Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRN9

TM2D3, TM2 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM2D3Q9BRN9 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TM2D3Q9BRN9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TM2D3Q9BRN9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TM2D3Q9BRN9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TM2D3Q9BRN9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TM2D3Q9BRN9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TM2D3Q9BRN9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TM2D3Q9BRN9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TM2D3Q9BRN9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TM2D3Q9BRN9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TM2D3Q9BRN9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TM2D3Q9BRN9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TM2D3Q9BRN9 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TM2D3Q9BRN9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TM2D3Q9BRN9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TM2D3Q9BRN9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TM2D3Q9BRN9 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TM2D3Q9BRN9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TM2D3Q9BRN9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TM2D3Q9BRN9 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TM2D3Q9BRN9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TM2D3Q9BRN9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TM2D3Q9BRN9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TM2D3Q9BRN9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TM2D3Q9BRN9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TM2D3Q9BRN9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TM2D3Q9BRN9 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TM2D3Q9BRN9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TM2D3Q9BRN9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TM2D3Q9BRN9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TM2D3Q9BRN9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TM2D3Q9BRN9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TM2D3Q9BRN9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TM2D3Q9BRN9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TM2D3Q9BRN9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TM2D3Q9BRN9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TM2D3Q9BRN9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TM2D3Q9BRN9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TM2D3Q9BRN9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TM2D3Q9BRN9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TM2D3Q9BRN9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TM2D3Q9BRN9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TM2D3Q9BRN9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TM2D3Q9BRN9 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TM2D3Q9BRN9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TM2D3Q9BRN9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TM2D3Q9BRN9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TM2D3Q9BRN9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TM2D3Q9BRN9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TM2D3Q9BRN9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TM2D3Q9BRN9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TM2D3Q9BRN9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TM2D3Q9BRN9 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TM2D3Q9BRN9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TM2D3Q9BRN9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TM2D3Q9BRN9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TM2D3Q9BRN9 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TM2D3Q9BRN9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TM2D3Q9BRN9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TM2D3Q9BRN9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TM2D3Q9BRN9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TM2D3Q9BRN9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TM2D3Q9BRN9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TM2D3Q9BRN9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TM2D3Q9BRN9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TM2D3Q9BRN9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TM2D3Q9BRN9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TM2D3Q9BRN9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TM2D3Q9BRN9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TM2D3Q9BRN9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TM2D3Q9BRN9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TM2D3Q9BRN9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TM2D3Q9BRN9 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TM2D3Q9BRN9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TM2D3Q9BRN9 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TM2D3Q9BRN9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TM2D3Q9BRN9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TM2D3Q9BRN9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TM2D3Q9BRN9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TM2D3Q9BRN9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TM2D3Q9BRN9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TM2D3Q9BRN9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TM2D3Q9BRN9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TM2D3Q9BRN9 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TM2D3Q9BRN9 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TM2D3Q9BRN9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TM2D3Q9BRN9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TM2D3Q9BRN9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TM2D3Q9BRN9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TM2D3Q9BRN9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TM2D3Q9BRN9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TM2D3Q9BRN9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TM2D3Q9BRN9 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TM2D3Q9BRN9 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TM2D3Q9BRN9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TM2D3Q9BRN9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TM2D3Q9BRN9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TM2D3Q9BRN9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TM2D3Q9BRN9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TM2D3Q9BRN9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms