7
KDM5DQ9BY66 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC38.17■■■■□ 3.7
KDM5DQ9BY66 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
KDM5DQ9BY66 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.15■■■■□ 3.7
KDM5DQ9BY66 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC38.15■■■■□ 3.7
KDM5DQ9BY66 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
KDM5DQ9BY66 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC38.14■■■■□ 3.7
KDM5DQ9BY66 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.13■■■■□ 3.7
KDM5DQ9BY66 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC38.13■■■■□ 3.69
KDM5DQ9BY66 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
KDM5DQ9BY66 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.11■■■■□ 3.69
KDM5DQ9BY66 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC38.1■■■■□ 3.69
KDM5DQ9BY66 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
KDM5DQ9BY66 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC38.09■■■■□ 3.69
KDM5DQ9BY66 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
KDM5DQ9BY66 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC38.09■■■■□ 3.69
KDM5DQ9BY66 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.09■■■■□ 3.69
KDM5DQ9BY66 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
KDM5DQ9BY66 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
KDM5DQ9BY66 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
KDM5DQ9BY66 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
KDM5DQ9BY66 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC38.08■■■■□ 3.69
KDM5DQ9BY66 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC38.08■■■■□ 3.69
KDM5DQ9BY66 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC38.07■■■■□ 3.69
KDM5DQ9BY66 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
KDM5DQ9BY66 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC38.07■■■■□ 3.68
KDM5DQ9BY66 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.07■■■■□ 3.68
KDM5DQ9BY66 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.06■■■■□ 3.68
KDM5DQ9BY66 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
KDM5DQ9BY66 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.05■■■■□ 3.68
KDM5DQ9BY66 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
KDM5DQ9BY66 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC38.05■■■■□ 3.68
KDM5DQ9BY66 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC38.05■■■■□ 3.68
KDM5DQ9BY66 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
KDM5DQ9BY66 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC38.03■■■■□ 3.68
KDM5DQ9BY66 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC38.03■■■■□ 3.68
KDM5DQ9BY66 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
KDM5DQ9BY66 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC38.03■■■■□ 3.68
KDM5DQ9BY66 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
KDM5DQ9BY66 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
KDM5DQ9BY66 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
KDM5DQ9BY66 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
KDM5DQ9BY66 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC38.01■■■■□ 3.67
KDM5DQ9BY66 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
KDM5DQ9BY66 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
KDM5DQ9BY66 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
KDM5DQ9BY66 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC38■■■■□ 3.67
KDM5DQ9BY66 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
KDM5DQ9BY66 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
KDM5DQ9BY66 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC37.99■■■■□ 3.67
KDM5DQ9BY66 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC37.98■■■■□ 3.67
KDM5DQ9BY66 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC37.97■■■■□ 3.67
KDM5DQ9BY66 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC37.97■■■■□ 3.67
KDM5DQ9BY66 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
KDM5DQ9BY66 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC37.97■■■■□ 3.67
KDM5DQ9BY66 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC37.96■■■■□ 3.67
KDM5DQ9BY66 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC37.96■■■■□ 3.67
KDM5DQ9BY66 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.95■■■■□ 3.67
KDM5DQ9BY66 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC37.95■■■■□ 3.67
KDM5DQ9BY66 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
KDM5DQ9BY66 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.95■■■■□ 3.67
KDM5DQ9BY66 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
KDM5DQ9BY66 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC37.94■■■■□ 3.66
KDM5DQ9BY66 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC37.94■■■■□ 3.66
KDM5DQ9BY66 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC37.94■■■■□ 3.66
KDM5DQ9BY66 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.94■■■■□ 3.66
KDM5DQ9BY66 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
KDM5DQ9BY66 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
KDM5DQ9BY66 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
KDM5DQ9BY66 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
KDM5DQ9BY66 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
KDM5DQ9BY66 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC37.93■■■■□ 3.66
KDM5DQ9BY66 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC37.92■■■■□ 3.66
KDM5DQ9BY66 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC37.92■■■■□ 3.66
KDM5DQ9BY66 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
KDM5DQ9BY66 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
KDM5DQ9BY66 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
KDM5DQ9BY66 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.91■■■■□ 3.66
KDM5DQ9BY66 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
KDM5DQ9BY66 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC37.89■■■■□ 3.66
KDM5DQ9BY66 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC37.89■■■■□ 3.66
KDM5DQ9BY66 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
KDM5DQ9BY66 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
KDM5DQ9BY66 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.2 ms