Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF6

AVL9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AVL9Q8NBF6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
AVL9Q8NBF6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
AVL9Q8NBF6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
AVL9Q8NBF6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
AVL9Q8NBF6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
AVL9Q8NBF6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AVL9Q8NBF6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AVL9Q8NBF6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AVL9Q8NBF6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AVL9Q8NBF6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
AVL9Q8NBF6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
AVL9Q8NBF6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
AVL9Q8NBF6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
AVL9Q8NBF6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
AVL9Q8NBF6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
AVL9Q8NBF6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
AVL9Q8NBF6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
AVL9Q8NBF6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
AVL9Q8NBF6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
AVL9Q8NBF6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
AVL9Q8NBF6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
AVL9Q8NBF6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
AVL9Q8NBF6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
AVL9Q8NBF6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
AVL9Q8NBF6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
AVL9Q8NBF6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
AVL9Q8NBF6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
AVL9Q8NBF6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
AVL9Q8NBF6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
AVL9Q8NBF6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
AVL9Q8NBF6 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
AVL9Q8NBF6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
AVL9Q8NBF6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
AVL9Q8NBF6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
AVL9Q8NBF6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
AVL9Q8NBF6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
AVL9Q8NBF6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
AVL9Q8NBF6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
AVL9Q8NBF6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
AVL9Q8NBF6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
AVL9Q8NBF6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
AVL9Q8NBF6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
AVL9Q8NBF6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
AVL9Q8NBF6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
AVL9Q8NBF6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
AVL9Q8NBF6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
AVL9Q8NBF6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
AVL9Q8NBF6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
AVL9Q8NBF6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
AVL9Q8NBF6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
AVL9Q8NBF6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
AVL9Q8NBF6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
AVL9Q8NBF6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
AVL9Q8NBF6 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
AVL9Q8NBF6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
AVL9Q8NBF6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
AVL9Q8NBF6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
AVL9Q8NBF6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
AVL9Q8NBF6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
AVL9Q8NBF6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
AVL9Q8NBF6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
AVL9Q8NBF6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
AVL9Q8NBF6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
AVL9Q8NBF6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
AVL9Q8NBF6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
AVL9Q8NBF6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
AVL9Q8NBF6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
AVL9Q8NBF6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
AVL9Q8NBF6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
AVL9Q8NBF6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
AVL9Q8NBF6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
AVL9Q8NBF6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
AVL9Q8NBF6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
AVL9Q8NBF6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
AVL9Q8NBF6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
AVL9Q8NBF6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
AVL9Q8NBF6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
AVL9Q8NBF6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
AVL9Q8NBF6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
AVL9Q8NBF6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
AVL9Q8NBF6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
AVL9Q8NBF6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
AVL9Q8NBF6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
AVL9Q8NBF6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
AVL9Q8NBF6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
AVL9Q8NBF6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
AVL9Q8NBF6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AVL9Q8NBF6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
AVL9Q8NBF6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
AVL9Q8NBF6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
AVL9Q8NBF6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AVL9Q8NBF6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AVL9Q8NBF6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AVL9Q8NBF6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
AVL9Q8NBF6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
AVL9Q8NBF6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
AVL9Q8NBF6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
AVL9Q8NBF6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
AVL9Q8NBF6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
AVL9Q8NBF6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms