Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXI9

GATAD2B, Transcriptional repressor p66-beta, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATAD2BQ8WXI9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GATAD2BQ8WXI9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GATAD2BQ8WXI9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GATAD2BQ8WXI9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GATAD2BQ8WXI9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GATAD2BQ8WXI9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GATAD2BQ8WXI9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GATAD2BQ8WXI9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GATAD2BQ8WXI9 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GATAD2BQ8WXI9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GATAD2BQ8WXI9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GATAD2BQ8WXI9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GATAD2BQ8WXI9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GATAD2BQ8WXI9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GATAD2BQ8WXI9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GATAD2BQ8WXI9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GATAD2BQ8WXI9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GATAD2BQ8WXI9 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GATAD2BQ8WXI9 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GATAD2BQ8WXI9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GATAD2BQ8WXI9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GATAD2BQ8WXI9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GATAD2BQ8WXI9 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GATAD2BQ8WXI9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GATAD2BQ8WXI9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GATAD2BQ8WXI9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GATAD2BQ8WXI9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GATAD2BQ8WXI9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GATAD2BQ8WXI9 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GATAD2BQ8WXI9 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GATAD2BQ8WXI9 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GATAD2BQ8WXI9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GATAD2BQ8WXI9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GATAD2BQ8WXI9 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GATAD2BQ8WXI9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GATAD2BQ8WXI9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GATAD2BQ8WXI9 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GATAD2BQ8WXI9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GATAD2BQ8WXI9 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GATAD2BQ8WXI9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GATAD2BQ8WXI9 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GATAD2BQ8WXI9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GATAD2BQ8WXI9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GATAD2BQ8WXI9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GATAD2BQ8WXI9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GATAD2BQ8WXI9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GATAD2BQ8WXI9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GATAD2BQ8WXI9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GATAD2BQ8WXI9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GATAD2BQ8WXI9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GATAD2BQ8WXI9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GATAD2BQ8WXI9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GATAD2BQ8WXI9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GATAD2BQ8WXI9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GATAD2BQ8WXI9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GATAD2BQ8WXI9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GATAD2BQ8WXI9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GATAD2BQ8WXI9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GATAD2BQ8WXI9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GATAD2BQ8WXI9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GATAD2BQ8WXI9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GATAD2BQ8WXI9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GATAD2BQ8WXI9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GATAD2BQ8WXI9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GATAD2BQ8WXI9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GATAD2BQ8WXI9 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GATAD2BQ8WXI9 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GATAD2BQ8WXI9 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GATAD2BQ8WXI9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GATAD2BQ8WXI9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GATAD2BQ8WXI9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GATAD2BQ8WXI9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GATAD2BQ8WXI9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GATAD2BQ8WXI9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GATAD2BQ8WXI9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GATAD2BQ8WXI9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GATAD2BQ8WXI9 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
GATAD2BQ8WXI9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GATAD2BQ8WXI9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GATAD2BQ8WXI9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GATAD2BQ8WXI9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
GATAD2BQ8WXI9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GATAD2BQ8WXI9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GATAD2BQ8WXI9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GATAD2BQ8WXI9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GATAD2BQ8WXI9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GATAD2BQ8WXI9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GATAD2BQ8WXI9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GATAD2BQ8WXI9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GATAD2BQ8WXI9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GATAD2BQ8WXI9 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GATAD2BQ8WXI9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GATAD2BQ8WXI9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GATAD2BQ8WXI9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GATAD2BQ8WXI9 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GATAD2BQ8WXI9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GATAD2BQ8WXI9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GATAD2BQ8WXI9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GATAD2BQ8WXI9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GATAD2BQ8WXI9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms