Protein–RNA interactions for Protein: Q96LP6

C12orf42, Uncharacterized protein C12orf42, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf42Q96LP6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
C12orf42Q96LP6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
C12orf42Q96LP6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
C12orf42Q96LP6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
C12orf42Q96LP6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
C12orf42Q96LP6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
C12orf42Q96LP6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
C12orf42Q96LP6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
C12orf42Q96LP6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
C12orf42Q96LP6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
C12orf42Q96LP6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
C12orf42Q96LP6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
C12orf42Q96LP6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
C12orf42Q96LP6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
C12orf42Q96LP6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
C12orf42Q96LP6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
C12orf42Q96LP6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
C12orf42Q96LP6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
C12orf42Q96LP6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
C12orf42Q96LP6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
C12orf42Q96LP6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
C12orf42Q96LP6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
C12orf42Q96LP6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
C12orf42Q96LP6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
C12orf42Q96LP6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
C12orf42Q96LP6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
C12orf42Q96LP6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
C12orf42Q96LP6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
C12orf42Q96LP6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
C12orf42Q96LP6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
C12orf42Q96LP6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
C12orf42Q96LP6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
C12orf42Q96LP6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
C12orf42Q96LP6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
C12orf42Q96LP6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
C12orf42Q96LP6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
C12orf42Q96LP6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
C12orf42Q96LP6 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
C12orf42Q96LP6 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
C12orf42Q96LP6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
C12orf42Q96LP6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
C12orf42Q96LP6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
C12orf42Q96LP6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
C12orf42Q96LP6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
C12orf42Q96LP6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
C12orf42Q96LP6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
C12orf42Q96LP6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
C12orf42Q96LP6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
C12orf42Q96LP6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
C12orf42Q96LP6 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
C12orf42Q96LP6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
C12orf42Q96LP6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
C12orf42Q96LP6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
C12orf42Q96LP6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
C12orf42Q96LP6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
C12orf42Q96LP6 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
C12orf42Q96LP6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
C12orf42Q96LP6 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
C12orf42Q96LP6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
C12orf42Q96LP6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
C12orf42Q96LP6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
C12orf42Q96LP6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
C12orf42Q96LP6 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
C12orf42Q96LP6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
C12orf42Q96LP6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
C12orf42Q96LP6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
C12orf42Q96LP6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
C12orf42Q96LP6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
C12orf42Q96LP6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
C12orf42Q96LP6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
C12orf42Q96LP6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
C12orf42Q96LP6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
C12orf42Q96LP6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
C12orf42Q96LP6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
C12orf42Q96LP6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
C12orf42Q96LP6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
C12orf42Q96LP6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
C12orf42Q96LP6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
C12orf42Q96LP6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
C12orf42Q96LP6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
C12orf42Q96LP6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
C12orf42Q96LP6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
C12orf42Q96LP6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
C12orf42Q96LP6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
C12orf42Q96LP6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
C12orf42Q96LP6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
C12orf42Q96LP6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
C12orf42Q96LP6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
C12orf42Q96LP6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
C12orf42Q96LP6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
C12orf42Q96LP6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
C12orf42Q96LP6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
C12orf42Q96LP6 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
C12orf42Q96LP6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
C12orf42Q96LP6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
C12orf42Q96LP6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
C12orf42Q96LP6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
C12orf42Q96LP6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
C12orf42Q96LP6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
C12orf42Q96LP6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms