Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV0

SYNGAP1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGAP1Q96PV0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SYNGAP1Q96PV0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SYNGAP1Q96PV0 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SYNGAP1Q96PV0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SYNGAP1Q96PV0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SYNGAP1Q96PV0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SYNGAP1Q96PV0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SYNGAP1Q96PV0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SYNGAP1Q96PV0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SYNGAP1Q96PV0 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SYNGAP1Q96PV0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SYNGAP1Q96PV0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SYNGAP1Q96PV0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SYNGAP1Q96PV0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
SYNGAP1Q96PV0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SYNGAP1Q96PV0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SYNGAP1Q96PV0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SYNGAP1Q96PV0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
SYNGAP1Q96PV0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SYNGAP1Q96PV0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SYNGAP1Q96PV0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SYNGAP1Q96PV0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SYNGAP1Q96PV0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SYNGAP1Q96PV0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SYNGAP1Q96PV0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SYNGAP1Q96PV0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SYNGAP1Q96PV0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SYNGAP1Q96PV0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SYNGAP1Q96PV0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
SYNGAP1Q96PV0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SYNGAP1Q96PV0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SYNGAP1Q96PV0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SYNGAP1Q96PV0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SYNGAP1Q96PV0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SYNGAP1Q96PV0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SYNGAP1Q96PV0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
SYNGAP1Q96PV0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SYNGAP1Q96PV0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SYNGAP1Q96PV0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SYNGAP1Q96PV0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SYNGAP1Q96PV0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
SYNGAP1Q96PV0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
SYNGAP1Q96PV0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC29■■■□□ 2.23
SYNGAP1Q96PV0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
SYNGAP1Q96PV0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SYNGAP1Q96PV0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SYNGAP1Q96PV0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SYNGAP1Q96PV0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SYNGAP1Q96PV0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SYNGAP1Q96PV0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SYNGAP1Q96PV0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SYNGAP1Q96PV0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SYNGAP1Q96PV0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SYNGAP1Q96PV0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
SYNGAP1Q96PV0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SYNGAP1Q96PV0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SYNGAP1Q96PV0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SYNGAP1Q96PV0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SYNGAP1Q96PV0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SYNGAP1Q96PV0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SYNGAP1Q96PV0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SYNGAP1Q96PV0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SYNGAP1Q96PV0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
SYNGAP1Q96PV0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SYNGAP1Q96PV0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SYNGAP1Q96PV0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SYNGAP1Q96PV0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SYNGAP1Q96PV0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SYNGAP1Q96PV0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SYNGAP1Q96PV0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SYNGAP1Q96PV0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SYNGAP1Q96PV0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SYNGAP1Q96PV0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SYNGAP1Q96PV0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SYNGAP1Q96PV0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SYNGAP1Q96PV0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
SYNGAP1Q96PV0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SYNGAP1Q96PV0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
SYNGAP1Q96PV0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
SYNGAP1Q96PV0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
SYNGAP1Q96PV0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
SYNGAP1Q96PV0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
SYNGAP1Q96PV0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SYNGAP1Q96PV0 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SYNGAP1Q96PV0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SYNGAP1Q96PV0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SYNGAP1Q96PV0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SYNGAP1Q96PV0 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SYNGAP1Q96PV0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SYNGAP1Q96PV0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SYNGAP1Q96PV0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
SYNGAP1Q96PV0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SYNGAP1Q96PV0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SYNGAP1Q96PV0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SYNGAP1Q96PV0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SYNGAP1Q96PV0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
SYNGAP1Q96PV0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SYNGAP1Q96PV0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SYNGAP1Q96PV0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
SYNGAP1Q96PV0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms