Protein–RNA interactions for Protein: Q8NC01

CLEC1A, C-type lectin domain family 1 member A, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC1AQ8NC01 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLEC1AQ8NC01 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLEC1AQ8NC01 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLEC1AQ8NC01 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLEC1AQ8NC01 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLEC1AQ8NC01 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLEC1AQ8NC01 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLEC1AQ8NC01 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLEC1AQ8NC01 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLEC1AQ8NC01 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLEC1AQ8NC01 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLEC1AQ8NC01 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLEC1AQ8NC01 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLEC1AQ8NC01 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLEC1AQ8NC01 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLEC1AQ8NC01 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLEC1AQ8NC01 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLEC1AQ8NC01 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CLEC1AQ8NC01 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CLEC1AQ8NC01 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLEC1AQ8NC01 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLEC1AQ8NC01 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLEC1AQ8NC01 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLEC1AQ8NC01 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLEC1AQ8NC01 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLEC1AQ8NC01 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLEC1AQ8NC01 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLEC1AQ8NC01 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLEC1AQ8NC01 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLEC1AQ8NC01 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLEC1AQ8NC01 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLEC1AQ8NC01 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLEC1AQ8NC01 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLEC1AQ8NC01 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLEC1AQ8NC01 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLEC1AQ8NC01 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLEC1AQ8NC01 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLEC1AQ8NC01 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CLEC1AQ8NC01 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLEC1AQ8NC01 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLEC1AQ8NC01 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLEC1AQ8NC01 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLEC1AQ8NC01 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLEC1AQ8NC01 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLEC1AQ8NC01 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLEC1AQ8NC01 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLEC1AQ8NC01 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CLEC1AQ8NC01 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CLEC1AQ8NC01 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CLEC1AQ8NC01 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLEC1AQ8NC01 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLEC1AQ8NC01 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLEC1AQ8NC01 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLEC1AQ8NC01 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLEC1AQ8NC01 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLEC1AQ8NC01 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CLEC1AQ8NC01 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLEC1AQ8NC01 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLEC1AQ8NC01 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLEC1AQ8NC01 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLEC1AQ8NC01 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLEC1AQ8NC01 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLEC1AQ8NC01 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLEC1AQ8NC01 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CLEC1AQ8NC01 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLEC1AQ8NC01 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLEC1AQ8NC01 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLEC1AQ8NC01 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLEC1AQ8NC01 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLEC1AQ8NC01 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CLEC1AQ8NC01 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLEC1AQ8NC01 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLEC1AQ8NC01 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLEC1AQ8NC01 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLEC1AQ8NC01 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLEC1AQ8NC01 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLEC1AQ8NC01 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CLEC1AQ8NC01 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLEC1AQ8NC01 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLEC1AQ8NC01 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLEC1AQ8NC01 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLEC1AQ8NC01 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CLEC1AQ8NC01 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CLEC1AQ8NC01 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLEC1AQ8NC01 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLEC1AQ8NC01 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLEC1AQ8NC01 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CLEC1AQ8NC01 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLEC1AQ8NC01 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLEC1AQ8NC01 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLEC1AQ8NC01 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLEC1AQ8NC01 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLEC1AQ8NC01 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLEC1AQ8NC01 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLEC1AQ8NC01 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLEC1AQ8NC01 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CLEC1AQ8NC01 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLEC1AQ8NC01 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLEC1AQ8NC01 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLEC1AQ8NC01 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms