Protein–RNA interactions for Protein: Q96QE5

TEFM, Transcription elongation factor, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TEFMQ96QE5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TEFMQ96QE5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TEFMQ96QE5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TEFMQ96QE5 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TEFMQ96QE5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TEFMQ96QE5 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TEFMQ96QE5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TEFMQ96QE5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TEFMQ96QE5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TEFMQ96QE5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TEFMQ96QE5 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TEFMQ96QE5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TEFMQ96QE5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TEFMQ96QE5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TEFMQ96QE5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TEFMQ96QE5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TEFMQ96QE5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TEFMQ96QE5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TEFMQ96QE5 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TEFMQ96QE5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TEFMQ96QE5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TEFMQ96QE5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TEFMQ96QE5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TEFMQ96QE5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TEFMQ96QE5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TEFMQ96QE5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TEFMQ96QE5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TEFMQ96QE5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TEFMQ96QE5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TEFMQ96QE5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TEFMQ96QE5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TEFMQ96QE5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TEFMQ96QE5 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TEFMQ96QE5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TEFMQ96QE5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TEFMQ96QE5 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TEFMQ96QE5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TEFMQ96QE5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TEFMQ96QE5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TEFMQ96QE5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TEFMQ96QE5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TEFMQ96QE5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TEFMQ96QE5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TEFMQ96QE5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TEFMQ96QE5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TEFMQ96QE5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TEFMQ96QE5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TEFMQ96QE5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TEFMQ96QE5 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TEFMQ96QE5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TEFMQ96QE5 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TEFMQ96QE5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TEFMQ96QE5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TEFMQ96QE5 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TEFMQ96QE5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TEFMQ96QE5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TEFMQ96QE5 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TEFMQ96QE5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TEFMQ96QE5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TEFMQ96QE5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TEFMQ96QE5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TEFMQ96QE5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TEFMQ96QE5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TEFMQ96QE5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TEFMQ96QE5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TEFMQ96QE5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TEFMQ96QE5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TEFMQ96QE5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TEFMQ96QE5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TEFMQ96QE5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TEFMQ96QE5 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TEFMQ96QE5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TEFMQ96QE5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TEFMQ96QE5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TEFMQ96QE5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TEFMQ96QE5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TEFMQ96QE5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TEFMQ96QE5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TEFMQ96QE5 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TEFMQ96QE5 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TEFMQ96QE5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TEFMQ96QE5 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TEFMQ96QE5 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TEFMQ96QE5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TEFMQ96QE5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TEFMQ96QE5 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TEFMQ96QE5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TEFMQ96QE5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TEFMQ96QE5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TEFMQ96QE5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TEFMQ96QE5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TEFMQ96QE5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TEFMQ96QE5 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TEFMQ96QE5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TEFMQ96QE5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TEFMQ96QE5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TEFMQ96QE5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TEFMQ96QE5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TEFMQ96QE5 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TEFMQ96QE5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms