Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV9

RHOXF1, Rhox homeobox family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF1Q8NHV9 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RHOXF1Q8NHV9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RHOXF1Q8NHV9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
RHOXF1Q8NHV9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RHOXF1Q8NHV9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RHOXF1Q8NHV9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RHOXF1Q8NHV9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RHOXF1Q8NHV9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RHOXF1Q8NHV9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RHOXF1Q8NHV9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RHOXF1Q8NHV9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RHOXF1Q8NHV9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RHOXF1Q8NHV9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RHOXF1Q8NHV9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RHOXF1Q8NHV9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RHOXF1Q8NHV9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RHOXF1Q8NHV9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RHOXF1Q8NHV9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RHOXF1Q8NHV9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RHOXF1Q8NHV9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RHOXF1Q8NHV9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RHOXF1Q8NHV9 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RHOXF1Q8NHV9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RHOXF1Q8NHV9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RHOXF1Q8NHV9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RHOXF1Q8NHV9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RHOXF1Q8NHV9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RHOXF1Q8NHV9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RHOXF1Q8NHV9 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RHOXF1Q8NHV9 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RHOXF1Q8NHV9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RHOXF1Q8NHV9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RHOXF1Q8NHV9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RHOXF1Q8NHV9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RHOXF1Q8NHV9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RHOXF1Q8NHV9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RHOXF1Q8NHV9 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RHOXF1Q8NHV9 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RHOXF1Q8NHV9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RHOXF1Q8NHV9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RHOXF1Q8NHV9 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RHOXF1Q8NHV9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RHOXF1Q8NHV9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RHOXF1Q8NHV9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RHOXF1Q8NHV9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RHOXF1Q8NHV9 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RHOXF1Q8NHV9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RHOXF1Q8NHV9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RHOXF1Q8NHV9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RHOXF1Q8NHV9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RHOXF1Q8NHV9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RHOXF1Q8NHV9 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RHOXF1Q8NHV9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RHOXF1Q8NHV9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RHOXF1Q8NHV9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RHOXF1Q8NHV9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RHOXF1Q8NHV9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RHOXF1Q8NHV9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RHOXF1Q8NHV9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RHOXF1Q8NHV9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RHOXF1Q8NHV9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RHOXF1Q8NHV9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RHOXF1Q8NHV9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RHOXF1Q8NHV9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RHOXF1Q8NHV9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RHOXF1Q8NHV9 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RHOXF1Q8NHV9 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RHOXF1Q8NHV9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RHOXF1Q8NHV9 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RHOXF1Q8NHV9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RHOXF1Q8NHV9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RHOXF1Q8NHV9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RHOXF1Q8NHV9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RHOXF1Q8NHV9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RHOXF1Q8NHV9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RHOXF1Q8NHV9 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RHOXF1Q8NHV9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RHOXF1Q8NHV9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RHOXF1Q8NHV9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RHOXF1Q8NHV9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RHOXF1Q8NHV9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RHOXF1Q8NHV9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RHOXF1Q8NHV9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RHOXF1Q8NHV9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RHOXF1Q8NHV9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RHOXF1Q8NHV9 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RHOXF1Q8NHV9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RHOXF1Q8NHV9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RHOXF1Q8NHV9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RHOXF1Q8NHV9 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RHOXF1Q8NHV9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RHOXF1Q8NHV9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RHOXF1Q8NHV9 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RHOXF1Q8NHV9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RHOXF1Q8NHV9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RHOXF1Q8NHV9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RHOXF1Q8NHV9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RHOXF1Q8NHV9 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RHOXF1Q8NHV9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RHOXF1Q8NHV9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms