Protein–RNA interactions for Protein: Q96S16

JMJD8, JmjC domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JMJD8Q96S16 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
JMJD8Q96S16 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
JMJD8Q96S16 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
JMJD8Q96S16 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
JMJD8Q96S16 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
JMJD8Q96S16 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
JMJD8Q96S16 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
JMJD8Q96S16 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
JMJD8Q96S16 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
JMJD8Q96S16 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
JMJD8Q96S16 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
JMJD8Q96S16 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
JMJD8Q96S16 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
JMJD8Q96S16 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
JMJD8Q96S16 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
JMJD8Q96S16 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
JMJD8Q96S16 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
JMJD8Q96S16 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
JMJD8Q96S16 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
JMJD8Q96S16 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
JMJD8Q96S16 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
JMJD8Q96S16 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
JMJD8Q96S16 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
JMJD8Q96S16 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
JMJD8Q96S16 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
JMJD8Q96S16 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
JMJD8Q96S16 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
JMJD8Q96S16 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
JMJD8Q96S16 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
JMJD8Q96S16 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
JMJD8Q96S16 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
JMJD8Q96S16 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
JMJD8Q96S16 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
JMJD8Q96S16 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
JMJD8Q96S16 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
JMJD8Q96S16 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
JMJD8Q96S16 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
JMJD8Q96S16 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
JMJD8Q96S16 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
JMJD8Q96S16 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
JMJD8Q96S16 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
JMJD8Q96S16 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
JMJD8Q96S16 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
JMJD8Q96S16 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
JMJD8Q96S16 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
JMJD8Q96S16 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
JMJD8Q96S16 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
JMJD8Q96S16 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
JMJD8Q96S16 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
JMJD8Q96S16 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
JMJD8Q96S16 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
JMJD8Q96S16 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
JMJD8Q96S16 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
JMJD8Q96S16 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
JMJD8Q96S16 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
JMJD8Q96S16 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
JMJD8Q96S16 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
JMJD8Q96S16 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
JMJD8Q96S16 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
JMJD8Q96S16 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
JMJD8Q96S16 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
JMJD8Q96S16 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
JMJD8Q96S16 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
JMJD8Q96S16 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
JMJD8Q96S16 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
JMJD8Q96S16 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
JMJD8Q96S16 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
JMJD8Q96S16 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
JMJD8Q96S16 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
JMJD8Q96S16 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
JMJD8Q96S16 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
JMJD8Q96S16 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
JMJD8Q96S16 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
JMJD8Q96S16 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
JMJD8Q96S16 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
JMJD8Q96S16 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
JMJD8Q96S16 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
JMJD8Q96S16 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
JMJD8Q96S16 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
JMJD8Q96S16 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
JMJD8Q96S16 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
JMJD8Q96S16 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
JMJD8Q96S16 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
JMJD8Q96S16 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
JMJD8Q96S16 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
JMJD8Q96S16 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
JMJD8Q96S16 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
JMJD8Q96S16 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
JMJD8Q96S16 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
JMJD8Q96S16 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
JMJD8Q96S16 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
JMJD8Q96S16 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
JMJD8Q96S16 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
JMJD8Q96S16 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
JMJD8Q96S16 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
JMJD8Q96S16 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
JMJD8Q96S16 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
JMJD8Q96S16 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
JMJD8Q96S16 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
JMJD8Q96S16 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.5 ms