Protein–RNA interactions for Protein: Q969P6

TOP1MT, DNA topoisomerase I, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1MTQ969P6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TOP1MTQ969P6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
TOP1MTQ969P6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TOP1MTQ969P6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TOP1MTQ969P6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TOP1MTQ969P6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
TOP1MTQ969P6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TOP1MTQ969P6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TOP1MTQ969P6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TOP1MTQ969P6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TOP1MTQ969P6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TOP1MTQ969P6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TOP1MTQ969P6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TOP1MTQ969P6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TOP1MTQ969P6 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TOP1MTQ969P6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TOP1MTQ969P6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TOP1MTQ969P6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TOP1MTQ969P6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TOP1MTQ969P6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TOP1MTQ969P6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TOP1MTQ969P6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TOP1MTQ969P6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TOP1MTQ969P6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TOP1MTQ969P6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TOP1MTQ969P6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
TOP1MTQ969P6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TOP1MTQ969P6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TOP1MTQ969P6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TOP1MTQ969P6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
TOP1MTQ969P6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TOP1MTQ969P6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TOP1MTQ969P6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
TOP1MTQ969P6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TOP1MTQ969P6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TOP1MTQ969P6 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TOP1MTQ969P6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TOP1MTQ969P6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TOP1MTQ969P6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TOP1MTQ969P6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TOP1MTQ969P6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TOP1MTQ969P6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TOP1MTQ969P6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TOP1MTQ969P6 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TOP1MTQ969P6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TOP1MTQ969P6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TOP1MTQ969P6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
TOP1MTQ969P6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TOP1MTQ969P6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TOP1MTQ969P6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TOP1MTQ969P6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TOP1MTQ969P6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
TOP1MTQ969P6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TOP1MTQ969P6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
TOP1MTQ969P6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TOP1MTQ969P6 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TOP1MTQ969P6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TOP1MTQ969P6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TOP1MTQ969P6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TOP1MTQ969P6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TOP1MTQ969P6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TOP1MTQ969P6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TOP1MTQ969P6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TOP1MTQ969P6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
TOP1MTQ969P6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TOP1MTQ969P6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TOP1MTQ969P6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TOP1MTQ969P6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TOP1MTQ969P6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TOP1MTQ969P6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TOP1MTQ969P6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TOP1MTQ969P6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TOP1MTQ969P6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TOP1MTQ969P6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TOP1MTQ969P6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TOP1MTQ969P6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TOP1MTQ969P6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TOP1MTQ969P6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TOP1MTQ969P6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
TOP1MTQ969P6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TOP1MTQ969P6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TOP1MTQ969P6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TOP1MTQ969P6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TOP1MTQ969P6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
TOP1MTQ969P6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TOP1MTQ969P6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TOP1MTQ969P6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
TOP1MTQ969P6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
TOP1MTQ969P6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TOP1MTQ969P6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TOP1MTQ969P6 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TOP1MTQ969P6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TOP1MTQ969P6 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
TOP1MTQ969P6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TOP1MTQ969P6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TOP1MTQ969P6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TOP1MTQ969P6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TOP1MTQ969P6 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TOP1MTQ969P6 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TOP1MTQ969P6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms