Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSR8

YIPF4, Protein YIPF4, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YIPF4Q9BSR8 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
YIPF4Q9BSR8 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
YIPF4Q9BSR8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
YIPF4Q9BSR8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
YIPF4Q9BSR8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
YIPF4Q9BSR8 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
YIPF4Q9BSR8 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
YIPF4Q9BSR8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
YIPF4Q9BSR8 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
YIPF4Q9BSR8 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
YIPF4Q9BSR8 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
YIPF4Q9BSR8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
YIPF4Q9BSR8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
YIPF4Q9BSR8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
YIPF4Q9BSR8 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
YIPF4Q9BSR8 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
YIPF4Q9BSR8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
YIPF4Q9BSR8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
YIPF4Q9BSR8 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
YIPF4Q9BSR8 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
YIPF4Q9BSR8 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
YIPF4Q9BSR8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
YIPF4Q9BSR8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
YIPF4Q9BSR8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
YIPF4Q9BSR8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
YIPF4Q9BSR8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
YIPF4Q9BSR8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
YIPF4Q9BSR8 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
YIPF4Q9BSR8 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
YIPF4Q9BSR8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
YIPF4Q9BSR8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
YIPF4Q9BSR8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
YIPF4Q9BSR8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
YIPF4Q9BSR8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
YIPF4Q9BSR8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
YIPF4Q9BSR8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
YIPF4Q9BSR8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
YIPF4Q9BSR8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
YIPF4Q9BSR8 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
YIPF4Q9BSR8 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
YIPF4Q9BSR8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
YIPF4Q9BSR8 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
YIPF4Q9BSR8 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
YIPF4Q9BSR8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
YIPF4Q9BSR8 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
YIPF4Q9BSR8 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
YIPF4Q9BSR8 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
YIPF4Q9BSR8 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
YIPF4Q9BSR8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
YIPF4Q9BSR8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
YIPF4Q9BSR8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
YIPF4Q9BSR8 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
YIPF4Q9BSR8 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
YIPF4Q9BSR8 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
YIPF4Q9BSR8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
YIPF4Q9BSR8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
YIPF4Q9BSR8 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
YIPF4Q9BSR8 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
YIPF4Q9BSR8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
YIPF4Q9BSR8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
YIPF4Q9BSR8 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
YIPF4Q9BSR8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
YIPF4Q9BSR8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
YIPF4Q9BSR8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
YIPF4Q9BSR8 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
YIPF4Q9BSR8 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
YIPF4Q9BSR8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
YIPF4Q9BSR8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
YIPF4Q9BSR8 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
YIPF4Q9BSR8 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
YIPF4Q9BSR8 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
YIPF4Q9BSR8 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
YIPF4Q9BSR8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
YIPF4Q9BSR8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
YIPF4Q9BSR8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
YIPF4Q9BSR8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
YIPF4Q9BSR8 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
YIPF4Q9BSR8 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
YIPF4Q9BSR8 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
YIPF4Q9BSR8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
YIPF4Q9BSR8 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
YIPF4Q9BSR8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
YIPF4Q9BSR8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
YIPF4Q9BSR8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
YIPF4Q9BSR8 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
YIPF4Q9BSR8 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
YIPF4Q9BSR8 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
YIPF4Q9BSR8 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
YIPF4Q9BSR8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
YIPF4Q9BSR8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
YIPF4Q9BSR8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
YIPF4Q9BSR8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
YIPF4Q9BSR8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
YIPF4Q9BSR8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
YIPF4Q9BSR8 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
YIPF4Q9BSR8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
YIPF4Q9BSR8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
YIPF4Q9BSR8 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
YIPF4Q9BSR8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
YIPF4Q9BSR8 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms