Protein–RNA interactions for Protein: Q96JA1

LRIG1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG1Q96JA1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRIG1Q96JA1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRIG1Q96JA1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
LRIG1Q96JA1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRIG1Q96JA1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRIG1Q96JA1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRIG1Q96JA1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRIG1Q96JA1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRIG1Q96JA1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRIG1Q96JA1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRIG1Q96JA1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRIG1Q96JA1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRIG1Q96JA1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRIG1Q96JA1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRIG1Q96JA1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRIG1Q96JA1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRIG1Q96JA1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRIG1Q96JA1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LRIG1Q96JA1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LRIG1Q96JA1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LRIG1Q96JA1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LRIG1Q96JA1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRIG1Q96JA1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRIG1Q96JA1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRIG1Q96JA1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRIG1Q96JA1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRIG1Q96JA1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRIG1Q96JA1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRIG1Q96JA1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRIG1Q96JA1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
LRIG1Q96JA1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRIG1Q96JA1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRIG1Q96JA1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRIG1Q96JA1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRIG1Q96JA1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
LRIG1Q96JA1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRIG1Q96JA1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRIG1Q96JA1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRIG1Q96JA1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRIG1Q96JA1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRIG1Q96JA1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRIG1Q96JA1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRIG1Q96JA1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRIG1Q96JA1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRIG1Q96JA1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRIG1Q96JA1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRIG1Q96JA1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRIG1Q96JA1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRIG1Q96JA1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRIG1Q96JA1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRIG1Q96JA1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRIG1Q96JA1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRIG1Q96JA1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRIG1Q96JA1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRIG1Q96JA1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRIG1Q96JA1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRIG1Q96JA1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRIG1Q96JA1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRIG1Q96JA1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRIG1Q96JA1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRIG1Q96JA1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRIG1Q96JA1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRIG1Q96JA1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRIG1Q96JA1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRIG1Q96JA1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRIG1Q96JA1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRIG1Q96JA1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRIG1Q96JA1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRIG1Q96JA1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRIG1Q96JA1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRIG1Q96JA1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
LRIG1Q96JA1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRIG1Q96JA1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRIG1Q96JA1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRIG1Q96JA1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRIG1Q96JA1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRIG1Q96JA1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRIG1Q96JA1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRIG1Q96JA1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
LRIG1Q96JA1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRIG1Q96JA1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRIG1Q96JA1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRIG1Q96JA1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRIG1Q96JA1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRIG1Q96JA1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRIG1Q96JA1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRIG1Q96JA1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRIG1Q96JA1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRIG1Q96JA1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRIG1Q96JA1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRIG1Q96JA1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRIG1Q96JA1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRIG1Q96JA1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRIG1Q96JA1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRIG1Q96JA1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRIG1Q96JA1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
LRIG1Q96JA1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
LRIG1Q96JA1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRIG1Q96JA1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRIG1Q96JA1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms