Protein–RNA interactions for Protein: Q96H12

MSANTD3, Myb/SANT-like DNA-binding domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSANTD3Q96H12 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MSANTD3Q96H12 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MSANTD3Q96H12 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MSANTD3Q96H12 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
MSANTD3Q96H12 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MSANTD3Q96H12 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MSANTD3Q96H12 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MSANTD3Q96H12 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
MSANTD3Q96H12 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MSANTD3Q96H12 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MSANTD3Q96H12 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MSANTD3Q96H12 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MSANTD3Q96H12 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MSANTD3Q96H12 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MSANTD3Q96H12 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
MSANTD3Q96H12 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MSANTD3Q96H12 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MSANTD3Q96H12 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MSANTD3Q96H12 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MSANTD3Q96H12 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MSANTD3Q96H12 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MSANTD3Q96H12 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MSANTD3Q96H12 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MSANTD3Q96H12 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MSANTD3Q96H12 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MSANTD3Q96H12 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MSANTD3Q96H12 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MSANTD3Q96H12 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MSANTD3Q96H12 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MSANTD3Q96H12 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MSANTD3Q96H12 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MSANTD3Q96H12 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MSANTD3Q96H12 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MSANTD3Q96H12 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
MSANTD3Q96H12 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MSANTD3Q96H12 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MSANTD3Q96H12 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MSANTD3Q96H12 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MSANTD3Q96H12 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MSANTD3Q96H12 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
MSANTD3Q96H12 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26■■□□□ 1.75
MSANTD3Q96H12 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MSANTD3Q96H12 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
MSANTD3Q96H12 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MSANTD3Q96H12 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MSANTD3Q96H12 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MSANTD3Q96H12 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MSANTD3Q96H12 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MSANTD3Q96H12 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MSANTD3Q96H12 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MSANTD3Q96H12 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MSANTD3Q96H12 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MSANTD3Q96H12 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MSANTD3Q96H12 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MSANTD3Q96H12 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
MSANTD3Q96H12 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MSANTD3Q96H12 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MSANTD3Q96H12 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MSANTD3Q96H12 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MSANTD3Q96H12 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MSANTD3Q96H12 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MSANTD3Q96H12 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MSANTD3Q96H12 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MSANTD3Q96H12 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MSANTD3Q96H12 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MSANTD3Q96H12 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MSANTD3Q96H12 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MSANTD3Q96H12 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MSANTD3Q96H12 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
MSANTD3Q96H12 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MSANTD3Q96H12 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MSANTD3Q96H12 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MSANTD3Q96H12 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MSANTD3Q96H12 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MSANTD3Q96H12 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MSANTD3Q96H12 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MSANTD3Q96H12 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MSANTD3Q96H12 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MSANTD3Q96H12 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MSANTD3Q96H12 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MSANTD3Q96H12 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MSANTD3Q96H12 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MSANTD3Q96H12 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
MSANTD3Q96H12 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MSANTD3Q96H12 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MSANTD3Q96H12 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MSANTD3Q96H12 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MSANTD3Q96H12 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
MSANTD3Q96H12 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MSANTD3Q96H12 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MSANTD3Q96H12 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MSANTD3Q96H12 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MSANTD3Q96H12 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MSANTD3Q96H12 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MSANTD3Q96H12 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MSANTD3Q96H12 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MSANTD3Q96H12 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MSANTD3Q96H12 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MSANTD3Q96H12 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MSANTD3Q96H12 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms